פרופסור לארכיאולוגיה, מופקד על הקתדרה לארכאולוגיה של ישראל בתקופת הברונזה והברזל ע"ש יעקב אלקוב. נחשב מרצה חשוב לארכאולוגיה של הלבנט והשלכותיה על הבנת התנ"ך.
פרופסור פינקלשטיין כיהן כראש מכון נדלר לארכאולוגיה וכראש החוג לארכאולוגיה, היה מרצה אורח באוניברסיטת הרווארד בארה"ב ובסורבון בפריז.