ההוראה והמחקר של 'ישראל הקדום' הם רב-תחומיים וכוללים נושאים דוגמת היסטוריה והיסטוריוגרפיה, משטר וחברה, מנהל וכלכלה, דת, יצירה ספרותית ותרבות חומרית בהקשרם הרחב. התוכנית מציעה לשחזר עם טובי החוקרים את המציאות הקדומה של תקופת המקרא, ולחקור את החברה, הדת, הכלכלה, המנהל והפולחן של עם ישראל ושל העמים השכנים לו באלף הראשון לפנה"ס.