הקורס מיועד לתלמידים מתקדמים המעוניינים לרכוש כלים בסיסיים של המחקר המיקרוסקופי ושימושיו המגוונים בארכיאולוגיה. חלקו הראשון של הקורס יוקדש ללימוד דיסציפלינות שונות במחקר הארכיאולוגי: מיקרומורפולוגיה של אתרים, פטרוגרפיה ארכיאולוגית, בדיקות סימני בליה ושימוש על מגוון של סוגי ממצאים וזיהוי חומרים שאינם נראים לעין הבלתי מזוינת תוך הבנת חלקם בקונטקסט הארכיאולוגי המתאים. כל אלו יוצגו בעזרת מקרי מבחן מייצגים. פרקי המבוא יכללו מבואות למיקרוסקופיה אופטית לסוגיה, העמקה ברקע התיאורטי והמעשי של כל שיטת מחקר ומעבדות מונחות ללימוד חומרים ארכיאולוגיים בכיתת המיקרוסקופים. בהמשך הקורס יערוך כל תלמיד מחקר מונחה על נושא המייצג דיסציפלינה מחקרית נבחרת תוך פנייה לספרות המתאימה, עבודה מעשית מצומצמת שתתבצע במעבדה למיקרוארכיאולוגיה השוואתית של המכון לארכיאולוגיה וכתיבת מאמר סמינרי מונחה. עקב מגבלות ציוד ומשאבי מעבדה תאושר הקבלה לקורס רק לאחר ראיון מקדים עם המרצה שייערך קודם למועדי הייעוץ וההרשמה ובמועד שיפורסם מראש.