היהודים והשומרונים היו שתי קבוצות האוכלוסייה המובהקות ביותר בארץ ישראל, שראו בארץ ישראל את ביתם ההיסטורי, הקימו בה מרכז דתי-פולחני והתמידו בישיבתם בה. הדמיון מצד אחד והתחרות מצד שני הובילו למערכת יחסים מורכבת ביניהם. בקורס נבחן את טיבה של מערכת היחסים הזו והתפתחותה מתקופת הבית השני עד לכיבוש המוסלמי. תשומת-לב מיוחדת תוקדש למעמדם ההילכתי של ה'כותים' [=השומרונים] וליחס היהודים כלפיהם, כעולה מן הספרות התלמודית.