| RNAi מכלי גנומי ועד לפיתוח דור חדש של תרופות (0452.3121) RNA INTERFERENCE: FROM A GENOMIC TOOL TO THERAPEUTIC INTERVENTION. |
| פרטי הקורס |
לסטודנטים ניתנת האפשרות לבחור בהכנת סמינר או בהגשת עבודה (כל המטלות – באנגלית). מטרת הקורס לחשוף את תלמידי המחקר לעולם החדש של הרנ"א. הקורס יסקור את התחום מגילוי התופעה בתולעים ועד לשימושים תרופתיים וניסוים פרקליניים וקליניים. נושאי הקורס: • גילוי תופעת השתקת הגנים בנמטודות. • הגילוי של השתקת גנים בתאים יונקים. • הקשר בין ריבוי גןת ביטוי חלבון ותפקיד החלבון. • הגילוי של מיקרו רנ"א ותפקידם בבקרת ביטוי גנים. • גילוי וולידציה של מטרות גנומיות חדשות באמצעות RNAi • היכולת להפוך כל מטרה לתרופה. • המחשול המרכזי של הפיכת RNAi למודל תרופתי חדש. • אסטרטגיות להתגבר על המחשולים השונים – השימוש בננו-טכנולוגיה. • סטימולציה של TLRs ע"י RNAi. • מודלים פרקלינים והשימוש ב – RNAi. • כיצד לנרמל ביטוי גנים במודל יה חולה ? • ניסויים קליניים – תמונת מצב. |
| מס תלמידים: 30 |
| דרישות קדם: : מבוא לביולוגיה של התא- חובה אימונולוגיה – רצוי. |
| הרכב ציון: Oral or written seminars in English will be given as the task for this course. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| אבולוציה של חברתיות בעולם החי (0431.4614) Social evolution |
| פרטי הקורס |
| שיתופיות בעולם החי היוותה מאז פרסום ספרו של דארווין "מוצא המינים" חידה אבולוציונית, משום שהיא מתבססת על קיומם של תכונות אלטרואיסטיות אשר לכאורה מורידות את הכשירות של הפרט הנושא אותם. כיצד תכונות כאילו עומדות בפני הסלקציה הטבעית, ובאילו תנאים הם יציבות אבולוציונית הם נושא נרחב למחקרים תיאורטיים ואמפיריים ב 40 השנים האחרונות. במהלך הקורס נבחן את הדרגות השונות של שיתופיות בעולם החי, את התיאוריות להסברתם, ומחקרים ניסויים הבוחנים את התיאוריות הללו. כמו כן נסקור את קבוצות בעלי החיים העיקריות בהם קיימת שיתופיות, מיחסי גומלין פשוטים ועד לחברתיות אמיתית. תכנית הקורס: 1. התיאוריות הבסיסיות של שיתופיות א. האבולוציה של התנהגות שיתופית ואלטרואיזם ביולוגי ב. דילמת האסיר ופתרונה האבולוציוני היציב ג. המודל הגנטי של ברירת שארים – Kin selection 2. אבולוציה חברתית לאור תורת המשחקים א. אלטרואיזם רציפרוקלי - Reciprocal altruism ב. מודל ברירת הקבוצות המשודרג ג. מודלים של הטיה רבייתית :reproductive skew ויתור וריסון עצמי – Transactional models המודל של "משיכת חבל" - Tug of war models 3. המסלולים האבולוציוניים המובילים לשיתופיות – מחיידקים ועד יונקים א. התנהגות קדם חברתית - Presocial association ב. חברתיות והטיה רבייתית () בריריות – slime molds ג. קבוצות שיתוף וקבוצות חצי חברתיות – semisociality ד. חברתיות אמיתי – Eusociality 4. עקרונות התקשורת החברתית א. מילים ומשפטים – פענוח אבן הרוזטה של שפת בעלי החיים ב. פרומונים כמתווכים בהתנהגות חברתית ג. ביתי הוא מבצרי – הבסיס התקשורתי להכרת חברי הקבוצה 5. קונפליקטים ופתרונם בחברות בעלי חיים א. הקונפליקט על הרבייה – האבולוציה של סטריליות בפועלות. ב. הקונפליקט על יחס הזוויגים – כמה מלכות יהיו בחברה ג. הבסיס הגנטי והכימי של תופעת הזקן הירוק 6. מערכת הארגון העצמי של חברות בעלי החיים א. ארגון עצמי וחלוקת עבודה בחברה ב. השפעת הידע הגלובלי והתקשורת בין חברי המושבה על מערכת הארגון העצמי ג. מציאת בית חדש ומתאים – גולת הכותרת של ארגון עצמי 7. המגוון הביולוגי של בעלי חיים חברתיים א. החרקים החברתיים – דבורים, נמלים, צרעות, וטרמיטים ב. יונקים חברתיים – מלהקת האריות ועד ממלכת החולד העירום |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אופקים חדשים בתהליכי עיבוד RNA (0103.0000) אופקים חדשים בתהליכי עיבוד RNA |
| פרטי הקורס |
| 1.Gil Ast – The splicing reaction: from autocatalytic introns to the spliceosome 2.Gil Ast – Alternative splicing and human genome complexity 3.Gil Ast – Transposons as major players in shaping genome complexity 4.Gidi Rechavi – RNA editing 5. Gidi Rechavi – Biological implications of RNA editing 6. Noam Shomron – Mechanisms of gene regulation by small RNAs 7. Noam Shomron – Different regulatory roles for microRNAs 8. Noam Shomron – Deep sequencing technologies assist genomic understanding 9. Yaron Shav-Tal – Cellular mRNA trafficking 10. Eran Hornstein – Regulatory small RNA: a specific case 11. Tal Pupko – 12. Eran Bacharach – Generation, Nuclear Export and Assembly of the HIV-1 genomic RNA - I 13. Eran Bacharach – Generation, Nuclear Export and Assembly of the HIV-1 genomic RNA - II 14. TBA – |
| דרישות קדם: אין |
| אופקים חדשים בתהליכי עיבוד RNA (0114.6592) אופקים חדשים בתהליכי עיבוד RNA |
| פרטי הקורס |
| 1.Gil Ast – The splicing reaction: from autocatalytic introns to the spliceosome 2.Gil Ast – Alternative splicing and human genome complexity 3.Gil Ast – Transposons as major players in shaping genome complexity 4.Gidi Rechavi – RNA editing 5. Gidi Rechavi – Biological implications of RNA editing 6. Noam Shomron – Mechanisms of gene regulation by small RNAs 7. Noam Shomron – Different regulatory roles for microRNAs 8. Noam Shomron – Deep sequencing technologies assist genomic understanding 9. Yaron Shav-Tal – Cellular mRNA trafficking 10. Eran Hornstein – Regulatory small RNA: a specific case 11. Tal Pupko – 12. Eran Bacharach – Generation, Nuclear Export and Assembly of the HIV-1 genomic RNA - I 13. Eran Bacharach – Generation, Nuclear Export and Assembly of the HIV-1 genomic RNA - II 14. TBA – |
| דרישות קדם: אין |
| אופקים חדשניים באקולוגיה (0431.3109) Current Topics in Ecology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים באקולוגיה ואיכות הסביבה ע”י מגוון של מרצים מוזמנים. |
| הרכב ציון: נוכחות חובה |
| אקולוגיה מיקרוביאלית (0453.4103) Microbial Ecology |
| פרטי הקורס |
| הורס עוסק בחקר מיקרואורגניזמים בסביבתם הטבעית ובכלל זה תאור התפוצה, הרב גוניות והאינטראקציות של מיקרואורגניזמים ביבשה, במים מתוקים ובסביבה ימית (כולל את האינטראקציה עם בע”ח , צמחים ומיקרואורגניזמים אחרים). בקורס ילמדו עקרונות אקולוגיים הנגזרים ממחקרים במיקרואורגניזמים ושימוש במיקרואורגניזמים למלחמה ומניעה של זיהום הסביבה. יודגשו גישות מולקולריות וגנומיות לנושאים אלה. |
| דרישות קדם: קורס יסוד במיקרוביולוגיה כללית נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Microbial Ecology: an evolutionary approach. McArthur. Academic Press. 2006 |
| בטיחות (0400.1001) Safety in the Laboratory |
| פרטי הקורס |
| מושגים ועקרונות בבטיחות, בטיחות בשימוש ברדיואיזוטופים, סיכונים ביולוגיים, חומרים מסוכנים, גלילי גז, היבטי בטיחות, סילוק פסולת, ארגון תחנת עבודה, כיבוי אש. הקורס יינתן במרוכז במספר מפגשים בתחילת שנה”ל. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: חוברות בטיחות -אוניברסיטת תל אביב |
| ביואתיקה וביוטכנולוגיה (0411.3129) Bioethics and Biotechnology |
| פרטי הקורס |
| בקורס ידונו סוגיות מוסריות עיקריות העולות מההנדסה הגנטית והביוטכנולוגיה העכשוויים. לדוגמה: המחקר הגנטי האנושי, שימוש בבעלי חיים לצורך מחקר, הינדוס גנטי של צמחים ובעלי חיים, ניתוח סיכונים, פטנטים ביוטכנולוגים, אתיקה של מחקר ואחריות חברתית, הבקרה על הביוטכנולוגיה, מגוון המינים והשפעת הביוטכנולוגיה על החברה והסביבה. בקורס ידונו וייושמו תיאוריות מוסר עיקריות. הקורס מבוסס על דיון. בקורס יוצגו וידונו מקרי מבחן. מטרות הקורס: הגברת המודעות למורכבות הסוגיות המוסריות הקשורות לביוטכנולוגיה העלאת רמת הידע בנוגע לסיבות (הטיעונים) והתיאוריות שמאחורי העמדות השונות הנוגעות לסוגיות מוסריות, והגברת היכולת של הסטודנט להתייחס לטיעונים השונים שיפור היכולת להצגת טיעונים מושכלים בעד ונגד נקודות מבט שונות הקניית יכולת המחשבה הביקורתית על סוגיות ביואתיות (בעד ונגד) שיפור יכולות הקריאה, הכתיבה והמחשבה הביקורתית לימוד כתיבה של ”מקרי מחקר” ושל ”ניירות עמדה” בסוגיות מוסריות העולות מהשימוש במוצרים או בטכנולוגיות ביוטכנולוגיות חדשות. נושאים אפשריים בסמסטר הקרוב: • שיבוט • Environmental ethics • אתיקה ובעלי חיים • אתיקה של השיבוט הגנטי • דטרמיניזם גנטי • פרויקט המגוון הגנטי האנושי (Human Genome Diversity Project) • Genetic enhancement • טיפול גנטי במחלות • ההגדרות של מחלות ו- enhancement • תרפיה גנטית- תאים סומטיים לעומת תאי מין (germline) • הורמון הגדילה Bovine • Xenotransplantation (השתלת איברים מבעלי חיים שונים) • יבולים מהונדסים גנטית • אנליזת סיכונים • הסיכונים בשחרור GMOs (אורגניזמים ששונו גנטית) • בדיקה וסימון של יבולים מהונדסים גנטית • שימוש בבעלי חיים מהונדסים גנטית לצורך מחקר רפואי • הנדסה גנטית ורווחת בעלי החיים • הוצאת פטנטים על גנים ויצורים חיים • פיראטיות ביולוגית biopiracy • מגוון המינים • גְּלוֹבָּלִיזַצְיָה וביוטכנולוגיה |
| הרכב ציון: הציון יינתן לפי ההשתתפות בדיונים, הצגה של פרויקטים בקבוצות ועבודה מסכמת |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| ביולוגיה מולקולרית למתקדמים - עולם ה - ר.נ.א (0421.4129) The RNA World - past and present |
| פרטי הקורס |
| השערות עולם הרנ”א ומוצא החיים מבנה רנ\\”א וניבויו קשרי רנ\\”א-חלבון ריבוזימים טבעיים ומלאכותיים תפקידי רנ\\”א בעולם הנוכחי- היבטים נבחרים הקורס מושתת על הרצאות המרכז, מורים אורחים מומחים בתחום ותלמידי הקורס. |
| דרישות קדם: מבוא לחומצות גרעין וביולוגיה מולקולארית נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בסוף הקורס תיערך בחינה על החומר הנלמד. ציונה יהווה 80% מהציון הסופי. תוכן גם הרצאה קצרה בת 25 דקות בעברית או באנגלית על נושא שייבחר מרשימת שתוצע בתחילת הקורס. הציון עליה יהווה את 20% הנותרים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Gesteland, Cech & Atkins (2004) The RNA World 3rd edition - pp.767 CHSL Press ISBN-087969-739-3 |
| ביולוגיה של התא למתקדמים (0452.3114) Advanced Cell Biology |
| פרטי הקורס |
| [הקורס הוא קורס אחד המתפרש על פני שנתיים] הקורס יינתן ע”י כמה ממורי המחלקה וחלק מהנושאים עשויים להשתנות מדי שנה. צוות המורים ישתנה בהתאם לנושאים. בקורס יידונו נושאים חדשניים עדכניים בביולוגיה של התא. ישותפו מרצים אורחים. נושא הקורס: פרקים נבחרים בהתפתחות: הסתכלות על המימד האבולוציוני של המערכת העצבית והאימונית. מבוא אבולוציוני, הגדרת מושגים בסיסיים באבולוציה מולקולרית, מבוא לגנטיקה השוואתית, עצים פילוגנטיים. מבוא לביולוגיה התפתחותית, אפופטוזיס כתהליך מרכזי בהתפתחות אורגניזמים רב תאיים, התמקדות בהתפתחות מערכת העצבים. התפתחות מערכת החיסון הנרכשת מכריש עד אדם והסתכלות ב-Immunoglobulin superfamily. הקורס פתוח גם לתלמידי תואר שלישי. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ביוסטטיסטיקה (0431.4603) Biostatistics |
| פרטי הקורס |
| הכרת השימוש בשיטות סטטיסטיות לניתוח תוצאות של ניסויים בביולוגיה. יושם דגש על בחירת המבחן המתאים לכל סוג של נתונים, על שימוש מעשי במחשב לניתוח נתונים שנאספו מן הספרות הביולוגית או מעבודות מחקר של התלמידים עצמם, ועל הסקת המסקנות הביולוגיות המתאימות מתוצאות המבחן הסטטיסטי. |
| הרכב ציון: מן התלמידים תידרש קריאה עצמית להרחבת הנושאים שיידונו בשעורים וכן הכנת תרגילים מדי שבוע. להכנת התרגילים תידרש השקעת זמן רב. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ביופיסיקה ופיזיולוגיה של ממברנות- א' (0421.4130) Biophysics and Physiology of Membranes |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: 1. ביופיזיקה של ממברנות תרמודינמיקה של מבנה פוספוליפידים במים כוחות הידרציה התכונות החשמליות של ממברנה השדה החשמלי של פני שכבת גבול מים-ממברנה אינטראקציה של ממברנה עם יונים 2. הממברנה הביולוגית מבנה ופונקציה של ממברנה עתירת חלבונים (מיטכונדריה וכלורופלסט) מנגנון הפעולה של משאבות, תעלות ונשאים שטפי אלקטרונים, פרוטונים, ואלקטרוליטים בממברנה ביולוגית אספקטים דינמיים של תהליכי התמרת אנרגיה בממברנה 3. ביוגנזה של ממברנה כניסת חלבונים ומעבר חלבונים דרך ממברנה תהליכי מיון והכוונה אנדוציטוזיה ואקסוציטוזה מבנה תעלות, מנגנון הפעולה 4. העברת סיגנלים בממברנה חלבוני G שליח משני רצפטורים: מנגנון הפעולה |
| הרכב ציון: בחינה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גליקוביולוגיה (0452.3120) Glycobiolog |
| פרטי הקורס |
| Structure, biosynthesis and functions of the carbohydrates of glycoproteins and glycolipids. Lectins. Medical relevance and biotechnological applications. Topics: •Monosaccharides: as constituents of the glycoconjugates. Emphasis on sialic acis. •Lectins: functions in eukaryotic cell biology, in microbial invasion and as tools in glycoconjugate research. •Glycoproteins: Structure. Types. Glycosylphosphatidyl (GPI) anchor. •Proteoglycans: Structure. Function as structural elements and in cancer biology. •Biosynthesis of glycoconjugates. Role of sugar chain processing in glycoprotein folding and quality control. •Glycolipids: Structure, function. Genetic defects in the metabolism of glycolipids and other glycoconjugates. •Cell surface carbohydrates and their variations in cancer and other diseases |
| דרישות קדם: אין |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| הבסיס המדעי לשמירת הטבע (0431.4613) Conservation Biology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק באתגרים המדעיים של שמירת טבע בארץ ובעולם. הקורס יעסוק בתחום conservation biology, תחום מדעי שהתפתח בעולם בעשרים השנים האחרונות והעוסק בפיתוח כלים מדעיים להתמודדות עם האתגר של שימור המגוון הביולוגי ומערכות אקולוגיות מתפקדות. מדובר בתחום סינתטי המשלב עקרונות באקולוגיה, תחום בסיס מרכזי, עם סיסטמטיקה, גנטיקה של אוכלוסיות, פיזיולוגיה, ביוגיאוגרפיה ואף תחומים מסוימים במדעי החברה והמשפטים. במסגרת הקורס תוצג המסגרת המדעית הבסיסית עליה נשען תחום ה- conservation biology. בחלק מן השיעורים יוזמנו מרצים אורחים להציג נושאים ספציפיים בתחום מומחיותם ויידונו מקרי בוחן מישראל. בשעורים האחרונים יתקיים דיון במספר נושאי מפתח. הסטודנטים יקבלו כל אחד מאמר/ים בנושא מסוים, יציגו אותו בקצרה ואח"כ יתקיים דיון במסגרת הכיתה. נושאי הרצאה עיקריים הרקע להתפתחות תחום המדע ואופיו הנגזר האיומים העיקריים על המגוון הביולוגי בעולם ובישראל מצב המערכות האקולוגיות בעולם ודגש על מערכות ים-תיכוניות דגמים במגוון הביולוגי בזמן ובמרחב הרס וקיטוע בתי גידול ומשמעויותיהם המרחביות טרנספורמציה של בתי גידול – חקלאות, יערנות ושמירת טבע אתגרים מדעיים בשמירת טבע בבתי גידול לחים אתגרים מדעיים בשמירת טבע בבתי גידול חופיים בעיית המינים הפולשים כתופעה אקולוגית אקולוגיה של אוכלוסיות – היבטים דמוגראפיים בשמירת טבע שימור המגוון הגנטי – כלים מדעיים התפתחות אקולוגיה של שיקום – כלים ואתגרים מדעיים מקום הטקסונומיה בשמירת הטבע – אתגר מדעי וטכנולוגי ספר הלימוד העיקרי שילווה את הקורס יהיה ספרם של Meffe and Carroll אך יעשה שימוש גם במקורות ספרות אחרים. הדיון בסוף הקורס יתמקד במקרי בוחן שנחקרו בעולם ובישראל ויש להם פנים מדעיים שונים. |
| הרכב ציון: הציון ייקבע על פי הבחינה הסופית בלבד אך הצגת מאמר/ים והשתתפות בדיון – חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| הנדסת נוגדנים (0453.3388) Antibody Engineering |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: בקורס יתוארו ההתפתחויות העדכניות שהביאה מהפיכת ההנדסה הגנטית לאפיון, שיבוט, ושינוי של נוגדנים ולשימוש בהם. יושם דגש על תרומת הביולוגיה המבנית, זמינותם של מאגרי מידע ממוחשבים ושל שיטות רבות עצמה לקביעה ישירה או לחיזוי המבנה המרחבי של מולקולת הנוגדן ולתכנון מושכל של שינויים בה. יתוארו מערכות שונות לביטוי וניקוי של נוגדנים או מקטעי נוגדנים רקומביננטים במערכות אל-תאיות, בחיידקים ובתאים אנימליים. יתוארו שימושים של נוגדנים רקומביננטים ושל כימרות של נוגדנים עם אנזימים, ציטוקינים וטוקסינים במחקר מדעי וברפואה. מבנה הקורס: מנגנונים מולקולריים ליצירת רב-גוניות בנוגדנים. מבנה מרחבי של נוגדנים ושימוש בשיטות חיזוי מבנה להנדסת נוגדנים. הנדסת אתר קישור האנטיגן לחיזוק זיקת הנוגדן לאנטיגן הצגת מקטעי נוגדנים על פני בקטריופאז’. ביטוי וניקוי נוגדנים המבוטאים בחיידק. ביטוי וניקוי נוגדנים רקומביננטים בתאים בתרבית. ישומים של נוגדנים רקומביננטים במחקר וברפואה. יישומים של נוגדנים תוך-תאיים. |
| דרישות קדם: אימונולוגיה כללית. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: החל משנת הלימודים תשס”ח תהיה בחינה בכתב גם במועד ב’ ולא תתאפשר הגשת עבודה במקום. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| הסביבה בה אנו חיים (0341.3006) OUR ENVIRONMENT |
| פרטי הקורס |
| כיצד נוצר כדור הארץ, כיצד נוצרו החיים על פני הארץ? עננים וגשם, תנועות אטמוספיריות, אפקט החממה והשפעת האדם על סביבתו, ברקים ורעמים, החור באוזון, זיהום אוויר , גשם חומצי. כדור הארץ הדינמי, מה מספרים הסלעים השונים, יסודות תורת הלוחות. אסונות טבע: הרי געש, רעידות אדמה, שטפונות והכחדות חיים המוניות. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| חישוביות בגנטיקה הומנית (0368.4168) Computational Human Genetics |
| פרטי הקורס |
| טכנולוגיות ריצוף ה-DNA התפתחו בשנים האחרונות בקצב מסחרר. התפתחויות אלו יצרו הזדמנויות להבנה טובה יותר של גנטיקת האדם ולמציאת קשרים בין גנים למחלות. בקורס זה נתאר את האלגוריתמים והשיטות שפותחו לאחרונה לשם אנליזה וגילוי של תופעות ביולוגיות כמו למשל גילוי של מוטציות הקשורות למחלות כמו סרטן או אלצהיימר. בפרט, נעסוק בנושאים הבאים: הערכת קצב רקומבינציה ומוטציה, מציאת איזורים גנומיים תחת לחץ סלקטיבי, מציאת הפלוטיפים, הערכת מבנה אוכלוסיות, הערכת סיכון למחלות, זיהוי פלילי באמצעות DNA ושיטות למציאת אסוציאציה סטטיסטית בין מוטציות למחלות. כמו כן, נתאר את הטכניקות הבאות שלהן חשיבות מעבר לתחום של גנטיקה הומנית: אלגוריתם Expectation Maximization, מודלים מרקוביים חבויים (Hidden Markov Models), אנליזה של צירים מרכזיים (Principal Component Analysis), מחרוזות מרקוב מונה קרלו (Markov Chain Monte Carlo). |
| דרישות קדם: הסתברות, אלגברה לינארית |
| יחסי תפקוד מבנה בחלבונים וחומצות גרעין (0453.4009) Structure-Function Relationships in Proteins and Nucleic Acids |
| פרטי הקורס |
| הקורס מהווה הרחבה לקורס "עקרונות בחקר החלבונים". הקורס יהיה במתכונת של שיעור וסמינר ויעסוק בנושאים מתקדמים של מבנה ותפקוד של חלבונים כגון: זיהוי וכימות של אינטראקציות בין ליגנדים ומקרומולקולות מערכות מורכבות בתא החי הכוללות אינטראקציות בין חלבונים חלבונים כמכונות אינטראקציות בין חלבונים וחומצות גרעין. ועוד. |
| דרישות קדם: עקרונות בחקר החלבונים או קורס מתקדם אחר בחלבונים (יתכן במקביל). נוכחות חובה |
| הרכב ציון: עמידה במטלות תקנה ציון "עבר |
| כתיבה מדעית באנגלית (0400.1002) Writing Scientific Papers in English |
| פרטי הקורס |
| The course aims to help scientists to improve their scientific writing with a view to publish. Basic guidelines on writing scientific papers will be discussed, with consideration to both the skills of planning and organizing a paper and the use of appropriate English style and language. The course will have two major components: a series of lectures/workshops, with practical exercises to illustrate the effective (and ineffective!) use of English in scientific publications; a six week project at the end of which the participants will have produced a simple research paper. The ultimate aim is to explore the production of scientific papers that will be both accepted for publication and understood by their target audience. |
| מס תלמידים: 16 |
| דרישות קדם: קורס לדוקטורנטים בלבד נוכחות חובה |
| הרכב ציון: ציון ”עובר” על סמך נוכחות חובה בשעורים והגשת עבודות בזמן |
| כתיבה מונחית של הצעת מחקר או מאמר סקירה (0453.3399) Tutorial Writing of Research Proposal or Review Paper |
| פרטי הקורס |
| הקורס נועד להכשרת התלמיד להגשת הצעת-מחקר או כתיבת מאמר סקירה בתחומים השונים של הביוטכנולוגיה. התלמיד יתנסה בתהליך הגדרת הנושא. איסוף החומר והכתיבה המדעית בהנחיה אישית של מנחה מקצועי ובליווי מרכז הקורס. העבודה תוגש למרכז הקורס. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| מאקרואקולוגיה (0431.4616) Macroecology |
| פרטי הקורס |
| מהם דגמי הפיזור של בעלי חיים על פני כדור הארץ? היכן נמצאים רבים והיכן מעטים, ואילו בעלי חיים נצפה למצוא במקומות שונים? כיצד יודעים מהם דגמי התפוצה שלהם? מהם יחסי הגומלין בין צורה, פונקציה ותפוצה, ביחוד בהתייחס לגדל גופם של בעלי חיים? מהם הגורמים הביוטיים והאביוטיים העיקריים המשפיעים על תפוצת בעלי חיים ועל גודלם? ולבסוף – מהם הדגמים העיקריים באבולוציה של בעלי חיים, והאם ישנן ראיות לכיווניות באבולוציה בהתייחס לרמת מורכבות, גודל גוף ומספרי מינים? הקורס ינסה להציג שאלות אלה ולהצביע על כיוונים אפשריים (ובלתי אפשריים) לתשובות. במהלך ההרצאות נשתדל להביא דוגמאות ממאמרים קלאסיים ועכשוויים, ופחות מ text books. רוב הדוגמאות יהיו מבעלי חוליות. על מנת להבין את נושאי ההרצאות תדרש הבנה מסוימת של מודלים סטטיסטיים, הנחותיהם ומשמעותם (Multiple regression, ANOVA דרגות חופש, שונות מוסברת, תלות סטטיסטית וכו'). הסטודנטים יבחרו נושא לעבודת מחקר קצרה במהלך הקורס. העבודה תכלול איסוף נתונים (מהספרות), ניתוחם והצגתם בכיתה בהרצאות האחרונות (כ 15 דקות להרצאה) וידונו על ידי כל הסטודנטים. היקף הקורס: שעתיים שבועיות. הציון יינתן על בסיס ההרצאה (30%), השתתפות בדיונים במהלך כל הקורס (10%) ומבחן (60%). נושאי ההרצאות (פלוס \ מינוס) יהיו: • דגמים במגוון המינים – קווי רוחב ומעבר להם • מיפוי מגוון המינים – ממיקומים למפות עושר מינים • ביוגיאוגרפיה של איים – סופרים מינים • ביוגיאוגרפיה של איים – אבולוציה באיים • האם ניתן לעשות macro-conservation? – כימות, סדרי עדיפויות וגיאוגרפיה של שמירת טבע • גבולות ביוגיאוגרפיים: פילטרים, מחסומים Beta diversity וגודלם של תחומי תפוצה • היווצרות חברות אקולוגיות: Assembly Rules • גודל גוף: התפלגויות ואלומטריה • ביוגיאוגרפיה של גודל גוף: כלל ברגמן • ביוגיאוגרפיה של גודל גוף: כלל האיים • מגמות אבולוציוניות וקידמה – זהירות! |
| מס תלמידים: קבלת תלמידי שנה ג' – על בסיס מקום פנוי ושיחה עם המרצה |
| דרישות קדם: קורסי ביוסטטיסטיקה, אבולוציה, ומבוא לעולם החי |
| הרכב ציון: מבחן (60%), הצגת העבודה בעל פה בכיתה (30%), השתתפות בדיונים בכיתה (10%) |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מה - DNA לאוכלוסיה (0453.3394) From the DNA to the population |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס: הקורס עוסק בבעיות העיקריות של הכפלת החומר הגנטי והתרבות של תאים, יצורים חיים ואוכלוסיות . • בקרה גנטית על מחזור התא (פרוקריוטים ואוקריוטים). • גנטיקה של התמיינות והתפתחות (פרוקריוטים ואוקריוטים). • טרנספוזונים (פרוקריוטים ואוקריוטים). • גנטיקה של אוכלוסיות. • גנטיקה של תכונות כמותיות. • אבולוציה. |
| הרכב ציון: במסגרת הקורס ידונו התלמידים על מספר מאמרים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מהגנום למוח - רשתות ביולוגיות ומודלים (0431.4618) From Genome to Brain |
| פרטי הקורס |
| 1. Introduction to biological networks 2. Non-linear Dynamics and Dynamical Systems 3. Network Theory - characterization of Networks Geometry and Function. Small world networks. Scale free networks. Community networks. Dimension reduction. Eigen value entropy. 4. Gene Networks: Gene circuits and gene networks. Modeling approaches. Intracellular computation. Sensing and distributed information processing. 5. Information theory, game theory and the biological foundations of decision making. 6. Swarming intelligence, multi agent simulations and biorobotics. 7. Biological synchrony based on coupled oscillator and network theory 8. Neural Networks: Function-Form relations, experimental approaches and modeling approaches. Networks' engineering and repair. Modlar networks. Memory and learning. 9. Human Brain Activity. Entropy-frequency analysis. Complexity theory. 10. Epidemics: How viruses spread amongst computer networks and people 11. Ecological networks 12. Conclusions – towards system level information based biology and bio-inspired engineering of man-made networks. |
| דרישות קדם: This course is aimed at graduate and advanced undergraduate students from Biology and Physics. The course is also open for students from Mathematics, Chemistry, Engineering, and Medical Sciences. |
| הרכב ציון: מבחן (60%), עבודה או סמינר (40%). את העבודה ניתן להגיש בזוגות |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מודלים מתמטיים בביולוגיה (0431.4609) Mathematical models in Biology |
| פרטי הקורס |
| בעוד שבעבר הצורך במעורבות מתמטית היה בעל עניין מועט יחסית בקהילת הביולוגים, גישה זו מתחילה להשתנות במהרה. למודלים מתמטיים כמותיים יש כיום שימוש ככלי מקובל ונדרש במחקר ביולוגי מודרני ומתקדם. קורס זה ינסה להקנות לסטודנטים רקע מתאים במתודולוגיה של מודלים פשוטים בהקשרים ביולוגיים. להלן רשימה (טנטטיבית) של נושאים שידונו לעומק במהלך הקורס: 1. רקע למודלים מתמטיים תוך הדגשת טכניקות מדינאמיקות לא ליניאריות (ותיאורית הכאוס) עם שימושים בביולוגיה. 2. מודלים של אוכלוסיות matrix demographic בביולוגיה ובאקולוגיה. 3. מודלים מתימטיים של גנטיקות במסגרת ברירה טבעית 4. מודל Fitzhugh-Nagumo לדינאמיקה של נוירונים. 5. דינאמיקה תוך תאית: מסלולים של ביטוי גנים. 6. אפיון מוטיבים ברשתות ביולוגיות מורכבות. 7. מודלים של משוואות דיפרנציאליות של מחלות זיהומיות. הקורס יארך 3 שעות בשבוע,כולל שעת תרגול/או מעבדה בנושא Matlab computer modeling. הקורס ינתן בשפה האנגלית. מיועד לתלמידי תואר שני ותואר שלישי במדעי החיים, מדעים מדיוקים ורפואה. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הנוכחות בקורס חובה, המטלה העיקרית בקורס: עבודת פרויקט תרגילים ומבחן והציון יורכב 50% מהבחינה. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Strogatz S: Nonlinear dynamics and chaos Murray JD: Mathematical Biology Ellner S& Guckenheimer J: Dynamics models in biology |
| מכשור עקרונות ושמוש של שיטות פיזיקליות בביולוגיה (0453.4105) Physical Methods in Biology: Principles and Applications |
| פרטי הקורס |
| סקירה על העקרונות עליהם מבוססות שיטות מדידה פיסיקליות שונות, תוך הדגמה של יישום שיטות אלה בביולוגיה. הדיון יתרכז בעיקר בשטחים הבאים: שיטות אופטיות -ספקטרוסקופיה אלקטרוכימיה ואלקטרופורזה קריסטלוגרפיה בקרניי X מיקרוסקופיה אופטית מירוסקופיה אלקטרונית סנטריפוגציה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מנגנוני קטליזה אנזימטית (0421.3814) MECHANISMS OF ENZYMATIC CATALYSIS |
| פרטי הקורס |
| שאלת הקורס: כיצד אנזימים מזרזים ריאקציות ביוכימיות? • התאוריה ועקרונות הקטליזה האנזימטית • גישות ניסוייות לחקר האתר הפעיל • דוגמאות למנגנוני אנזימים: פרוטאזות, פוספטזות, חלבוני G... • תכנון תרופות המבוסס על מנגנון קטליזה • סדנא ממוחשבת – הכרות האתר הפעיל |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מעבדה בגנטיקה למתקדמים (0453.4112) Advanced Laboratory in Genetics |
| פרטי הקורס |
| המעבדה עוסקת באספקטים גנטיים, גנומיים ומולקולריים של הביולוגיה של שמרים |
| מס תלמידים: 15 |
| הרכב ציון: הציון ינתן על סמך השתתפות, הכנת מצגות ודוח סופי |
| נושאים נבחרים בגנטיקה עכשווית (0453.3397) Topics in present day genetics |
| פרטי הקורס |
| קורס זה מהווה סמינריון למסלול בגנטיקה. בקורס יידונו נושאים עכשוויים בגנטיקה, יקראו מאמרים עדכניים בתחום, ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. הציון ינתן על סמך השתתפות והרצאות של הסטודנטים |
| הרכב ציון: הציון ינתן על סמך השתתפות והרצאות של הסטודנטים |
| נושאים נבחרים בנוירוביולוגיה (0491.3221) Selected Topics in Neurobiology |
| פרטי הקורס |
| • מנגנוני העברת סיגנלים • מוות תאי מתוכנת • ביולוגיה של ממברנת התא • מחלות נוירודגנרטיביות • תהליכי התפתחות במערכת העצבים • גישות מולקולריות לתכנון תרופות |
| הרכב ציון: אין בקורס ציון, רק חובת השתתפות בסמינרים. המטלה של \\\\”עבודה\\\\\\\\ פרוייקט\\\\” סומנה כי אין אפשרות לא לסמן כלום. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| נושאים עכשוויים במיקרוביולוגיה (0453.3395) Topics in present day Microbiology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יתנהל כקבוצת דיון על נושאים במיקרוביולוגיה (רפואית, אקולוגית, תעשייתית). תינתן עדיפות לסטודנטים שלומדים במסלול למיקרוביולוגיה. |
| מס תלמידים: 14 |
| הרכב ציון: הגשת סמינר על מאמר מדעי |
| נושאים עכשוויים במיקרוביולוגיה (0453.4395) Topics in present day Microbiology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יתנהל כקבוצת דיון על נושאים במיקרוביולוגיה (רפואית, אקולוגית, תעשייתית). תינתן עדיפות לסטודנטים שלומדים במסלול למיקרוביולוגיה. |
| מס תלמידים: 14 |
| הרכב ציון: הצגת מאמר מדעי |
| סמינר מחקר בביויכמיה (0421.4998) M.Sc. Seminar in Biochemistry |
| פרטי הקורס |
| התלמידים יציגו את מחקריהם ויתקיים דיון מעמיק בעבודות. בנוסף, התלמידים יזמינו מרצים אורחים מטובי החוקרים. |
| הרכב ציון: חובת נוכחות בהרצאות ובשנה ב\’ הצגת עבודת המחקר |
| סמינר מחקר בביוכימיה (0421.4999) M.Sc. Seminar in Biochemistry |
| פרטי הקורס |
| התלמידים יציגו את מחקריהם ויתקיים דיון מעמיק בעבודות. בנוסף, התלמידים יזמינו מרצים אורחים מטובי החוקרים. |
| הרכב ציון: חובת נוכחות בהרצאות ובשנה ב’ הצגת עבודת המחקר |
| סמינר מל"מ א' בזואולוגיה (0431.4998) M.Sc. Seminar in Zoology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים בזואולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחום זה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ א' בחקר התא (0452.4109) M.Sc. Seminar in Cell Research & Immunology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים בחקר התא ואימונולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחומים אלה, ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ א' במדעי הצמח (0411.4998) .Sc. Seminar in Plant Sciences |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים במדעי הצמח. ינותחו מאמרים עדכניים בתחום זה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. חובה להגיש סימנריון בשנה שניה של לימודי המוסמך |
| הרכב ציון: 70% מהשעורים נוכחות חובה. סטודנטים משנה ב\\\\\\\\’ מחויבים להציג את עבודת המחקר שלהם |
| סמינר מל"מ א' במיקרוביולוגיה מולקולרית וביוטכנולוגיה (0453.4109) M.Sc. Seminar in Molecular Microbiology & Biotechnology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים במיקרוביולוגיה מולקולרית ובביוטכנולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחומים אלה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ ב' בזואולוגיה (0431.4999) M.Sc. Seminar in Zoology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים בזואולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחום זה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ ב' בחקר התא (0452.4110) M.Sc. Seminar in Cell Research & Immunology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים בחקר התא ואימונולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחומים אלה, ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ ב' במדעי הצמח (0411.4999) .Sc. Seminar in Plant Sciences |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים במדעי הצמח. ינותחו מאמרים עדכניים בתחום זה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| הרכב ציון: 70% מהשעורים נוכחות חובה. סטודנטים משנה ב\\\\\\\\’ מחויבים להציג את עבודת המחקר שלהם |
| סמינר מל"מ ב' במיקרוביולוגיה מולקולרית וביוטכנולוגיה (0453.4110) M.Sc. Seminar in Molecular Microbiology & Biotechnology |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים במיקרוביולוגיה מולקולרית ובביוטכנולוגיה. ינותחו מאמרים עדכניים בתחומים אלה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מל"מ ב' בנוירוביוכימיה (0491.4999) M.Sc. Seminar in Neurobiochemistry |
| פרטי הקורס |
| יידונו נושאים עכשוויים בנוירוביוכימיה ינותחו מאמרים עדכניים בתחומים אלה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים. |
| עולם הפטריות (0119.5640) עולם הפטריות |
| פרטי הקורס |
| ד"ר ניר אושרוב (המחלקה למיקרוביולוגיה הומנית, בית הספר לרפואה) פרופ' עמיר שרון (המחלקה למדעי הצמח, הפקולטה למדעי החיים) הקורס פתוח לתלמידי שנה ג' ותלמידים לתארים מתקדמים תכנית הקורס: • מבוא כללי ממלכת הפטריות: אקולוגיה, השפעות על האדם, ביוטכנולוגיה, קלסיפיקציה וסיסטמאטיקה, צורות הזנה, גדילה ומורפולוגיה, מחזור חיים • רביה מינית ואל מינית, אנליזה גנטית, ואנליזה ומולקולארית: מחזורי חיים בפטריות מקבוצת הזיגומיצטים, אסקומיצטים, בזידיומיצטים; גנטיקה וגנטיקה מולקולארית של פטריות • פתוגנים של האדם (ניר אושרוב): o מבוא: סקירה כללית על פטריות פתוגניות לבני אדם o דרמטופיטים וזיהומים תת עוריים: ביולוגיה, קלסיפיקציה, פתוגניות, מחלות ודרכי טיפול, מחקרים מולקולאריים o פתוגנים אופורטוניסטיים – קנדידה וקריפטוקוקוס: ביולוגיה, קלסיפיקציה, פתוגניות, מחלות ודרכי טיפול, מחקרים מולקולאריים o פתוגנים אופורטוניסטיים – אספרגילוס ועובשים אחרים: ביולוגיה, קלסיפיקציה, פתוגניות, מחלות ודרכי טיפול, מחקרים מולקולאריים o עמידות לחומרים אנטי- פטרייתיים: קבוצות עיקריות של תכשירים, מנגנוני פעולה, שיטות וגישות חדשניות לטיפול בפטריות • פתוגנים של צמחים (עמיר שרון): o מבוא: דרכי הדבקה, צורות אינטראקציה עם הצמח, אברי הדבקה, פתוגנים מוכרים, גורמי אלימות, מנגנוני הגנה של הצמח o פתוגנים נקרוטרופים: ביולוגיה, מאפייני מחלות, מחזור חיים, אסטרטגית מחלה, אנזימים, טוקסינים o פתוגנים ביוטרופים: ביולוגיה, מאפייני מחלות, מחזור חיים, אסטרטגיית מחלה, דיכוי מערכות ההגנה של הצמח, מוות תאי מתוכנת |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| עקרונות בחקר חלבונים (0103.0035) Principles of Protein Research |
| פרטי הקורס |
| הקורס מיועד לסכם את הבסיס התיאורטי וההיבטים היישומיים של חקר החלבונים היום. נושאי הקורס העיקריים: · המבנה והתפקוד של חלבונים · תהליכי הפרדה וניקוי · שינויים שלאחר תרגום החלים בחלבונים – היבטים מבניים ותפקודיים · התכונות הספקטרליות של חלבונים ושימושם בחקר החלבונים – בליעת אור ופליטת אור · חלבונים ממברנליים – מבנה ותפקוד · חלבוני השלד התוך תאי ומעורבותם בבקרת התכונות המיכניות של התאים. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| עקרונות סטטיסטיים בניסויים (0400.6000) Statistics |
| פרטי הקורס |
| נושאי הקורס: 1. סטטיסטיקה תיאורית: מדדי מיקום, פיזור וקשר. שיטות גראפיות לסיכום נתונים. 2. הסתברות: התפלגות נורמלית ומשפט הגבול המרכזי. 3. השוואת קבוצות: בדיקת השערות ורווחים למדגם אחד ולשני מדגמים (ב"ת ומזווג). מבחן פירסון לאי-תלות ויישום לפרופורציות. שיטות א-פרמטריות להשוואה. 4. ניתוח שונות חד ודו-כווני. בעיית המרובות. 5. רגרסיה: קווית ומרובה. בדיקת טיב המודל. טרנספורמציות ורגרסיה לוגיסטית. 6. אם יוותר זמן: תצפיות חוזרות ומודל מעורב. הקורס ישים דגש על חשיבה סטטיסטית, שיקולים שיש לעשות בזמן תכנון ניסויים, ומגבלות השיטות הנלמדות. התרגולים יכללו הדרכה לתוכנה סטטיסטית. |
| הרכב ציון: חובות הקורס: שעורי בית שבועיים (חלקם תוך שימוש בתוכנה). הציון יתבסס על מבחן סופי והגשת תרגילים. פטור מהקורס: על סמך 2 קורסים קודמים בסטטיסטיקה: קורס בסיסי וקורס מתקדם שחופף לסילבוס הקורס. לקבלת הפטור יש להגיש למרצה סילבוסים של הקורסים שנלמדו וגליון ציונים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| פרקים נבחרים במדעי הצמח א' (0411.4614) פרקים נבחרים במדעי הצמח |
| פרטי הקורס |
| בקורס יידונו נושאים חדשניים עדכניים בביולוגיה של צמחים הכוללים: ביולוגיה התפתחותי, מבנה התא הצמחי, אינטראקציה בין צמחים לפתוגנים, תגובת הצמח לתנאי הסביבה ועקות ביוטיות, אקולוגיה של צמחים. * דרישות מוקדמות- אחד מתוך שני קורסי המובא למדעי הצמח : 1) מבוא למדעי הצמח או 2) פיסיולוגיה של הצמח. * היקף כל קורס יהיה 2 ש"ס * ציון סופי יקבע ע"י מבחן והערכת המרצים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| קוסמוכימיה וראשית החיים (0341.4169) Cosmochemistry and the origin of life |
| פרטי הקורס |
| • ראשית היקום • היווצרותם וחייהם של כוכבים • עננים בין כוכביים • היווצרות מערכת השמש: • פלנטות • אסטרואידים ושביטים • האטמוספירות הפלנטריות ומקורות האנרגיה הפועלים עליהן • תהליכים כימיים באטמוספירת והידרוספירת הארץ שהובילו להיווצרות חיים • הסיכויים להיווצרות ולגילוי חיים מחוץ לכדור הארץ |
| הרכב ציון: מבחן שמועדו יפורסם בהמשך. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| קריסטלוגרפיה מעשית של חלבונים (0453.4001) Practical protein crystallography |
| פרטי הקורס |
| הקורס יתמקד בהיבטים העיוניים והמעשיים החיוניים לקביעת מבנה תלת ממדי של החלבונים: • גיבוש • הכנת נגזרות של אטומים כבדים • איסוף נתוני עקיפת קרני הרנטגן • קביעת המבנה • שפור המבנה • אנליזה של המבנה |
| מס תלמידים: 12 |
| דרישות קדם: לפי ראיון עם המורה. חובה נוכחות חובה |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| שיטות בביולוגיה מבנית (0421.3804) Methods in Structural Biology |
| פרטי הקורס |
| X-ray diffraction methods Electron diffraction and microscopy Joel Hirsch Light Scattering methods Joel Hirsch calorimetry Solution methods Abed Azem analytical centrifugation gel filtration chromatography electrophoresis, crosslinking Academic credit: 3 hrs; 2 hrs – lecture, problem sets and literature analysis Course material: http://virtual.tau.ac.il Contact: jhirsch@post.tau.ac.il Textbooks: K. van Holde, W.C. Johnson, P.S. Ho, Principles of Physical Biochemistry, Prentice Hall (2006) C. R. Cantor and P. R. Schimmel, Biophysical Chemistry, WH Freeman and Co. (1980), The course will be taught in English |
| הרכב ציון: מבחן + תרגילים + עבודה. הקורס ינתן באנגלית |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| שיטות בסיסיות בביולוגיה של התא ובביולוגיה מולקולרית (0452.3117) Basic techniques in molecular and cellular biology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יסקור מגוון שיטות לאנליזה של DNA, RNA וחלבונים: הכנת cDNA, ספריות cDNA וספריות גנומיות, מיפוי מקטעי גנים, אנליזה מיחשובית של רצפים, וקטורים ותאים לביטוי הטרולוגי של גנים, מודלים אנימליים, סימון DNA בתאים ובמבחנה, אימונופרסיפיטציה של כרומטין, זיהוי מולקולות RNA (northern), אינטראקציה בין RNA לחלבונים, הכנה ושימוש בנוגדנים, אימונופרסיפיטציה, אנליזת western, מעקב אחרי חלבונים בתא, סימון חלבונים בנתיבים פלואוריסצנטיים, אינטראקציות בין חלבונים, מיקרוסקופיה קונפולית ואלקטרונית, אנליזות בעזרת FACS. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| תכנית מחקר בזואולוגיה (0431.4621) Research Proposal |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: הקורס נועד להוות מסגרת בה יציג כל סטודנט את תכנית המחקר של עבודת המסטר בפני סטודנטים ואנשי סגל מהמחלקה. הסטודנט המרצה יתנסה בהרצאה מדעית בנושא המחקר תוך חשיפה לביקורת, והסטודנטים המשתתפים ילמדו על עבודות מקבילות שנעשות על ידי חבריהם. |