פרופ' טובה מילוא נכללה ברשימת 54 הנשים הבולטות בתולדות מדעי המחשב
54 הנשים ובהן פרופ' מילוא, זכו להוקרה בכנס השנתי ע"ש גרייס הופר, המאגד אלפי נשים מעולמות הטכנולוגיה והמחשבים
"זה כבוד גדול", אומרת פרופ' מילוא, "להיות ברשימה אחת עם נשים שהיו המתכנתות הראשונות בעולם, עם זוכות רבות בפרס טיורינג (המקבילה של עולם המחשבים לפרס נובל), ועם כל הנשים שבאמת הטביעו חותם על תחום מדעי המחשב. הוחמאתי מאוד. בעיני תחום מדעי המחשב זה התחום הכי יפה שיש".
פרופ' טובה מילוא היא חברת האקדמיה למדעים האירופית - Academia Europaea, ועמיתה ב-ACM, האגודה המדעית החשובה ביותר בעולם בתחום המחשוב ומדעי המחשב. מילוא נבחרה בשנת 2012 לשמש כעמיתה באגודה, בזכות תרומתה בתחום תיאוריית בסיסי הנתונים וניהול תהליכים עסקיים. יחד עם פרופ' מילוא נכללה ברשימת הקלפים המכובדת ישראלית נוספת: שפרירה (שפי) גולדווסר, זוכת פרס טיורינג, המלמדת במכון ויצמן וב-MIT שבארצות-הברית.