| אבולוציה (0455.2536) Evolution |
| פרטי הקורס |
| הקורס מציג לתלמיד את שדה המחקר של האבולוציה, ואת הכוחות העיקריים המניעים תהליכים אבולוציוניים. חלקו הראשון של הקורס עוסק בהיבטים בסיסיים של האבולוציה כתיאוריה וכתהליך. בחלקו השני מקשר הקורס בין גנטיקה של אוכלוסיות וגנטיקה כמותית מצד אחד, לבין סלקציה וסחיפה גנטית מצד שני. חלקו האחרון של הקורס מוקדש לנושאים מתקדמים יותר, ובכלל זה שאלות פתוחות בחקר האבולוציה. נושאי הלימוד: • מבוא: מהי אבולוציה; תולדות התפתחות הרעיון • העדויות לקיומה של האבולוציה • סיסטמטיקה (מיון) ושחזור עצים פילוגנטיים • מנגנון הברירה הטבעית • גנטיקה של אוכלוסיות ומודלים של סלקציה • תהליכים אקראיים והתיאוריה הניוטרליסטית • ממודלים של שני גנים ועד גנטיקה כמותית • חקר אדפטציות • רמות הפעולה של הברירה הטבעית; האבולוציה של אלטרואיזם • בעיית האבולוציה של ה-Sex • ברירה זוויגית (sexual selection) |
| דרישות קדם: ידע בסיסי בגנטיקה על סמך קורסי מבוא כגון ביולוגיה של התא או גנטיקה נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה מסכמת – 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Ridley, M. 1996. 2004 Evolution 2nd and 3rd Editions. Blackwell Science Inc. Freeman, S. and Herron, J.C. Evolutionary analysis (2nd and 3rd Edition). Prentice Hall Futuyma, D.J. 1998. Evolutionary Biology 3rd Edition. Sinauer Associates, Inc. יבלונקה, ח. 1994. אבולוציה. האוניברסיטה הפתוחה (סדרת חוברות). |
| אבולוציה מולקולרית (0455.3348) MOLECULAR EVOLUTION |
| פרטי הקורס |
| הקורס יציג את התחום של אבולוציה מולקולרית, בין השאר ידונו הנושאים הבאים: • רקע היסטורי וביולוגי. • מבוא לגנטיקה של אוכלוסיות. • בניית עצים פילוגניים, ידונו האלגוריתמים פרסימוניה מרבית, neighbor joining, minimum evolution, נראות מרבית. • אבולוציה של גנומים והכפלות גנים. • חשיבות המוטציה וקצבי אבולוציה. • זיהוי מקרים של סלקציה דרווינית חיובית ברמת הדנ”א. • דוגמאות של מחקרים באבולוציה מולקולרית. |
| דרישות קדם: - נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרכב הציון הסופי: 100% בחינה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אופקים חדשניים באקולוגיה (0455.2686) NEW HORIZONS IN BIOLOGY |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס היא לתת לתלמידי השנה השנייה בפקולטה למדעי החיים מושג ראשוני על נושאי המחקר החדשניים בהם עוסקים החוקרים במחלקות השונות של הפקולטה. סקירה זו אמורה לסייע לתלמידים בבחירת הקורסים השונים לכווני התמחותם בשנים הבאות, בהתאם לשטחי ההתעניינות והנטיות האישיות. ההרצאות תינתנה ע”י נציגים מכל אחת ממחלקות הפקולטה למדעי החיים. |
| הרכב ציון: נוכחות חובה לפחות 80% מהשעורים |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אימונולוגיה כללית (0455.2688) GENERAL IMMUNOLOGY |
| פרטי הקורס |
| • תגובות חיסוניות מולדות ונרכשות • מבנה ותפקיד אימונוגלובולינים • הרצפטור לאנטיגן על תאי T • מולקולות MHC • מנגנונים אפקטורים בפעילות מערכת החיסון • תהליכים דלקתיים • הבסיס המולקולרי לביטוי מולקולות אימונוגלובוליניות, הרצפטור לאנטיגן על תאי T ומולקולות MHC• ציטוקינים, כמוקינים, מולקולות אדהזיה. • אינטראקציות בין תאים במערכת החיסון • תהליכי חינוך ואקטיבציה של תאים במערכת החיסון • תגובות אלרגיות • מחלות אוטואימוניות ומחלות חסר אימוניות • סרטן, אינפקציות ויראליות ובקטראליות, תגובות לפרזיטים. |
| מס תלמידים: 250 |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אימונולוגיה כללית- מעבדה (0455.3686) IMMUNOLOGY - LABORATORY |
| פרטי הקורס |
| • שיטות מעבדתיות באימונולוגיה, תוך הדגשה על אפשרויות היישום בענפים שונים של מדעי החיים. • שיטות שונות להפקת נוגדנים ולניקויים • שיטות מדידה אימונולוגיות - שיטות מדידה אנזימו-אימוניות לאנטיגנים ולנוגדנים • הכרת התגובה התאית - תגובת תאים לימפואידים למיטוגנים • שיטות לקביעת הביטוי של חלבונים ע”פ תאים לימפואידים היקף הקורס: 6 מעבדות אחת לשבוע כ\\”א |
| דרישות קדם: דרישה מוקדמת: קורס אימונולוגיה כללית. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרכב הציון הסופי: מבחן 70% והערכת מדריך 30%. חובת נוכחות בכל המעבדות ול-2 שע\\’ ביום ה\\’ בשבוע 3 לסיום מע\\’ 3 ולחצי שעה ביום ב\\’ בשבוע 5 לסיום מע\\’5. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Kuby Immunology פרקים 4 ו-6 |
| אינטראקציית צמח פתוגן (0455.3424) PLANT-PATHOGEN INTERACTIONS |
| פרטי הקורס |
| • מחלות צמחים: הגדרה; גורמי מחלה; השפעה על הצמח; משמעות כלכלית; הנדסה גנטית בשירות הפיטופתולוגיה. • מערכת החיסון הצמחית: הגנה פאסיבית, הגנה פעילה, חומרי הגנה, הפעלת מערכת ההגנה הפעילה, מולקולות , פעילות, מסלולי העברת סיגנל, מנגנון גן מול גן, מאפיינים מולקולריים וביוכימיים של גנים לעמידות, יישומים ביוטכנולוגיים. • מחלות בקטריאליות – סימפטומים, מנגנוני הדבקה, גורמי וירולנטיות, מערכות הפרשה III Type , הכוונה של חלבונים בקטריאליים שמופרשים לתוך תאי הצמח. • מחלות ויראליות ואגרובקטריות – הכרת הוירוסים העיקריים הפוגעים בצמחים והמחלות שהם גורמים, הכרת המבנה המולקולרי של וירוסי צמחים ודרך התרבותם, הבסיס המולקולרי לתנועתם של וירוסים בצמחים ומנגנונים מולקולריים הקשורים בפתוגניות שלהם, ייצור צמחים טרנסגניים עם עמידות כנגד וירוסים. • פטריות פתוגניות – מנגנוני חדירה והתבססות AVR genes , בקרה של מסלולי העברת אותות, מנגנוני הדבקה, טוקסינים, הדברה ביולוגית, הקניית עמידות באמצעות הנדסה גנטית. הקורס כולל שעתיים שבועיות הרצאה הקורס כולל סיור של חצי יום (באותו יום שבו ניתן הקורס). הסיור יתקיים המהלך החודש הראשון של הסמסטר |
| הרכב ציון: בחינה - 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| איפיון מחלות נוירודגנרטיביות ע"י הדמיה (0455.3515) Imaging Characterization of Neurodegenerative Diseases |
| פרטי הקורס |
| הקורס מיועד לתלמידי תואר שני ושלישי ותלמידי שנה ג\’ במסלול ביולוגיה-פסיכולוגיה עם הדגש על המוח הקורס יכלול שני חלקים: 1. הקדמה כללית להדמיה in-vivo : שיטות הדמיה (MRI, PET, US, SPECT ו-CT), מדדים כמותיים ושיטות עיבוד תמונה סטטיסטיות – כ-4 שיעורים. 2. בחלקו השני של הקורס כל שיעור יוקדש למחלה ספציפית בה יוצגו בשעה הראשונה מחלה נוירודגנרטיבית ותסמיניה, הפתולוגיה הידועה, מודלים בבע”ח. בשעה השנייה יוצגו הממצאים מהדמיה והקשר שלהם לפתולוגיה הידועה ולתסמינים. יעשה דיון ברלוונטיות של המודל בבע”ח למחלה בבני אדם. בין המחלות שיתוארו: שבץ, טרשת נפצה, דמנציה (אלצהיימר), פרקינסון וסכיזופרניה. ד. מטרות הקורס: 1. לדעת מהן שיטות ההדמיה המאפשרות אפיון של מחלות נוירודגנרטיביות 2. איך ניתן לאפיין שינויים מורפולוגיים ברקמה בעזרת הדמיה נמחלות נוירודגנרטיביות 3. איך ניתן לאפיין שינויים פיסיולוגיים ותפקודיים במחלות נוירודגנרטיביות 4. איך מתבטאים תהליכים פתולוגיים ספציפיים בהדמיה |
| דרישות קדם: נוירואנטומיה (חובה) מבוא לנוירוביולוגיה (עדיף, לא חובה) מיפוי המוח ב MRI (עדיף) נוכחות חובה |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| איתותים מולקולרים בתהליכי חלוקה התמינות ואפופטוזיס (0455.3798) SIGNALING PATHWAYS CONTROLLING CELL DIFFERENTIATION, CELLGROWTH AND APOPTOSIS |
| פרטי הקורס |
| • כיצד מקבל התא אותות מהסביבה? • אילו קולטנים ( רצפטורים) ומשרנים ( ליגנדים) מתווכים העברת אותות. • מבנה מולקולרי של קולטנים ומשרנים ממשפחות שונות • רצפטורים עם פעילות אנזימתית • רצפטורים מצומדי חלבוני –G • מנגנוני העברת אותות המבקרים תהליכי חלוקה,התמיינות ונדידת תאים. • מות ( אפופטוזוס) והשרדות של תאים : מנגנון תהליך האפופטוזיס ; השראת אפופטוזיס ע”י קולטנים ( משפחת Bcl , משפחת הקספאזות, תפקיד המטוכונדריה בתהליך); מנגנונים להשרדות תאים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אנליזה גנטית של ההתפתחות (0455.3039) GENETIC ANALYSIS OF DEVELOPMENT |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק בגישות שונות המשלבות גנטיקה וביולוגיה מולקולרית לחקר נושאים שונים בהתפתחותץ אורגניזם המודל יהיה בדרך כלל דרוזופילה. ייבחרו מספר נושאים (לדוגמה: קביעת הצירים בעובר ; תרומה אימהית לעומת זיגוטית ; גרדיינטים מורפוגנטיים; pattern formation ; אינטראקציות בין תאים בהתפתחות. תודגש חשיבותם להבנת מחלות שונות באדם, למשל סרטן ומחלות נוירודגנרטיביות) והם יוצגו בהרצאות מבוא שלאחריהן. בכל שבוע יקראו כל התלמידים מאמר או שניים נבחרים בנושא , ותלמיד אחד או שניים יציגו אותם ויפתחו לאחר מכן דיון בהם. |
| הרכב ציון: הציון יינתן עפ”י השתתפות פעילה והרצאת המאמר. |
| אקוטוקסיקולוגיה של החי והצומח (0455.3022) ECOTOXICOLOGY |
| פרטי הקורס |
| • דרכי הספיגה, התפלגות ברקמות והמטבוליזם של הכימיקלים התעשייתיים, הרפואיים והחקלאיים שלשייריהם נחשף האדם בסביבה האורבנית, וחיות הבר בהיבט הטבעי. • תגובת הגומלין המורכבת של כימיקלים אלה עם מקרומולקולות ועם מערכות הדטוקסיפיקציה האנזימטיות של חסרי חוליות, דגים, ציפורים ויונקים. • הקבוצות העיקריות של חומרי ההדברה, דרכי פעולתם והמטבוליזם שלהם בבעלי חיים. • השפעת חומרי ההדברה על בריאות האדם, שרשרת המזון ביבשה ובים, והישרדות חיות הבר. • פיתוח שיטות ביוכימיות לניטור איכות הסביבה הימית והיבשתית. • פיתוח שיטות הדברה בררניות כגון שימוש ברעלנים בקטריאלים ופיזור אוכלוסיה מעוקרת של מזיקים חקלאיים כדרכים להקטנת זיהום הסביבה בכימיקלים רעילים. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אקולוגיה (0455.1809) Ecology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יהיה מורכב מ- 4 חטיבות: • מבוא לביוגיאוגרפיה ולביולוגיה אורגניזמלית • אקולוגיה של אוכלוסיות • אקולוגיה של חברות ומערכות אקולוגיות • האדם ומקומו במערכת האקולוגית. |
| הרכב ציון: הציון הסופי יקבע לפי הבחינה בכתב |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Krebs, C.J. Ecology: The Experimental Analysis of Distribution and Abundance, 4th Edn., 2001 , Harper Collins College Publishers, Inc., NY. Begon, M., C.R. Townsend, and J.L. Harper.. Ecology: Individuals, Populations, and Communities, 4th edition, 2006, Blackwell Scientific Publications, Cambridge. Ricklefs, R.E., and M.L. Miller. Ecology, 4th edition, 1999, W.H. Freeman & Co., New York. |
| אקולוגיה התנהגותית של חרקים (0455.3380) BEHAVIORAL ECOLOGY OF INSECTS |
| פרטי הקורס |
| • הקורס ידון בבסיס האקולוגי והאבולוציוני של התנהגות בחרקים • אקולוגיה פונקציונלית של חרקים: מיקומם בשרשרת המזון; מגבלות ומעלות של גודל ומסה; אסטרטגיות התרבות ומדידתן. • עקרונות ומודלים של אקולוגיה התנהגותית: תאורית האופטימיזציה ואסטרטגיות אבולוציוניות יציבות • יחסי הגומלין בין חרקים וצמחים ובין חרקים לבין עצמם: הישרדות וטפילות; חרקים בשרשרת המזון החקלאית • אסטרטגיות רבייה בחרקים: הצלחה רבייתית והקונפליקט בין זכר ונקבה; תחרות בין זכרית, תחרות זרע, ברירה מינית, ואבולוציה של סימני מין משניים בזכרים • הדאגה לצאצאים כשער לחברתיות בחרקים • הבסיס האבולוציוני של שיתוף פעולה וחברתיות בחרקים: דילמת האסיר וברירת קרובים; שיתוף פעולה כאסטרטגיה אבולוציונית יציבה; המסלולים האלטרנטיביים להתפתחות חברתיות אמיתית בדבוראים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אקולוגיה ופאוניסטיקה של הים התיכון (0455.3014) ECOLOGY AND FAUNISTICS OF THE MEDITERRANEAN |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: • מבוא כללי בביולוגיה ימית. • הים התיכון, מבנה, תנאים אקולוגיים, מאזן מים. • מבנה בתי הגידול הימיים וטיפוסי החברות שבהם. • ביוגיאוגרפיה של החי בים התיכון. • הכרת חברות בעלי החיים במזרח הים התיכון. • שיטות באנליזה של חברות ימיות. • בעלי חיים ימיים כאינדיקטורים לתנאים סביבתיים. בחלקו הראשון של הקורס יינתנו הרצאות וחלקו השני יתנהל כסדנה שבה יגיש כל תלמיד סמינריון שלאחריו יערך דיון. |
| הרכב ציון: חציו הראשון של הקורס הוא הרצאות וחציו השני סניריונים המוגשים על ידי תלמידי הקורס. כל תלמיד חייב בהגשת סמינריון בנושא שיקבע על ידי המרצה. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אקולוגיה של הצומח בא"י (0455.2809) ECOLOGY OF THE FLORA OF ISRAEL |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס ”אקולוגיה של צומח ארץ ישראל” להקנות לתלמיד ידע על חברות הצומח העיקריות של ישראל והבנת הגורמים המשפיעים על תפוצה של חברות הצומח בארץ-ישראל. המטרות הספציפיות של הקורס הן: • להקנות הכרת הצומח של ארץ-ישראל בבית גידולו. • להקנות הכרת האקולוגיה והביולוגיה של המינים המאפיינים הנופים השונים בישראל • הבנת השפעת גורמים הביוטים [קרקע, אקלים, כו’] וביוטים [תחרות, רעייה, כו’] על התפוצה של צומח ארץ ישראל. הקורס יתבסס על פעילויות שיתבצעו בכיתה ובסיורים שונים ברחבי הארץ. מרכיבי הקורס העיקריים כוללים: הרצאות פרונטליות [כ- 30 שעות], סיורים [5.5 ימים] , קריאת מאמרים, דיונים בכיתה. נושאי ההרצאות: • חברת צמחים והגדרתה – הקדמה בנושאי פיטוגיאוגרפיה • השפעות גורמי מיסלע, קרקע ואקלים על תפוצת צמחים וחברות צמחים בישראל • חבלי צמחייה של ישראל • תהליכי סוקצסיה ראשונית ומשנית [סלע, שריפה, עיבוד חקלאי] • חברות הצמחים של חבל הים התיכוני, האירנו-טורני, הסהרו-ערבי והסודני סיורים • תרגיל בהכרות צורות החיים והגדרת חברות צמחים בגן הבוטני [חצי יום] • צומח החולות והקרקעות הקלות של מישור החוף • צומח של דרום השפלה, צפון הנגב והר הנגב • צומח של השפלת יהודה והרי יהודה • הצומח של הכרמל וגליל המערבי |
| דרישות קדם: בוטניקה מורחב נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הקורס יתבסס על פעילויות שיתבצעו בכתה ובסיורים שונים ברחבי הארץ. מרכיבי הקורס העיקריים כוללים: הרצאות פרונטליות סיורים (5 ימים) קריאת מאמרים דיונים בכתה ובשדה הערכה של התלמיד/ה: הציון הסופי של הקורס ייקבע על פי בחינת הסיום (80%), דו\\\\\\\\”ח על דוחות סיורים ( 15%) והשתתפות בדיוני הכתה וסיורים (5%).נוכחות בסיורים חובה!! |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| אקולוגיה של צמחים (0455.3822) PLANT ECOLOGY |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס ”אקולוגיה של צמחים” להקנות לתלמיד תשתית ידע וכלי מחקר הדרושים להבנת האקולוגיה של אוכלוסיות וחברות צמחים. המטרות הספציפיות של הקורס הן: • להקנות בסיס תיאורטי וכלי חשיבה להבנה של הגורמים המשפיעים על המבנה והדינמיקה של אוכלוסיות וחברות צמחים. • להציג ידע אמפירי המתייחס לעקרונות התיאורטיים הנלמדים. • להקנות כלים מתודולוגיים בסיסיים הדרושים להבנה וביצוע של מחקרים באקולוגיה של צמחים. הקורס יתבסס על מגוון של פעילויות שיתבצעו בכיתה, בחממה, בכיתת מחשבים ובשדה. מרכיבי הקורס העיקריים כוללים: • הרצאות פרונטליות • קריאת מאמרים • דיונים בכיתה • ניסוי חממה • מעבדת שדה • מעבדות מחשב ותרגילי ניתוח נתונים • הצגה של פרויקטים ע”י מרצים אורחים |
| דרישות קדם: דרישות מוקדמות – אקולוגיה נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הציון הסופי של הקורס ייקבע על פי בחינת הסיום (65%), דו\\\\\\\\”ח על ניסוי החממה ( 10%), דו\\\\\\\\”ח על מעבדת השדה (10%), תרגילי מחשב (10%) והשתתפות בדיוני הכתה – מאמרים (5%). |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Plant Ecology by Michael Crawley- Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology by Chapin, Matson and Mooney |
| ביואלקטרוכימיה (0455.3388) BIOELECTROCHEMISTRY AND BIOSENSORS |
| פרטי הקורס |
| עקרונות באלקטרוכימיה בסיסית, מדידות מתח ומדידות זרם, טרנספורט, שימושים אנליטיים, מערכות רדוקס ביוולוגיות,ביוסנסורים אלקטרוכימיים, מערכות מצומדות ומערכות קטליטיות, אלקטרודות אנזימטיות, מערכות ביוקטליטיות נוספות,תאי דלק ביולוגיים, מערכות דטקציה של הכרה ביולוגית, ביוסנסורים אופטיים ופיאזואלקטריים. |
| הרכב ציון: הרצאה או עבודה |
| ביוטכנולוגיה בצמחים (0455.3462) Plant Biotechnology |
| פרטי הקורס |
| ביוטכנולוגיה בצמחים לתלמידי ביוטכנולוגיה 1. הגנומים הצמחיים והאינטראקציה ביניהם. 2. יישומים ביוטכנולוגיים של כלים גנומיים ומולקולריים בשמרים ופטריות. 3. אסטרטגיות מולקולריות במחקר ביוטכנולוגי בצמחים: • הינדוס גנים זרים לביטוי בצמחים • מוטגנזה: T-DNA , transposons • הפעלה של גנים ייחודית לרקמה וכתגובה לתנאים חיצוניים • השתקה של גנים: מנגנוןsiRNA, RNAi ו- miRNA ותפקידם. • זיהוי אינטראקציה בין פרומוטורים ופקטורי שעתוק וכזאת המתרחשת בין חלבונים • הוצאה של טרנסגניים מצמחים (בעיקר ע”י גישות של רקומבינציה)ויצירה של צמחים טרנסגניים ללא גנים המקקדים לעמידות לחומרים אנטיביוטיים 4. גישות של metabolomics Proteomics, Genomics להבנת שינויים הקורים בתאים ול- gene discovery 5. צמחים טרנסגניים לשימושים ביוטכנולוגיים: שיפור מזון, להשבחה מודרנית, בשרות הרפואה (כגון ליצירת נוגדנים, חיסונים וחלבונים בעלי ערך רפואי אחרים), ליצירת עמידות לפגעי טבע ולפתוגנים. |
| דרישות קדם: ידע בביולוגיה מולקולרית וגנטיקה נוכחות חובה |
| הרכב ציון: נוכחות חובה, חזרה על החומר הנלמד וקריאה מראש של מאמרים המופיעים באתר ואלו שהם מאמרי חובה לבחינה |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| ספרות: המאמרים המעודכנים יומלצו במהלך הקורס ויוזכרו במצגות |
| ביוכימיה - אנזימולוגיה ומטבוליזם (0455.2548) Biochemistry-Enzymology and Metabolism |
| פרטי הקורס |
| • מבוא לביוכימיה ומולקולות ביולוגיות (כולל: חלבונים, סוכרים, ליפידים וחומצות גרעין) • מבנה המים, חומצה, בסיס, PH , PK, הידרופוביות והידרופיליות • מבוא לחומצות אמיניות וחלבונים • תכונות של חומצות אמיניות, אמפוטריות, ריאקציות אופיניות • זיהוי אפיון ובדוד של חומצות אמיניות, כרומטוגרפיה שיטות הפרדה • מבנה ראשוני, שניוני, שלישוני ורביעוני של חלבונים • אלוסטריה, המוגלובין • בדוד חלבונים ואפיונם • מבוא לאנזימטיקה: קינטיקה אנזימטית, אנרגית אקטיבציה, ריאקציות מסדר אפס, ראשון ושני • אנליזה של קינטיקה אנזימטית , KM, V max • עיכוב של אנזימים. עיכוב תחרותי ובלתי תחרותי. עיכוב בלתי הפיך • גורמים המשפיעים על פעילות אנזימטית: PH, טמפרטורה, יונים, מעכבים ספציפיים של אנזימים. מנגנון הפעילות של כימוטריפסין • רגולציה של פעילות אנזימטית: אנזימים אלוסטריים, מודיפיקציה קוולנטית • מבוא לביוארגטיקה: תרמודינמיקה וישום לביוכימיה. מבוא למטבוליזם • מבנה סוכרים, פרוק וביוסינטזה של רב סוכרים, גליקוליזה • מעגל Krebs • גלוקונאוגנזה, מעגל הפנטוזות • ליפידים: תפקיד, מיון ומבנה: מטבוליזם של חומצות שומן, שעוות, אצילגליצרולים (טריאצילגליצרולים) ופוספוליפידים ספינגוליפידים, ליפידים פשוטים, טרפנים, סטרואידים (סטרולים) • מבנה ממברנות: ליפידים בממברנות - bilayer ותכונותיו. חלבונים בממברנות: פריפרליים ואינטגרלים. דטרגנטים אורינטציה, פלואידיות. חלבוני מודל. מודלים של מבנה ממברנות • מבנה מיטוכונדריה, חמצון-חיזור ושרשרת הנשימה • פוספורילציה אוקסידטיבית ופוטפוספורילציה • מערכות טרנספורט: מפל אלקטרוכימי, פוטנציאל ממברנה, סוגי טרנספורט, פסיבי, אקטיבי, משאבות: facilitated diffusion נשאים. • Na K-ATPase, Ca ATPase טרנספורט אקטיבי המונע ע”י מפלי יונים • Na-K-ATPase • יונופורים. בקטריורודופסין, רודופסין ראיה. • מטבוליזם של ליפידים: פרוק וביוסינטזה, עיכול שומנים ליפופרוטאינים בקרה הורמונלית. • מטבוליזם של חנקן אורגני: מעגל האוריאה, פירוק חומצות אמיניות. • טרנסדוקציה של סיגנלים לתוך התא • אינטגרציה של תהליכים מטבוליים. |
| הרכב ציון: הרכב ציון הסופי: בחינה סופית 80% שני בחנים 20% תלמיד אשר לא יגיש לפחות 80% מהתרגילים במועדם - לא יורשה לגשת לבחינה הסופית |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: L. Stryer Biochemistry Principles of Biochemistry - Lehninger מהדורה אחרונה |
| ביוכימיה מעבדה (0455.2665) Biochemistry Laboratory |
| פרטי הקורס |
| קינטיקה אנזימטית, פגישה אחת Butyryl choline esterase כמודל ללימוד קינטיקה אנזימטית: 1. קביעה של קבוע מיכלאיס-מנטן Km ושל המהירות המירבית Vmax על ידי שימוש בנתונים מגרף רציפקוקאלי לפי Lineweaver Burke 2. אפיון עיכוב תחרותי של האנזים ע”י הסם ההלוצינוגני phencyclidine וקביעה של קבוע העיכוב Ki 3.שימוש ברגרסיה לא לינארית לקביעת Ki, Vmax, Km 4. רכישת נסיון בשימוש ב-microplate reader, ספקטרופוטומטר המאפשר מדידה בו זמנית של 96 ריאקציות. הפרדת חלבונים מתערובת ואפיונם, שתי פגישות הפרדת ליזוזים ואובומוקואיד מתערובת ע”י כרומטוגרפיה של החלפת יונים ]ion exchange[ ואפיונם: 1.קביעת הפעילות האנזימטית של ליזוזים 2.עיכוב של פעילות האנזים הפרוטאוליטי טריפסין על ידי אובומוקואיד מחלבון ביצה 3.קביעת המסה המולקולרית של חלבונים על ידי אלקטרופורזה בגל פוליאקרילאמיד בנוכחות דטרגנט בתנאים דנטורטיבים Polyacrylamide gel electrophoresis, PAGE 4. הקניית המושגים יחידת פעילות אנזימטית, פעילות ספציפית, דרגת נקוי, ניצולת. 5. לימוד המעלות והחסרונות של שיטות שונות לקביעת ריכוז חלבון. ביוסינתזה של שומנים , פגישה אחת שימוש בחומצת חומץ מסומנת ב-14Cבמעקב אחרי מסלול מטבולי 1. יצירה של חומצות שומן ע”י אנזימים מסיסים מכבד חולדה 2. אינקורפורציה של חומצות שומן לגליצרידים ופוספוליפידים ע”י אנזימים ממברנאלים מכבד חולדה. 3.זיהוי וקביעה כמותית של תוצרי המסלול הביוסינתטי ע”י כרומוטוגרפיה ברבדים דקים. השימוש במונה קרינת beta ו-phosphorimager. 4. עיכוב ביוסינתזה של ליפידים ע’’י DHEA, הורמון מונע השמנה. 5. הקניית כללי בטיחות והרגלי עבודה בשימוש בחמר רדיואקטיבי. שיעתוק Transcription, פגישה אחת יצירת RNA על תבנית של DNA ואפיון תוצרי השעתוק 1.שיעתוק סימולטני של שני רצפי DNA הנשלטים כל אחד על ידי פרומוטר ייחודי, על ידי T3 RNA polymerase ו-T7 RNA polymerase . 2.בידוד תוצרי השיעתוק ואפיונם לפי אורכם ע”י אלקטרופורזה בגל אגארוז. 3. אפיון תוצרי השיעתוק על ידי היברידיזציה עם אוליגונוקלאוטידים סינתטים מסומנים בביוטין ]Northern blots[ 4. גילוי חומצות גרעין בשיטת Enhanced Chemiluminescence, ECL 5. גילוי, זיהוי ואפיון של DNA ותוצרי השיעתוק שלו בג’ל על ידי שימוש בגלאים פלורסצנטים הבולעים אור אינרא אדום ]IRdye, Odissey infrared imager[ אינדוקציה של גן זר Transgene, פגישה אחת ערור הביטוי של גן המקודד לאנזים gama-glutamyl transpeptidase מאדם, הנמצא תחת בקרה של הפרומוטר ל- metallothioneine מכבש, שהוכנס לתאי עכבר. 1.אינדוקציה של הטראנסגן ע”י אבץ. 2.קביעת הפעילות הספציפית של האנזים כפונקציה של ריכוז המשרן 3.קביעת מיקום האנזים בממברנת התא. 4.זיהוי האנזים בחתכי כלית עכבר בגל ע”י צביעה היסטוכימית המבוססת על הפעילות האנזימטית. תחילת הקורס בשבוע הראשון של סמסטר ב’ בתחילת כל שבוע יתקיים שיעור פרונטאלי כהקדמה למעבדה של אותו שבוע. בקורס שבע פגישות בלבד. הכנת המעבדות מסובכת ויקרה. לפיכך, הכלל של עזיבת הקורס בשבועיים הראשונים של הסמסטר אינו חל על הקורס הזה. וחיסורים, למעט אלה הנובעים ממחלה או מילואים יפגעו בציון הסופי. |
| דרישות קדם: . נוכחות חובה |
| הרכב ציון: מטרות המעבדה: הקניית מושגי יסוד,ידע ומיומנות בעבודה כמותית במעבדה ביולוגית. הקניית מיומנות בניתוח תוצאות והסקת מסקנות מטרה מרכזית היא הקניית ידע ומיומנות בכתיבת טקסט מדעי ]דו”ח מעבדה[ הרכב הציון: דו’’ח 65% הערכת המדריכות/מדריכים 35% הערכת העבודה: היחס לעבודה, סדר בעבודה, טיב התוצאות, מענה על שאלות בעל פה |
| ספרות: ספרי ביוכימיה בספריה: הדפים הרלוונטים מצוינים בחוברת המעבדה |
| ביולוגיה התפתחותית (0455.3063) Developmental Biology |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס בביולוגיה התפתחותית היא הקניית הבסיס הרחב ביותר להבנת תהליכי התפתחות עוברית בבעלי חיים ובצמחים. הקורס בנוי באופן שמלמד את עקרונות ויסודות תהליכי ההתפתחות העוברית בעיקר בבעלי חיים, ומתמקד על הקשר האבולוציוני בניהם. בקורס נלמדים תהליכי יסוד כיצירת תאי המין, ההפריה, ההתלמות, הגסטרולציה והאורגנוגנזה בשיטה השוואתית בין בעלי חיים שונים. דגש מיוחד מושם על הקשר בין האונטוגנזנה והפילוגנזה בתהליכי ההתפתחות. כן נלמד על ההיבטים המולקולרים של תהליכי התפתחות, ובעיקר של מערכת העצבים. נושאי הקורס: מבוא לביולוגיה התפתחותית התפתחות תאי המין (זרע וביצית) תהליך ההפריה התפתחות בצמחים תהליכי ההתלמות תהליכי הגסטרולציה אורגנוגנזה התפתחות בנמטודה ציטופלסמה ייחודית אינדוקציה עוברית אמבריולוגיה ניסויית דגמי התפתחות ורגנרציה היבטים מולקולרים בהתפתחות מערכת העצבים כמודל." הקורס ניתן על ידי פרופ' לילי ורדימון (מרכזת) , ד"ר עודד כנר ומרצים אורחים |
| הרכב ציון: מבחן סופי 100% נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: ספר הלימוד העיקרי בקורס הוא: Devlopmental Biology Gilbert S.F Sinauer 8th editions (2007) |
| ביולוגיה התפתחותית של צמחים (0455.3047) Developmental Plant Biology |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס: ללמד התפתחות וביולוגיה של צמחים תוך התמקדות במבנה, התמיינות, תפקוד, מנגנוני בקרה הורמונליים, ביוכימיים ומולקולריים מרמת התא עד הצמח השלם, זאת תוך שילוב גישות מחקריות שונות הנדרשות למחקר מודרני. נושאי הקורס: מנגנונים לקביעת הפולריות בתאים וברקמות צמחיות, מערכת ההפרשה התאית והשלד התוך תאי ותפקידם בקביעת הצורה של התא הצמחי. חלבונים שמבקרים פולריות בתאים. המנגנון המולקולרי להובלת אוקסין בין תאים, רקמות ואברים, ותפקידיו בצמח השלם ובתגובותיו לתנאי סביבה. בקרת גנים ע”י אוקסין. מריסטמות וארגון הנצר והשורש. תקשורת הורמונלית בין מריסטמות קודקודיות. תאים נורמליים לעומת תאים סרטניים, בקרתם ההורמונלית, מבנה רקמות בוגרות ומבנה עפצים, ובקרה על התפתחותם. מנגנונים מולקולריים שמבקרים זהות מריסטמה ומנגנונים הקובעים גודל תאים ברקמה. גנים המבקרים התפתחות מריסטמות, מעבר לפריחה עד סיום שלב המריסטמה. אבולוציה של עלים, התפתחות וקביעת הסימטריה בפרחים. מבנה והתפתחות של רקמות ההובלה. הובלה פולרית של אוקסין ותפקידיה בבקרת ההתפתחות של רקמות הובלה. היוצרות מערכות ההובלה בעלים, גבעולים ושורשים. מנגנונים הורמונליים, בהם מעורבים: אוקסין, ציטוקינין, גיברלין, אתילן, המכוונים דיפרנציאציה של תאים ברקמות הובלה. מערכות ההובלה, ארכיטקטורה, וביולוגיה של עצים. |
| דרישות קדם: ההוראה בקורס תתבסס על ידע מוקדם מהקורסים הבאים: מבוא למדעי הצמח – שנה א’, פיסיולוגיה של הצמח – שנה ב’, ביולוגיה של התא – שנה א’, גנטיקה – שנה ב’, ביוכימיה א’ ו-ב’ – שנה ב’, או קורסים מקבילים. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: השתתפות בשעורים ובבחינה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: 1. Raven, Evert and Eichhorn 2005 Biology of Plants 2. Davies 2004 Plant Hormones: Biosynthesis, Signal Transduction, Action 3. Leyser and Day 2003 Mechanisms in Plant Development 4. Taiz and Zeiger 2006 Plant Physiology 5. Buchanan, Gruissem and Jones 2000 Biochemistry and Molecular Biology of Plants 6. Evert 2006 Esau’s Plant Anatomy 7. Selected articles |
| ביולוגיה ימית (0455.3053) Marine Biology |
| פרטי הקורס |
| מעל 70% מפני כדור הארץ מכוסים בימים ובאוקיאנוסים בעומק ממוצע של מעל 2000 מ’. האוקיאנוסים מהווים שטח ונפח של בתי גידול הגדול בהרבה מזה שעל פני כל היבשות. חלק משמעותי ביותר מכלל אוכלוסיית האדם על פני כדור הארץ מתגורר לאורך החופים ונהנה ממשאבים שונים שהים מספק. הכלכלה של מדינות רבות מושתת על הים ובעיקר של שירותים ומשאבים שונים שהים מספק, כמו בתחום המזון, תובלה, תיירות, נופש, תרבות ופולקלור. הצפיפות ההולכת וגוברת של אוכלוסיית האדם לאורך החופים יוצרת לחצים סביבתיים ובעקבותיהם, לעיתים קרובות, נגרמת פגיעה באקוסיסטמות החופיות. לחצים אלה נגרמים בעקבות בנייה מאסיבית, פיתוח נמלים, תעשיות מזהמות, קידוחים ימיים, יבוש מקטעי ים, בנית איים מלאכותיים ומבנים אחרים כמו שוברי גלים ומזחים. הפגיעה בימים בכלל ובאזורים חופיים בפרט, החמירה לאחרונה, וזאת עקב שינויים גלובליים המביאים להתחממות מי הים ועליה בשיעור החומציות שלהם. בנוסף תרחישים של עלית מפלס מי הים ואירועי מזג אויר קיצוני, המלווים את השינויים הגלובליים, צפויים לגרום לפגיעות נוספות בסביבה החופית. הקורס עוסק בתחומים שצוינו לעיל ובמסגרתו תיעשה לסטודנטים היכרות עם מגוון בתי גידול ימיים והאורגניזמים החיים בהם, מאזור הכרית (גאות ושפל) ועד לים העמוק. דגש יושם על התאמות האורגניזמים השונים לסביבת חיים שונות בעיקר באזור החופי בימים טרופיים, ממוזגים וקרים הן מבחינה מבנית והן מבחינה תפקודית. ישום דגש על לימוד דוגמאות מחופי הארץ, הים התיכון וראש מפרץ אילת. יושם דגש על תופעות גלובליות בימים, גם תוך כדי התייחסות מיוחדת לרלוונטיות שלהם לחופי הארץ. בקורס יילמדו בין השאר הנושאים הבאים: • ההרכב הכימי והתכונות הפיזיקליות של מי הים ובתי גידול ימיים נבחרים. • קבוצות של אורגניזמים ימיים: מיקרואורגניזמים, צמחים, חסרי חוליות ובעלי חוליות. • מארג מזון בים וגישות מחקריות ללימוד שרשרות מזון. • דוגמאות לבתי גידול ימיים אופייניים והתאמות קבוצות האורגניזמים לאקוסיסטמות בהן הם חיים. • מערכות סימביוזה בקרב אורגניזמים ימיים. • ביוטכנולוגיה ימית – היבטים כלכליים ורפואיים של אורגניזמים ימיים. • ייצור ראשוני בים – פוטוסינטזה בפיטופלנקטון , אצות ועשבי ים. |
| הרכב ציון: הקורס כולל הרצאות המזכות ב 3 ש"ס וסיור המזכה ב – 1 ש"ס נוספת. מספר המקומות בסיור מוגבל ל- 48 תלמידים. ראה גם "ביולוגיה ימית – תרגיל: שימוש במודלים איכותיים במחקר הימי" המזכה ב 1 ש"ס. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ביולוגיה ימית - סיור (0455.3823) Marine Biology |
| פרטי הקורס |
| מרכז הקורס: פרופ' יהודה בניהו מעל 70% מפני כדור הארץ מכוסים בימים ובאוקיאנוסים בעומק ממוצע של מעל 2000 מ’. האוקיאנוסים מהווים שטח ונפח של בתי גידול הגדול בהרבה מזה שעל פני כל היבשות. חלק משמעותי ביותר מכלל אוכלוסיית האדם על פני כדור הארץ מתגורר לאורך החופים ונהנה ממשאבים שונים שהים מספק. הכלכלה של מדינות רבות מושתת על הים ובעיקר של שירותים ומשאבים שונים שהים מספק, כמו בתחום המזון, תובלה, תיירות, נופש, תרבות ופולקלור. הצפיפות ההולכת וגוברת של אוכלוסיית האדם לאורך החופים יוצרת לחצים סביבתיים ובעקבותיהם, לעיתים קרובות, נגרמת פגיעה באקוסיסטמות החופיות. לחצים אלה נגרמים בעקבות בנייה מאסיבית, פיתוח נמלים, תעשיות מזהמות, קידוחים ימיים, יבוש מקטעי ים, בנית איים מלאכותיים ומבנים אחרים כמו שוברי גלים ומזחים. הפגיעה בימים בכלל ובאזורים חופיים בפרט, החמירה לאחרונה, וזאת עקב שינויים גלובליים המביאים להתחממות מי הים ועליה בשיעור החומציות שלהם. בנוסף תרחישים של עלית מפלס מי הים ואירועי מזג אויר קיצוני, המלווים את השינויים הגלובליים, צפויים לגרום לפגיעות נוספות בסביבה החופית. הקורס עוסק בתחומים שצוינו לעיל ובמסגרתו תיעשה לסטודנטים היכרות עם מגוון בתי גידול ימיים והאורגניזמים החיים בהם, מאזור הכרית (גאות ושפל) ועד לים העמוק. דגש יושם על התאמות האורגניזמים השונים לסביבת חיים שונות בעיקר באזור החופי בימים טרופיים, ממוזגים וקרים הן מבחינה מבנית והן מבחינה תפקודית. ישום דגש על לימוד דוגמאות מחופי הארץ, הים התיכון וראש מפרץ אילת. יושם דגש על תופעות גלובליות בימים, גם תוך כדי התייחסות מיוחדת לרלוונטיות שלהם לחופי הארץ. בקורס יילמדו בין השאר הנושאים הבאים: • ההרכב הכימי והתכונות הפיזיקליות של מי הים ובתי גידול ימיים נבחרים. • קבוצות של אורגניזמים ימיים: מיקרואורגניזמים, צמחים, חסרי חוליות ובעלי חוליות. • מארג מזון בים וגישות מחקריות ללימוד שרשרות מזון. • דוגמאות לבתי גידול ימיים אופייניים והתאמות קבוצות האורגניזמים לאקוסיסטמות בהן הם חיים. • מערכות סימביוזה בקרב אורגניזמים ימיים. • ביוטכנולוגיה ימית – היבטים כלכליים ורפואיים של אורגניזמים ימיים. • ייצור ראשוני בים – פוטוסינטזה בפיטופלנקטון , אצות ועשבי ים. הרכב ציון: בחינה 100% הקורס כולל הרצאות המזכות ב 3 ש"ס וסיור המזכה ב – 1 ש"ס נוספת. מספר המקומות בסיור מוגבל ל- 48 תלמידים. ראה גם "ביולוגיה ימית – תרגיל: שימוש במודלים איכותיים במחקר הימי" המזכה ב 1 ש"ס. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ביולוגיה ימית - תרגיל (0455.3829) Marine Biology - Targil |
| פרטי הקורס |
| פרופ' יהודה בניהו, דרור צוראל ומשה לייבה הסקה איכותית (Qualitative Reasoning) הינה גישה, אשר תופסת תאוצה בשנים האחרונות ומאפשרת לבחון מערכות שונות דרך מודלים ממוחשבים. בתרגיל נבחן בעזרת מודלים אלו את מערכת שונית האלמוגים ואיזור הגאות והשפל ויחסי הגומלין בין בעלי החיים הנמצאים בהן לבין גורמים סביבתיים. הדבר יעשה תוך שימוש בתוכנה חדשנית בעזרתה נלמד כיצד לבנות מודלים וכיצד להשתמש בהם על מנת לחזות השפעות אפשריות של גורמים שונים על הסביבה הימית. התרגיל מתבסס על חומר הנלמד בקורס ביולוגיה ימית שמהווה דרישה מוקדמת להשתתפות בו והוא מורכב מעבודה מודרכת בחדר המחשבים במהלך שבעה מפגשים, כ"א באורך של שעתיים, שיתקיימו במחצית השנייה של הסימסטר הראשון (תש"ע). לקראת המפגש האחרון, יתחלקו הסטודנטים לקבוצות עבודה קטנות, יציגו בעזרת מצגת קצרה מודל שיבנו ותוגש עבודה בכתב שעל פיהן ייקבע הציון בתרגיל. מספר התלמידים מוגבל ל- 20 |
| מס תלמידים: 20 |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| ביולוגיה מולקולרית של מחלות מדבקות ממקור חיידקי (0455.3032) MOLECULAR BIOLOGY OF INFECTIOUS DISEASES FROM BACTERIAL ORIGIN |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס היא הכרת אסטרטגיות שונות שבהם משתמשים חיידקים פתוגנים כדי להתגבר על מנגנוני ההגנה של תאי המאכסן. במהלך הקורס יתוארו לעומק מספר מערכות של חיידקים פתוגנים הומניים כגון: Yersinia, Listeria, Helicobacter, Bordetella, Legionella, Vibrio, Salmonella . יתוארו בפירוט הגנים הקשורים בפתוגניות של חיידקים אלו, ותפקידם של תוצרי גנים אלו במהלך ההדבקה והתרבות החיידק במאכסן. בנוסף יתוארו שיטות מולקולריות (כגון in-vivo expression technology, signature tagged mutagenesis, genomic subtraction) שבעזרתן נמצאו גנים וירולנטיים, וכן השימוש באינפורמציה של רצפי גנומים שלמים למציאת גנים הקשורים במערכות פתוגניות. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ביולוגיה של מערכות (0455.3466) Genomics, Proteomics and Systems Biology |
| פרטי הקורס |
| עם השלמת ריצוף הגנום של מספר גדול של אורגניזמים, ניתן היום לחקור שאלות ביולוגיות ברמת הגנום השלם. בקורס נלמד על השיטות החדישות הנקראות : GENOMICS ו- PROTEOMICS .נלמד על DNA microarrays , נלמד גם על שימוש במחשבים על מנת לאתר גנים ולחקור את ביטויים. הקורס מתבסס על קריאת מאמרים ודיון בהם. |
| הרכב ציון: הציון יינתן עפ”י השתתפות פעילה |
| ביופיזיקה מולקולרית (0455.3673) MOLECULAR BIOPHYSIVS |
| פרטי הקורס |
| תהליכים פיזיולוגים מתרחשים על פרקי זמן ארוכים בסדרי גודל מזמן ההתרחשות ברמה מולקולרית. הקורס יטפל במעבר שבין האירוע המולקולרי לבין השתקפותו המיקרוסקופית תוך בחירת נושאים מאפיינים. |
| מטלת סיום: מבחן בית |
| בקרה אנדוקרינית (0455.3051) ENDOCRINE REGULATION |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס: להקנות לתלמידים את המושגים הקשורים בבקרה אנדוקרינית, האבולוציה והתפתחות של הבלוטות האנדוקריניות בחולייתנים ; הבקרה ואופן היצור, ההפרשה, הפעולה והפירוק המטבולי של הורמונים; מעורבותם של הורמונים במערכות פיסיולוגיות שונות. הנושאים העיקריים בהם יעסוק הקורס (לא כל בנושאים ילמדו בכל שנה): • בלוטת יותרת המוח [היפופיזה] וההורמונים המופרשים ממנה. • הציר היפותלמוס-היפופיזה-גונדות ובקרת רבייה • הפעילויות השונות של פפטידים היפותלמיים • שיטות זיהוי ומדידת הורמונים • בלוטת המגן • הפיקוח האנדוקריני על המטבוליזם של סידן • הלבלב ומטבוליזם של גלוקוז • בקרת צריכת מזון • בלוטת האדרנל, פיקוח על מלחים, אנרגיה ו- stress • בלוטת האצטרובל, מלטונין ומעורבותו בשעון הביולוגי |
| דרישות קדם: הקורס מוצע לסל האורגניזמי והמולקולרי במסגרת קורסי חובת בחירה לתלמידי תואר ראשון, שנה ג’ ותלמידי מל”מ. דרישות מוקדמות – קורסים בחוליתניים, פיזיולוגיה, ביוכימיה. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרצאות פרונטליות |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Hadley, Endocrinology, 6th Edition וספרים נוספים שנמצאים בספריה |
| בקרה הורמונלית של התנהגות בע"ח (0455.3652) HORMONAL CONTROL OF ANIMAL BEHAVIOR |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק בקשר הדדי שבין המערכת האנדוקרינית, הנוירואנדוקרינית וההתנהגות. מטרת הקורס להכיר ולהבין את הגורמים החיצוניים והפנימיים הפועלים על בעלי-חיים והמשפיעים על התנהגותם. להדגמת יחס הגומלין של המערכות הנ”ל, ינותחו במשך הקורס תופעות התנהגותיות כגון: התנהגות מינית, התנהגות הורית, תוקפנות והתנהגויות אחרות. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גילוי ופיתוח תרופות (0455.3463) Seminar – Drug discovery, development and validation |
| פרטי הקורס |
| - תכנון מבנה של תרופות (drug design) ויחסי גומלין מבנה – פעילות (structure activity relationship). - פרמקולוגיה וטטכסיקולוגיה פרה-קלינית. - ניסויים קליניים, שלבים, עקרונות, תכנון וביצוע, טרום רישום. - הערכת יעילות של תרופות. - תופעות לוואי של תרופות: תחלואה הנגרמת ע”י תרופות והשלכותיה על תהליכי הפיתוח. - הערכת תועלת/סיכון בתרופות. |
| הרכב ציון: |
| גישה מולקולרית לבעיות למידה וזכרון (0455.3431) MOLECULAR APPROACH TO LEARNING AND MEMORY |
| פרטי הקורס |
| במסגרת הקורס גישה מולקולרית ובעיות למידה וזיכרון נתעסק בהיבטים שונים של תהליך הלמידה ואחסון המידע הנקלט בזיכרון. לשם כך, נעסוק במספר מודלים ניסיוניים ונלמד את העקרונות הבסיסיים של תהליכי הלמידה מהרמה ההתנהגותית עד לרמה המולקולרית. מודלים אלה יכללו תהליכי למידה פשוטים כגון: למידה לא אסוציאטיבית [סנסיטיזציה והביטואציה] וכן למידה אסוציאטיבית בחסרי חוליות. כמו-כן נעסוק בתהליכי למידה מורכבים המדמים זיכרון דקלרטיבי אשר יתבססו על מודלים ניסיוניים שמקורם ביונק [LTP] . מטרת הקורס היא להבין את תהליכי הלמידה והזיכרון החל מהתנהגות בעל החיים דרך המערכות המעבדות את המידע הנקלט, במרכיבים התאיים וכלה במולקולות שעוברות שינוי בתגובה למידע המאוחסן בזיכרון. |
| הרכב ציון: בסוף הקורס יש להגיש עבודה שהיא תרגול לכתיבת הצעת מחקר. |
| גנטיקה כללית (0455.2526) general genetics |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס היא להפגישכם עם עקרונות דרכי ההורשה של תכונות ברמת האורגניזם מחד גיסא, ועם הגנים, דרכי פעולתם והבקרה עליהם ברמה המוליקולרית מאידך גיסא. יודגשו מקרים מהאדם על מנת להדגים כיצד הרפואה מיישמת כיום את העקרונות שיוצגו בקורס. הנושאים בקורס יכללו, בין השאר:חוקי מנדל והרחבתם;התיאוריה הכומוזומלית של ההורשה; קביעת מין, שינויים במבנה הכרומוזומים ובמספרם, השפעות סביבה על ביטוי הגנים; אינטראקציה בין גנים; גנטיקה של תכונות כמותיות; תאחיזה ושחלוף; שיטות למיפוי גנים; DNA - מבנהו, שכפולו ושיעתוקו; טבע הגן, תרגום ופיענוח הקוד הגנטי; סוגי המוטציות ופעולת חומרים מוטגניים; מנגנוני תיקון DNA; בקרה על פעולת הגנים הפרוקריוטים בהתפתחות של רב תאיים; עקרונות של מניפולצית גנים; תורשה אימהית; גנים באוכלוסיות. גישות גנומיות לחקר מבנה ותפקוד של גנים |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גנטיקה כללית - מעבדה (0455.2626) GENETICS-LABORATORY |
| פרטי הקורס |
| המעבדה נועדה ללמוד את השיטות הבסיסיות בגנטיקה של מיקרואורגניזמים, זבוב התסיסה ובני אדם. השיטות כוללות אנליזה פנוטיפית, שיטות מיקרוביולוגיות ושיטות מולקולריות של עבודה בDNA. נושאי המעבדה: • גנטיקה בזבוב התסיסה: דומיננטיות, קצסיביות, תכונות אוטוזומליות ותכונות אחוזות למין ומיפוי גנים באמצעות רקומבינציה. • גנטיקה בהפלואידים(שמרים): מוטנטים במסלולים ביוכימיים, אנליזה של טטרדות, רקומבינציה. • גנטיקה של חיידקים: העברת גנים, מיפוי גנים ואנליזה של מוטציות במסלולים מטבוליים. • גנטיקה של בני אדם: קבוצות דם, תאחיזה למין, מנדליזם, גנטיקה של אוכלוסיות, שימוש בסמנים מולקולריים ושיטות מולקולריות לאפיון גנטי של פרטים ואוכלוסיות. |
| הרכב ציון: הציון נקבע לפי דוחות, הערכת מדריך ומבחן מסכם. המבחן ינתן בשעור האחרון של הסמסטר. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גנטיקה מולקולרית וביוטכנולוגיה בצמחים- (0455.3804) PLANT MOLECULAR GENETICS ADVANCED LABORATORY COURSE |
| פרטי הקורס |
| הקורס יכלול הרצאות ומעבדות קומפלימנטריות: • הגנומים הגרעיני, כלורופלסטי ומיטוכונדריאלי. • החדרת גנים לצמחים, סימנים סלקטיביים, פרומוטרים וגנים מדווחים. • גנטיקה מולקולרית של צמחים טרנסגנים. • שימוש במוטנטים - ככלי להבנת תהליכים בארבידופסיס בצמח דגם. • בקרת ביטוי של פרומוטורים. • ביוטכנולוגיה בצמחים |
| מס תלמידים: מוגבל ל 24 |
| דרישות קדם: קורס בסיסי בביולוגיה מולקולרית נוכחות חובה |
| הרכב ציון: 75% דוחות המסכמים את תוצאות הניסויים והרקע התאורטי 25% השתתפות בשעורים ותפקוד במעבדות |
| ספרות: תנתן עם התחלת הקורס |
| גנטיקה מולקולרית של האדם (0455.3035) Human Molecular Genetics |
| פרטי הקורס |
| בין נושאי הקורס: • ארגון גנום האדם. • בקרת פעילות גנים. •גן הגלובין והמוגלובינופטיות. • מוטציות בגנים והדרכים המולקולריות לזיהוין. • דרכי שיבוט של גנים הקשורים במחלות. • הטבעה גנומית. •אינאקטיבציה של כרומוסום x ו קביעת המין באדם. • גנים אלסטיים. • מחלות מיטוכונדריות. • מודלים אנימליים למחלות גנטיות. •סרטן, גנטיקה, אונקוגנים וטומור סופרסורים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גנטיקה של אוכלוסיות והתאוריה האבולוציונית (0455.3061) Population genetics and the theory of evolution |
| פרטי הקורס |
| הקורס יציג מודלים חישוביים בגנטיקה של אוכלוסיות – בנייתם, ויישומם לשאלות מרכזיות בתאוריה האבולוציונית. הקורס יכלול: מבוא - רכיבים בסיסיים של מודל; שווי משקל ויציבות צורות שונות של ברירה טבעית – ברירת חיוניות, ברירה מינית, ברירה גמטית מודלים של מוטציה רקומבינציה וLinkage Disequilibrium אפיסטזיס ונופי כשירות מורכבים סחיפה גנטית מבנה אוכלוסיה ורביה שאינה מקרית תורת המשחקים האבולוציונית מודלים לאבולוציה של שיתוף פעולה גנטיקה של אוכלוסיות צמחים לעומת בעלי חיים ברירה בכמה רמות – הגן, הפרט, הקבוצה והאוכלוסיה; קונפליקטים בין הרמות. האבולוציה של המערכת הגנטית האבולוציה של קצבי מוטציה היתרון האבולוציוני של רביה מינית ורקומבינציה |
| הרכב ציון: בחינה מסכמת – 80%, תרגיל – 20% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| גנטיקה של מיקרואורגניזמים ובקרת הביטוי הגנטי (0455.3682) MICROBIAL GENETICS |
| פרטי הקורס |
| תוכן הקורס: דיונים במבנה בפעולה ובבקרה שלמנגנוני ביטוי החומר הגנטי בחיידקים בדגש על הנושאים הבאים: • התפתחות הגנטיקה המודרנית לבחינה רב מערכתית: מונחי הגנומיקה, טרנסקריפטומיקה ופרוטיאומיקה. • האבולוציה של גישות למיפוי גנטי בחיידקים מהעבר להווה. • שיטות מיפוי קלאסיות • רקומבינציה כללית וספציפית כתהליכים חיוניים לשחלוף מידע גנטי. • מיפוי על-ידי קוניוגציה • מיפוי על ידי טרנסדוקציה כללית • מיפוי על ידי טרנסדוקציה ספציפית • מיפוי בעזרת טרנספוזונים • שיטות מיפוי מודרניות • מיפוי בעזרת אנזימי רסטריקציה והיברידיזציה [המפה של Kohara) • פרויקטי פיענוח גנומים בקטריאליים • מבוא לשימוש ב- DNA chips לגנומיקה ולטרנסקריפטומיקה • פלסמידים • בקרת ההכפלה לבקרת מספר העותקים • סגרציה של רפליקונים • מערכות Post segregational killing • בקרת הביטוי הגנטי כתגובת החיידקת לשינויים סביבתיים. השימוש במוטנטים ובגישות רב-מערכתיות ללימודן. רשתות העברת סיגנלים בחיידקים. • מערכת התגובה לעקה כללית General dtress response • מערכת התגובה לנזקים ל- DNA The SOS response • מערכת התגובה לעקת חום The heat-shock response • מערכת התגובה להרעבה לחומצות אמיניות The stringent response • Recoding: צורות ביטוי בלתי שגרתיות של הצופן הגנטי. • מודל האופרון בבקרת ביטוי גנים: • בקרה חיובית ושלילית • בקרת שיעתוק על ידי אנטי-טרמינציה • בקרה מרחוק Action at a distance • מתגים גנטיים. • פרוטיאוליזה כמנגנון בקרה גנטי • פרוטיאזות תלויות-אנרגיה • TmRNA ותפקידו בתיוג חלבונים לדגרדציה • פרוטיאזות כשפרונים מולקולריים • מולקולות RNA קטנות ותפקידיהם בבקרת ביטוי גנים • בקרה חיובית ושלילית ברמת התרגום • גילוי ואפיון מולקולות חדשות בעזרת DNA microarrys • מערכות העברת סיגנלים • Two component ststems • התנהגות קבוצתית של חיידקים • Quorum sensing in Gram positive and Gram gative bacteria • התארגנות ”רב תאית” ויצירת ביופילמים. |
| דרישות קדם: דרישות מוקדמות: קורסים בגנטיקה כללית, ביוכימיה של חומצות גרעין וביולוגיה מולקולרית ומיקרוביולוגיה. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| הבסיס המולקולרי של תהליכים דגנרטיבים במחלת אלצהיימר (0455.3239) THE MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING ALZHEIMER’S DISEASE |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: • גורמי סיכון מולקולריים וסביבתיים • אמילואיד- b ופרסנילין • שינויים ציטוסקלטלים ו- tau • ApoE ותהליכי תקון • תהליכים אנפלמטוריים במחלה • ה- Blood Brain Barrier בתהליכים נוירודגנרטיביים • אסטרטגיות לפיתוח טיפול תרופתי |
| הכרת האקולוגיה של קבוצות צמחים מיוחדים בגנים הבוטניים (0455.1620) ecology of special plant groupsin the botanic gardens |
| פרטי הקורס |
| ההוראה תשולב בהרצאות של המרצה ובסיורים בוטניים בגנים הבוטניים של האוניברסיטה. מטרת הקורס להעשיר את הסטודנטים בנושאים בוטניים נבחרים, ולחשוף אותם לצמחיות מעניינות מארץ ישראל ומרחבי העולם. נושאים נבחרים לדוגמא: • יערות גשם טרופיים • צמחי תועלת • צורות חיים בצמחיית ארץ ישראל • יערות קשי-עלים • חגורת המדבריות העולמית • מתי התרחשה החדירה של הצומח הסודני לארץ ישראל • צמחי מים • קקטוסים וצמחים בשרניים-קונורגנציה • השינויים בחגורות הצומח במרומי האנדים וההימלאיה |
| מס תלמידים: 25 |
| הרכב ציון: כל המשתתף בכל ההרצאות והסיורים – יקבל ציון עבר |
| הכרת עולם הצומח (0455.2805) Evolution in the plant kingdom |
| פרטי הקורס |
| • כחוליות (ציאנובקטריה); אצות ירוקיות; אצות חומיות; עולם הפטריות; חזזיות; טחבים; שרכים; חשופי זרע; צמחי פרחים. • במהלך ההרצאות יודגשו היבטים אבולוציוניים, אקולוגיים וכן שימושי האדם בצמחים מן הקבוצות השונות. יחסי האדם לצמחים מזיקים. יחסים בין צמחים לאורגניזמים אחרים. הצמחים תחת תנאי אקלים משתנים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| הנדסה גנטית (0455.3360) Genetic Engineering |
| פרטי הקורס |
| 1. Vectors 2. Enzymes in DNA engineering 3. Polymerase chain reaction (PCR) 4. Gene cloning 5. Gene expression and protein purification 6. Side directed mutagenesis 7. Animal cell engineering 8. Transgenic animals 9. Transgenic plants 10. Post genome analyses |
| דרישות קדם: גנטיקה כללית מיקרוביולוגיה מבוא לביולוגיה מולקולרית נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Textbooks for the course in Genetic Engineering Bacterial Genetics Any modern book in General Genetics, chapters on Microbial Genetics Snyder, L. and W. Champness, Molecular Genetics of Bacteria, 1st ed. (1997) (or 3rd ed. (2007), Amer. Soc. Microbiology Press Dale, J.W. and Park, S.F., Molecular Genetics of Bacteria, 4th ed. (2004), Wiley publ. Genetic Engineering Primrose, S.B. and Twyman, R.M., Principles of Gene Manipulations and Genomics, 7th ed. (2006), Blackwell Publ. Brown, T.A. Gene Cloning & DNA Analysis, 5th ed. (2006), Blackwell Publ. Dale, J.W. and von Schantz, M., From Genes to Genomes: Concepts and Applications of DNA Technology, 2nd ed. (2007), Wiley publ. Reece, R.G., Analysis of Genes and Genomes (2003), Wiley publ. Textbooks for the course in Genetic Engineering Bacterial Genetics Any modern book in General Genetics, chapters on Microbial Genetics. Snyder, L. and W. Champness, Molecular Genetics of Bacteria, 1st ed. (1997) (or 3rd ed. (2007), Amer. Soc. Microbiology Press. Dale, J.W. and Park, S.F., Molecular Genetics of Bacteria, 4th ed. (2004), Wiley publ. Genetic Engineering Primrose, S.B. and Twyman, R.M., Principles of Gene Manipulations and Genomics, 7th ed. (2006), Blackwell Publ. Brown, T.A. Gene Cloning & DNA Analysis, 5th ed. (2006), Blackwell Publ. Dale, J.W. and von Schantz, M., From Genes to Genomes: Concepts and Applications of DNA Technology, 2nd ed. (2007), Wiley publ. Reece, R.G., Analysis of Genes and Genomes (2003), Wiley publ. |
| התנהגות ארגונית מיקרו (0455.3056) התנהגות ארגונית מיקרו |
| פרטי הקורס |
| הקורס נועד לפתח מסגרת התייחסות שיטתית ומעמיקה להבנת מורכבות ההתנהגות האנושית בארגונים. הוקרס מתמקד באנשים - עובדים ומנהלים- המרכיבים את הארגון ומכוון להקניית ידע, תיאוריות ומושגים מרכזיים המסייעים בהבנת התנהגות הפרט בארגון. נתמקד במספר נושאים אשר מייצגים (אך לא ממצים) את המחקר של התנהגות ארגונית ברמת הפרט והקבוצה כשהדגש הוא על האופן בו תפיסת הפרט, מניעיו, עמדותיו ויחסיו עם הזולת מעצבים את התנהגותו ותפקודו בארגון. בין השאר נעסוק בתהליך הכניסה לארגון, תהליכי תפיסה ולמידה בארגונים, השפעת לחצי עבודה\ מוטיבציה ועמדות, מנהיגות וצוותים. |
| הרכב ציון: בחינה בכתב - 60% עבודת אמצע סמסטר 40%- |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| התנהגות בע"ח (0455.2807) ANIMAL BEHAVIOR |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: • אבני הבניין של ההתנהגות: גורמים פנימיים וחיצוניים בעיצוב ההתנהגות • אינסטינקטים טרופומיזם ורפלקסים • התניה אופרנטית (על פי Skinner) • מתנדים ביולוגים וצורות הצימוד ביניהם (על פי von Holst, Winfree) • מנגנוני סרוו, בקרה ע”י משוב שלילי, והתנהגות כבקרה של התפישה • גילוי משתנים שיתופיים בהתנהגות ((Collective variables • העולם מנקודת מבטם של בעלי חיים ( (Umwelt • מנגנוני התפתחות ולמידה • תקופות רגישות בהתפתחות ההתנהגות • שימושים בחושים שונים בעולם החי • הטבעה דרך ערוצי חוש שונים והיבטים מוחיים להטבעה • העולם הפנימי של בעלי חיים (Umwelt) • גירויי סימן ותגובות התנהגותיות • התפתחות ולמידה, למידה מתוכננת והעברת תרבות • אבולוציה של התנהגות • התנהגות כאדפטציה: אופטימיזציה ויציבות אבולוציונית • הבסיס הגנטי של אסטרטגיות ומנגנונים התנהגותיים • קבלת החלטות בסביבה משתנה • אסטרטגיות רביה ובחירת בני זוג • אבולוציה של תקשורת בין בעלי חיים • התנהגות חברתית ושיתוף פעולה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| וירולוגיה מולקולרית של נגיפים אנימליים (0455.3034) Molecular virology of animal viruses |
| פרטי הקורס |
| הקורס יכלול את הנושאים הבאים: מבוא לוירולוגיה; חדירת נגיפים לתאים; הכפלה ושעתוק של נגיפי RNA ; Reverse Transcription ואינטגרציה של נגיפים ; שעתוק והכפלת נגיפי DNA ; יחסי נגיף מאכסן - אסטרטגיות והדבקה של נגיפים ; התמרה וירלית ואונקוגנזה ; אפופטוזיס ומניעת אפופטוזיס ע”י נגיפים ; נגיפים אימונוסופרסורים ; Gene Therapy. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Principles of Virology Molecular Biology,Pathogenesis, and Control Flint SJ, Enquist LW, Krug RM, Racaniello, Skalka AM ASM Press Virology Fields Raven Press |
| חוליתניים למתקדמים (0455.2535) Vertebrates: Comparative anatomy and functional morphology |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס להכיר את האנטומיה של מערכות עיקריות של בעלי החוליות [דגים, דו-חיים, עופות ויונקים] בהתאמה לתפקודן בסביבת החיים של בעלי החיים. כמו כן יושם דגש על לימוד מבנה השלד והאדפטציה שלו. המעבדות הן עיקר הקורס [סטודנטים שאינם יכולים מכל סיבה שהיא לנתח בעלי-חיים מוטב שלא יבחרו בקורס זה]. יש להתכונן לכל המעבדות על-ידי קריאת חומר. קריאת החובה לכל מעבדה והחומר למעבדה הרלוונטית – בחוברת המעבדה. בקיאותו של הסטודנט בחומר ההכנה למעבדה תיעשה על-ידי המדריך ובאמצעות בחנים. |
| מס תלמידים: 72 |
| הרכב ציון: 50% - בחינה מסכמת בכתב 50% - הערכה ובחנים במעבדות |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Kardong – Vertebrates וספרי עזר אחרים המופעים בחוברת המעבדה. |
| חסרי חוליות - היבטי תיפקוד השוואתים (0455.2806) THE INVERTEBRATES: COMPARATIVE FUNCTIONAL BIOLOGY |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס: הקורס מציג את חשיבות חסרי החולית בעולם החי ואת מגוון דפוסי המבנה והתפקוד שלקבוצות שונות מביניהם. הנושאים הנלמדים מנקודת מבט השוואתית ואבולוציונית של רמות ארגון מבניות ותפקודיות. התהליכים נלמדים ברמה התאית, הריקמתית והאורגנית, ובהתאם לכך דרך קיום וביצוע תהליכי החיים הבסיסיים. במיוחד משולב ידע בסיסי הדרוש להבנת תפקוד מערכות נבחרות מבין חסרי החוליות עם ידע מודרני ועדכני, שמדגיש את חשיבות חסרי החוליות בחזית המחקר במדעי הביולוגיה. הקורס מדגיש את חשיבות חסרי חולות ככלי מחקר להבנת תהליכים בסיסיים בעולם החי, בפילוגנזה, בהכרת גיוון בדפוסי חשיבות חסרי חוליות ככלי מחקר להבנת תהליכים בסיסיים בעולם החי, בפילוגנזה, בהכרת גיוון בדפוסי מבנה ותפקוד, בתפקוד אקוסיסטמות ימיות ויבשתיות, ברפואה, כמשאב מזון וכערך כלכלי, בנוסף, מודגש הערך של חסרי חוליות לקבוצותיהן השונות ככלי מחקר בסיסי ויישומי בעל פוטנציאל במאה ה- 21 . הנושאים בהם יעסוק הקורס: עקרונות מיון והתפתחות ; קשרים אבולוציוניים בין קבוצות וכלים לניתוחם ; מבנה וארגון תאים, רקמות וחללי גוף ; מבני שלד חיצוני ופנימי, שלד הדרוסטטי ; אברי תנועה ודגמי תנועה ; תזונה: צמחוניים, טורפים, מסננים ואוכלי כל ;נשימה ומערכות הובלה ; מערכות פיקוח עצביות ואברי חוש ; קשרים הדדים בין מינים: סימביוזה, מוטאליזם וטפילות ; התפתחות, רבייה ומחזורי חיים [חילוף דורות, רבייה מינית ואל מינית] ; הגנה ורעילות [חומרי טבע וטוקסינים] ; חסרי חוליות באקוסיסטמות יבשתיות ואקווטיות. |
| דרישות קדם: קורס מבוא לבעלי חיים הניתן לשנה א’ באוניברסיטת ת”א, או קורס מקביל אחר. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרכב הקורס ודרך ההוראה: הרצאות פרונטליות ומעבדות. בסוף הקורס יתקיים סיור מרכוז – חובה – במשך 3 ימים לחוף הים התיכון בו ייעשו ע”י התלמידים פרויקטים קבוצתיים על חסרי החוליות החופיים. ערך הקורס 5 נקודות. הרכב הציון הסופי: בחינה בכתב [חלק עיוני] - 50% בחינת מעבדה בכתב [מעבדה וסיור] - 35% בחנים והערכת מדריך -15% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Barnes RSK, Calow P & Olive PJW. The invertebrates, a new synthesis. Blackwell Scientific Publications. Pechenick, JA. Biology of the Invertebrates. McGraw Hill. |
| חרקים נושאי דגל הרבגוניות הביולוגית (0455.2808) INSECTS THE FLAGSHIP OF BIODIVERSITY |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס ותוכנו*: להמחיש לתלמידים את מושג ”המגוון הביולוגי”, כפי שהוא בא לידי ביטוי ברב-גוניות הביולוגית במחלקת החרקים, כולל מגוון המינים, התפתחות, מבנה, תזונה, רבייה, התנהגות, התגוננות ואדפטציות מיוחדות; להציג את משמעותם של החרקים בנופים הטבעיים ואת יחסיהם המורכבים עם האדם, תוך שימת דגש על חשיבות החרקים כמאביקים, מזיקים, מעבירי מחלות וכאמצעים להדברה ביולוגית; לברר את הבסיס האנטומי והפונקציונלי להצלחה האבולוציונית של החרקים; להרחיב את ההכרות של התלמידים עם הסדרות העיקריות של החרקים ועם עולם החי של ישראל. * הקורס מומלץ במיוחד למתעניינים במגוון הביולוגי, במחקר אנטומולוגי,בהגנת הצומח, בשמירת טבע ובהוראת המדעים. הרכב הקורס ודרך ההוראה: שלוש שעות בשבוע (הרצאה ומעבדה), שישה ימי סיור כולל שני סיורים בני יומיים. |
| מס תלמידים: 50 |
| הרכב ציון: מבחן מסכם. בונוס עבור מבדקים מוצלחים (כאלו שינתנו במשך הקורס) ואוסף חרקים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: אנציקלופדיה החי והצומח של ארץ ישראל, כרך 3 – חרקים. Gullan and Cranston. The Insects ספרות נוספת תצוין בעת הקורס. |
| טכנולוגיה אנזימטית (0455.3778) ENZYME TECHNOLOGY |
| פרטי הקורס |
| • תכונות אנזימים הקובעות אפשרויות ניצולם בתעשיה • ניקוי והפרדה של אנזימים בקנה מידה גדול • תהליכים תעשייתיים בהם משמשים אנזימים כקטליזטור הומוגני • מערכות אנזימתיות בלתי מסיסות לסוגיהן, הכנתן ואיפיונן • ריאקטורים אנזימתיים • תהליכים תעשייתיים המבוססים על אנזימים בלתי מסיסים • הפעלה של אנזימים בתא השלם • מערכות תאים מקובעים • מערכות תאים מקובעים המשמשים בתעשיה • ביוטרנספורמציה ותהליכים רב שלביים המבוצעים ע”י תאים מקובעים • שימושים אנאליטיים: ממברנות; אלקטרודות; ותצמידי אנזימים עם נוגדנים • השלכות התפתחות ההנדסה הגנטית והנדסת חלבונים על שימושים תעשיתיים של אנזימים |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| יחסי מים בצמחים - קורס וירטואלי (0455.3040) Plant Water relations – a virtual course |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק בנושאים הבאים: • גורמים המשפיעים על יעילות קליטת מים בצמחים. • יחסי מבנה – תפקוד של מערכת ההובלה. • בקרה על הפיוניות. • התאמות לנושאי יובש. • שיטות מחקר בתחום יחסי המים של צמחים. תוך כדי הלימוד בקורס ירכשו התלמידים ניסיון בשימוש ברשת האינטרנט וילמדו לכתוב דפי רשת . בקורס לא תהיינה פגישות בחדרי לימוד או במעבדות. |
| דרישות קדם: קורס בסיסי בפיסיולוגיה של הצמח. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הציון יקבע עפ”י השתתפות בדיונים ועבודת גמר. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| יסודות תורת הרקמות של בעלי חיים (0455.3057) Basic Histology of Mammalian Tissues |
| פרטי הקורס |
| עקרונות הכנת רקמות לחיתוך והסתכלות במיקרוסקופ (כולל הדגמה במעבדה). - עקרונות המבנה בהתאמה לתפקוד של רקמות אפיתל, חיבור, סחוס, עצם, שרירי שלד ולב, כבד, כליה, מערכת מין ושליה ,מערכת העצבים וחושים. - עקרונות קיבוע ומיקום של חלבונים ברקמות בעזרת נוגדנים ספציפיים. - עקרונות יסוד בהיסטוכימיה |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה בכתב בסוף הקורס - 100% מהציון |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: תמסר בתחילת הקורס |
| כימיה אורגנית (0455.1562) Organic Chemistry |
| פרטי הקורס |
| • נומנקלטורה של תרכובות אורגאניות ; אלקאנים ; אלקאנים ציקליים ; ריאקציות אופיניות ; איזומריה מבנית. • אלקנים ואלקינים. ריאקציות סיפוח. המנגנון של ריאקציות סיפוח. סיפוח מרקובניקוב ואנטי מרקובניקוב. פולימריזציה של אלקנים. • סטיריאואיזומריה, איזומרים אופטיים. • אלקיל הלידים. התמרות נוקליאופילות מסדר ראשון ומסדר שני. ריאקציות אלימניציה. תרכובות אורגאנו-מתכתיות ריאגנט גריניאר. • כהלים אתרים ופנולים. • תרכובות קרבוניליות-אלדהידים וקטונים. תכונות הקבוצה הקרבונילית. ריאקציות סיפוח. חמצון וחיזור. אנוליזציה; דחיסה אלדולית. • חומצות קרבוקסיליות ונגזרותיהן: חומצות, אסטרים, אנהידרידים, אציל הלידים ואמידים. ריאקציות התמרה דחיסות של אסטרים. • אמינים. ריאקציות התמרה ואלימינציה. הקשר הפפטידי. • תרכובות ארומטיות ; מבנה, התמרה ארומטית אלקטרופילית. הכוונת ההתמרה בתרכובות ארומטיות. סינתיזה ארומטית. • תרכובות הטרוציקליות. • בעיות בסינתיזה אורגאנית: שיטות להארכת וקיצור שרשראות ; סגירת טבעות ; הצבת קבוצות פונקציונאליות. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרכב הציון הסופי: בחינה סופית 90% בוחן 10% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: ספרות 1) J. McMurry, Organic Chemistry, 6th edition, Brooks/Cole, 2004 J. McMurry, Organic Chemistry, 5th edition, Brooks/Cole, 1999 J. McMurry, Organic Chemistry, 4th edition, Brooks/Cole, 1995 2) P.Y. Bruice, Organic Chemistry, 4th edition, Prentice Hall, 2003 P.Y. Bruice, Organic Chemistry, 3rd edition, Prentice Hall, 2000 3) R.J. Fessenden and J.S. Fessenden, Organic Chemistry, (4th edition, 5th edition & 6th edition), Brooks/cole, 1998. 4) A. Streitwieser , C.H. Heathcock & E.M. Kosower, Introduction to Organic Chemistry, 4th edition, Macmillan, 1992. 5) L.G.Wade, JR. Organic Chemistry, 5th edition, Prentice Hall, 2003. 6) לאון גולדשטיין, כימיה אורגאנית תרגילים ופיתרונות, 1998. 7) ארוין גלוטר, מבוא לכימיה אורגאנית, מהדורה שנייה, האוניברסיטה העברית ירושלים, הפאקולטה לחקלאות ברחובות, 1990. |
| כימיה אורגנית (0455.1567) ORGANIC CHEMISTRY |
| פרטי הקורס |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| כימיה כללית ואנליטית (0455.1566) General and Analytical Chemistry |
| פרטי הקורס |
| • מושגי יסוד - מספר אטומי, מספר מסה, מסה אטומית, מול, מס’ אבוגדרו • מבנה האטום - מודל מערכת השמש לפי רתרפורד, מודל בוהר, מודל לפי מכניקת הקוואנטים, מושג האורביטל, מערכה מחזורית • קשר כימי - הקשר הקוונטי - מודל לואיס, המודל האורביטלי, הכלאות וגיאומטריה. הקשר היוני - השריג היוני • כוחות בינמולקולרים - כוחות ואן-דר-ואלס, קישרי מימן • המים - תכונות פיזיקליות, המים כממס, הידרופיליות והידרופוביות • חוקי הגזים: משוואת מצב, חוקי בול וגי-לוסק, משוואות הגזים האידיאליים, חוק הלחצים החלקיים. • התאוריה הקינטית של הגזים: פיתוח מתמטי, משמעות הטמפרטורה וקבוע הגזים, התפלגות המהירות של מולקולות. • מסקנות מהתאוריה הקינטית: קבול חום של גזים, דרך חפשית ממוצעת, תופעות טרנספורט. • גזים לא-אידיאליים. • תמיסות - יחידות ריכוז, פרקציה מולית, מולר, מולל, ונורמל • המשוואה הכימית - איזון חישובים סטויכיומטרים • שווי משקל כימי - מצב שו”מ, עיקרון לה-שטלייה איכותי, קבוע שו”מ Kc Kp • שיווי-משקל בין תמיסה למוצק: מלחים קשי תמס, מושג מכפלת המסיסות, אפקט יון משותף, השקעה דיפרנציאלית של מלחים. • חומצות ובסיסים - פנומנולוגיה, הכרת חומצות ובסיסים, הדגמות, נומנקלטורה, ריאקציות מאפיינות, תהליך סתירה • חומצות ובסיסים - הגדרות אהרניוס, Lowry-Bronsted , חומצות לואיס, סקאלת pH, Ka ו- pKa • שיווי-משקל בתמיסות מימיות: גישות קרוביות וטיפול מתמטי מדויק ביוניזציה של חומצות ובסיסים, הידרוליזה, בופירם, עקומות טיטרציה, חומצות פוליפרוטיות ופולי-בסיסים, אינדיקטורים. A |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: 10% בחנים 90% מבחן סופי |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: ספר הלימוד: General Chemistry 8th edn., R.H. Petrucci, W.S. Harwood and F.G. Herring. Prentice Hall, New Jersey 2002 ספרי עזר: University Chemistry 4th edn ., B.M. Mahan and R.J. Myers. The Benjamin/Cummings Publishing Company, Inc, 1987 עקרונות הכימיה חלקים א’ ו-ב’, עמנואל מנזורולה, הוצאת קווים חברה לפירסום בע”מ. |
| כימיה פיזיקלית (0455.1565) Physical Chemistry |
| פרטי הקורס |
| • תאים אלקטרוכימיים ואלקטרוליזה: פוטנציאל חמצון-חיזור, תנאים סטונדרטיים, תאים גלוניים וסקלת חמצון-חיזור, משוואת נרנסט, הקשר לקבועי שווי-משקל, טיטרציה פוטנציומטרית. • קינטיקה כימית: סדרי ריאקציות-תאוריה וקביעה נסיונית, הקשר בין סדר ומנגנון הריאקציה, הקשר בין קבועי מהירות לקבוע שיווי המשקל, השפעת הטמפרטורה על קבוע המהירות, קינטיקת מצב עמיד. • תרמודינמיקה: חום ועבודה, החוק הראשון של התרמודינמיקה, אנטלפיה, קיבול חום, תהליכים ספונטניים והפיכים, אנתרופיה והחוק השני, החוק השלישי של התרמודינמיקה, אנרגיה חופשית, קבועי שיווי משקל והטמפרטורה, גישה תרמודינמית לתכונות קוליגטיביות . • נוזלים: מודל מיקרוסקופי, שיווי משקל בין פאזות, לחץ אדים, דיאגרמת פאזות, מעברי פאזות.תמיסות אידיאליות, חוק ראול, תכונות קולגטיביות. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: 10% בוחן 90% בחינה סופית |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: ספר הלימוד: General Chemistry 8th edn., R.H. Petrucci, W.S. Harwood and F.G. Herring. Prentice Hall, New Jersey 2002 ספרי עזר: University Chemistry 4th edn ., B.M. Mahan and R.J. Myers. The Benjamin/Cummings Publishing Company, Inc, 1987 עקרונות הכימיה חלקים א’ ו-ב’, עמנואל מנזורולה, הוצאת קווים חברה לפירסום בע”מ. |
| כלים בביואינפורמטיקה (0455.3067) Tools in bioinformatics. |
| פרטי הקורס |
| הקורס ילמד על כלים שונים בביואינפורמטיקה כגון: Databases, Blast ו-Alignment,Genome Browsers, Protein Motif Search, Multiple Sequence Alignment, Phylogenetic Trees, Protein 3D Structures, ועוד. במהלך השיעורים יעשה שימוש בכלים אלו על מנת להקנות לסטודנטים ידע מעשי. מסגרת הקורס הנה שיעור באורך שעתיים שיועבר אחת לשבועיים. בסך הכל יועברו כ 6-7 שיעורים. מטלות: בכל שיעור יועבר תרגיל כיתה אשר חובה להגישו פתור עד תום השיעור. כמו כן, יינתן בסוף כל שיעור תרגיל בית להגשה לשיעור הבא. מטלת סיום הקורס הנה עבודה מסכמת. |
| הרכב ציון: תרגילי בית 50% עבודה מסכמת 50% |
| דרישות קדם: מבוא לביואינפורמטיקה. אפשר במקביל. נוכחות חובה. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| ליתופלורה וביואינדיקטורים (0455.2734) LITHOPHYTES AND LITHOMICROORGANISMS |
| פרטי הקורס |
| קורס בהכרת הליתוביולוגיה על פני סלע, על אבן ועל חומרי בניה אבניים. דרישות צמחים ירודים וצמחים עילאיים ממסד אבני. תקיפת מסד אבני על ידי מיקרואורגניזמים ועל ידי צמחים. דגמי בלייה של סלע ושל אבן באזורים אקלימיים שונים בארץ ובעולם. אורגניזמים קריפטואנדוליתיים במדבריות קרים. הליתופלורה ופלאואקלים בישראל. משטרי הטמפרטורה והרטיבות במסדים אבניים. שרשרות מזון על פני מערכות אבניות. נזקים למבנים וליצירות אמנות בגלל ליתוביונטים. עקרונות ושימוש בביואינדיקטורים ובביומוניטורים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מבוא לביואינפורמטיקה (0455.3066) Introduction to Bioinformatics |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס הינה שהתלמידים יכירו את המונחים הבסיסיים של התחום ואת הרעיונות המרכזיים אשר נמצאים בשימוש נרחב (לדוגמה מבוא לניתוח נתונים של מערכי גנים). בקורס ילמדו הנושאים הבאים: 1. ביולוגיה חישובית – מהפכה במדעי החיים במאה ה 21 2. Large scale: מרצפים גנומים, ביטוי כל הגנים, פרוטאומיקה, וכדומה. 3. עימוד (alignment) וחיפוש הומולוגים ע"י בלסט. 4. עימוד של מספר רב של רצפים ושימוש השוואות רצפים לביולוגיה. 5. דומיינים של חלבונים, מוטיבים, שינויים אחרי תרגום – גישה חישובית. 6. לתוך הגנום: סטטיסטיקה של גנומים, מה הגנומים מלמדים אותנו. 7. עצים פילוגנטיים ושימושם לחקר האבולוציה. 8. ניתוח ניסויי מערכי גנים (צ'יפים). 9. רשתות ביולוגיות. 10. הסקת לחצי סלקציה על חלבונים (סלקציה חיובית, ניטראלית ומטהרת). 11. ניתוח מבני חלבונים בכלים חישוביים (לדוגמה – docking). 12. למידה חישובית, קיבוץ (clustering), סיווג (classification) וכדומה. 13. גנטיקה של אוכלוסיות תוך דגש על ניתוח SNPs. 14. ניתוח תמונות תאים חיים בזמן אמת – גישה חישובית. מומלץ לקחת במקביל את הקורס כלים בביואינפורמטיקה. |
| דרישות קדם: ביולוגיה של התא, גנטיקה, ביוכימיה א, סטטיסטיקה נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מבוא לביולוגיה מבנית (0455.3439) INTRODUCTION TO STRUCTURAL BIOLIGY |
| פרטי הקורס |
| • הכוחות הפיזיקליים החשובים במבנים של מקרומולקולות ביולוגיות • טרמודינמיקה של מקרומולקולות • שיקולים מבניים ומוטיבים • קיפול של – ויציבות בחלבונים • שיטות לקביעת מבנה • זיהוי מולקולרי: אינטראקציות חלבון/חלבון וחלבון/חומצות נוקלאיות • חלבונים ממברנליים • אמונולוגיה מבנית • אספקטים מבניים בהולכת אותות תוך תאית • מבנים של חומצות נוקלאידיות. |
| הרכב ציון: הגשת תרגילים |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Branden and Tooze, Introduction to Protein Structure, 2nd edition Van Holde et. Al, Principles of Physical Biochemistry Cantor and Schimmel, Biophysical Chemistry Schulz and Schirmer, Protein Structure Creighton, Proteins: structures and molecular properties Lesk, Introduction to Protein Architecture |
| מבוא לביולוגיה מולקולרית (0455.2549) Introduction to Molecular Biology |
| פרטי הקורס |
| שטף המידע התורשתי. הגנוטיפ – מבנה, שכפול, תחזוקה והשתנות: • מבנה דנ”א: אבני בניין, מבנה הנוקלאוטיד, מבנה ראשוני, זיקות מייצבות מבנה, הסליל הכפול, קונפורמציות דנ”א אחרות, טופולוגיה, המארז הכרומטיני, חלבונים מזהי רצף דנ”א. מבנה רנ”א שניוני ושלישוני, חיזוי מבנה. • שכפול דנ”א – כללים, רכיבים ומערכות ניסוי. • טכנולוגיית הגן – שיבוט גנים, אפיון וביטוי ואנליזת תפקוד גנים משובטים. • מחזור חלוקת התא ובקרתו. • נזקי דנ”א ותיקונם, התגובה התאית לנזקי דנ”א. מגנוטיפ לפנוטיפ: סוגי הרנ”א בתא. ביוסינתזת רנ”א: שיעתוק, עיבוד tRNA, rRNA, ו – mRNA (כולל שחבור ומודיפיקציות). רנ”א פולימראזות ופקטורי שיעתוק, רמות בקרת ביטוי גנטי בחיידקים ובאוקריוטים כולל מודיפיקציית היסטונים ומתילציית דנ”א. ביוסינתזת חלבונים: הצופן הגנטי, רכיבי מערכת התרגום, מנגנון התרגום בחיידקים ובאוקריוטים |
| דרישות קדם: ביוכימיה א, כימיה נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Watson et al., Molecular Biology of the Gene, 5th edition |
| מבוא לביולוגיה מולקלרית - מעבדה (0455.2501) Molecular Biology |
| פרטי הקורס |
| המעבדה מהווה את הבסיס למעבדות המולקולריות המתקדמות: מיקרוביולוגיה, גנטיקה, ביוכימיה, אימונולוגיה, ביולוגיה של התא. המעבדה כוללת לימוד של שיטות עבודה מולקולריות בסיסיות עם אנזימים, נוגדנים וחומצות גרעין. הניסויים כוללים: • עבודה וטיפול בתמיסות שימושיות למחקר מולקולרי ולימוד של הכנת קרקעות מזון. • שיטות עבודה סטריליות והכרה של מיקרואורגניזמים. • תכונות ביוכימיות של אנזים וקביעת פרמטרים שונים כמו פעילות ספציפית ואפיניות. • הכרת השימוש בנוגדנים למטרות מולקולריות. • מעקב אחרי גידול של מיקרואורגניזמים ואחרי הביטוי של גנים הנמצאים תחת בקרה. • שיטות עבודה הDNA רקומביננטי – הפקת פלסמידים, אנזימי הגבלה, אלקטרופורזה, טרנספורמציה. • שיטות מולקולריות בהשראת ביטוי גנים בצמחים. • הכרה עם כלים ביואינפורמטיים בסיסיים – מאגרי מידע, חיפוש הומולוגיות וכו’. המעבדה היא דרישה מוקדמת למעבדות בחירה מולקולריות – שנה ב’: מיקרוביולוגיה, גנטיקה (ניתן לקחת במקביל) וביוכימיה. שנה ג’: אימונולוגיה וביולוגיה של התא. |
| הרכב ציון: בחינה 70% הערכת מדריך 30% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מבוא לביולוגיה של התא (0455.1510) Introduction to Cell Biology |
| פרטי הקורס |
| מאפייני החיים מקרומולקולות כמרכיבי התא הממברנה התאית ותפקודיה התא הפרוקריוטי והאוקריוטי הגרעין: כרומוזומים וגנים זרימת המידע בתא: שכפול שעתוק תרגום מחזור התא והבקרה עליו חלוקת התא: מיטוזה מיוזה טרנספורט תוך תאי: רטיקולום אנדופלאסמטי מערכת גולגי ליזוזומים מיטוכונדריה וזרימת האנרגיה בקרת התבטאות גנים בקרת יציבות חלבונים השלד התאי [ציטוסקלטון] צמתים בין תאים תנועה תאית מסלול העברת אותות בתא התמיינות והתפתחות עוברית מבוא לתהליך הסרטני |
| הרכב ציון: בחינה סופית 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL BY: ALBERTS, BRAY, LEWIS, RAFF, ROBERTS AND WATSON, GARLAND PRESS. |
| מבוא למדעי הצמח (0455.1521) Introduction to Plant Sciences |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס היא להציג את חשיבותה המרכזית של ממלכת הצומח בעולם החי, ותרומת המחקר במדעי הצמח לביולוגיה המודרנית. במשך הקורס נציג את מחזור חיי הצמח תוך מתן דגש על תהליכים יחודיים לממלכת הצומח הכוללים: • האור כאות להשראת תהליכים התפתחותיים [התפתחות הזרע ונביטה] • התמרת האור לאנרגיה כימית בתהליך הפוטוסינטזה • גנטיקה ואבולוציה • התפתחות רקמות הצמח • העברת אותות ובקרת תהליכי התפתחות והתמיינות ע”י הורמונים • מבנה ותפקוד אברי הצמח: שורש, גבעול ועלה • תהליכי רבייה ברמה המבנית, מולקולרית וגנטית • יחסי צמח-סביבה • מסלולים מטבולים יחודיים לצמחים • ביוטכנולוגיה בצמחים - לאן מוביל המחקר בשנת 2000 • מעבדות הדגמה ותרגילים משולבים עם ההרצאות במהלך הקורס תקיימו שלוש מעבדות הדגמה משולבות עם תרגיל. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Raven, Evert, Eichhorn: Biology of Plants, 6th Edition, 1998 W.H. Freeman and Conpany, NY Campbell: Biology. 4th - 7th Editions Benjamin/Ceemnings , California |
| מבוא לנוירוביולוגיה (0455.3237) INTRODUCTION TO NEUROBIOLOGY |
| פרטי הקורס |
| • מבנה תא העצב וארגון מערכת העצבית • התפתחות מערכת העצבים • הולכת הסיגנל העצבי לאורך תא העצב • תהליך השחרור הסינפטי ואנדוציטוזה • אינטגרציה ופלסטסיות סינפטית • נוירוטרנסמיטוריטם, רצפטורים ומנגנוני פעולה • דוגמאות בסיסיות להעברת אינפורמציה במערכת העצבים. |
| דרישות קדם: דרישות מוקדמות: קורס פיזיולוגיה של בע”ח א’ – חובה. נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מבוא לעולם החי - מחסרי חוליות לחוליתניים (0455.1569) Introduction to animal life |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס: הקורס נועד להציג מערכות נבחרות בעולם החי. במסגרת זו יוצגו עקרונות המבנה המורפולוגי והאנטומי, התפתחות מערכות גוף והתאמות המבנה לאורח החיים. הקורס מורכב משני חלקים: חלק אחד יבחן השוואתית מערכות נבחרות של חסרי חוליות [כדוגמת חד-תאיים, נבוביים, תולעים שטוחות, תולעים טבעתיות, פרוקי רגליים]. יוצגו מערכות הגוף ותפקודם במים וביבשה. החלק השני ייפרט את התכונות האופייניות למערכת המיתרנים ויתמקד במחלקות של חוליתניים: עגולי הפה, דגים, דו-חיים, זוחלים, עופות ויונקים. לימוד החוליתניים יכלול את ההתפתחות העוברית בקבוצות השונות והמבנה הסופי של מערכות אנאטומיות בחוליתניים בוגרים. המערכות שיפורטו הן: עיכול, נשימה, לב וכלי דם, מין ושתן, שלד, עצבים כולל מוחות, אברי תחושה. הפילוגנזה של כל אחת ממערכות הגוף האלו תודגש במיוחד. תהיה התייחסות לדמיון והשוני בין מערכות הגוף של חסרי חוליות וחוליתניים. |
| הרכב ציון: ציון הקורס: ייקבע על בסיס בחנים במהלך הסמסטר [עד 40%] ומבחן סופי. הציון הסופי יהיה ממוצע של שתי חלקי הקורס. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Hickman C.P. et al – Integrated Principles of Zoology. ישמש את הקורס על שני חלקיו – חסרי חוליות וחוליתניים. Kardong, V.K. – Vertebrates: comparative avatomy, function, evolution. ישמש ללימוד פילוגנזה של חוליתניים. |
| מבוא לתהליכים דלקתיים במערכת העצבים המרכזית (0455.3516) Introduction to inflammation in the central nervous system |
| פרטי הקורס |
| נושאים: רקע כללי על סוגי תאי הגליה השונים במערכת העצביים המרכזית סוגי אינטראקציה בין תאי גליה לנוירונים בתנאים פיזיולוגים ובמחלה סוגי אינטראקציה בין תאי הגליה לתאים של מערכת החיסון הפריפריאלית במהלך דלקת הבסיס האימונולוגי והנירודגנרטיבי של טרשת נפוצה תפקיד הדלקת במחלות נירודגנרטיביים: שבץ, אלצהיימר, ALS, פרקינסון. חשיבות תאי הגליה בתהליכי ריפוי במערכת העצביים המרכזית טפולים אנטי-דלקתיים במחלות נירודגנרטיביות. |
| דרישות קדם: דרישות קדם:רצוי אימונולוגיה כללית הקורס מיועד לסטודנטים שנה שניה ותלמידים לתואר מתקדם (שני ושלישי) |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מבנה ופעילות של חלבונים ב' (0455.3236) STRUCTURE AND FUNCTION OF PROTEINS B: Structure prediction |
| פרטי הקורס |
| תכנית הקורס: 1. הקדמה – מבנה ותפקיד של חלבונים. 2. הכוחות המיצבים את מבנה החלבון. 3. מבנה ראשוני, שניוני, שלישוני ורבעוני. 4. חיזוי מבנה בשיטת המידול ההומולוגי (HOMOLOGY MODELING). 5. זיהוי סוג הקיפול (FOLD RECOGNITION). 6. מבנים חדשים (NEW FOLDS). 7. זיהוי אתרים פעילים פוטנציאליים בחלבון. 8 חיזוי פונקצית החלבון. |
| הרכב ציון: הקורס יכלול שיעור, סדנת מחשבים ופרויקט גמר. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| ספרות: • Schueler-Furman et al., (2005). Progress in modeling of protein structures and interactions. Science 310:638-642. • Petrey, D. and Honig, B. (2005). Protein Structure Prediction: Inroads to Biology. Mol. Cell. 20:811-819. • The summary of the CASP6 experiment in PROTEINS 61, S7, 2005 |
| מודלים של חסרי חוליות בנוירוביולוגיה (0455.3064) Invertebrate models in Neuroscience |
| פרטי הקורס |
| הקורס יכלול הרצאות וסמינריונים בין הנושאים שידונו: ? תרומתם של חסרי חוליות להתפתחות המחקר במדעי העצב ? רשתות עצבים פשוטות – אבולוציה מוקדמת של מערכת העצבים ? מערכות מודל פשוטות לחקר התפתחות מערכת העצבים ? חסרי חוליות מובילים בחקר התנהגות קצבית ומחוללי דגם מרכזיים ? מודלים של חסרי חוליות ללמידה וזיכרון ? "רובוטים חסרי חוליות" ? נושאים נוספים מהספרות שתתפרסם במהלך השנה ? נושאים נוספים קרובים לליבם של המרצה והתלמידים |
| הרכב ציון: 50% עבודה בכתב 50% סמינריון בע"פ |
| מיפוי תפקודי מבנה מוח האדם ב MRI עקרונות וישומים (0455.3505) Brain Mapping with MRI |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס: 1. הקניית מושגים בסיסים בתהודה מגנטית 2. הקניית מושגים בסיסים במיפוי המוח 3. תיאור התהליכים הפיסיולוגיים/פתולוגיים/ביוכימיים ש MRI יכול להדגים 4. הבנת השאלות בנושא מיפוי המוח ש MRI יכול לענות עליהן תוכן ומבנה הקורס: הקורס מכיל שני חלקים: הראשון - תאוריה והכרת מכשיר ה .MRI בחלק זה נכיר את המרכיבים של מכשיר MRI, מנגנון הפעולה ומהו סוג המידע שניתן לקבל ממכשיר זה. החלק השני של הקורס יוגדש ליישומים מתקדמים של MRI ובהם הדמיה תפקודית ומיפוי מסילות נוירונליות. פרק 1: הקדמה היסטורית למיפוי המוח פרק 2: בסיס פיסיקלי של תהודה מגנטית פרק 3: דימות בעזרת תהודה מגנטית: איך יוצרים תמונה פרק 4: הדמיה אנטומית: סוגי הנגדות ועיבוד תמונה בסיסי פרק 5: הדמיה תפקודית (fMRI): בסיס פיסיולוגי ופיסיקלי פרק 6: הדמיה תפקודית: שיטות עיבוד ויישומים פרק 7: מיפוי רשתות ומסילות עצביות בעזרת דימות טנזור הדיפוזיה (DTI) פרק 8: אבחון תהליכים פתולוגיים בעזרת הדמיה אנטומית ומטבולית |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: מבחן |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: “MRI – The basics” – Ray H. Hashemi, William G. Bradley “Magnetic Resonance Imaging” – David D. Stark, William G. Bradley, Jr. 3rd Ed. http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/inside.htm |
| מיקרוביולוגיה (0455.2580) Microbiology |
| פרטי הקורס |
| • מבוא: מבט היסטורי, היחוד של בקטריות, גישות המחקר, נושאי לימוד. • טקסונומיה ופילוגנטיקה: • זיהוי ומיון בקטריות, גישות ללימוד פילוגנטי בעולם המיקרוביאלי; שלוש הממלכות הבסיסיות וההשלכות על האבולוציה. • תזונה ומטבוליזם אנרגטי: • הרכב התא המיקרוביאלי וערכים תזונתיים הנוצרים מכך. הרכב קרקעי מזון לגידול חיידקים, מאפיינים תזונתיים, תסיסה, נשימה, פוטוסינתיזה. • מבנה, פונקציה ותהליכים ביוסינתטיים יחודיים לחיידקים: • בקטריות כמודל ללימוד שבילים מטבוליים. אסימילציה של חנקן, פחמן, גפרית. היחס בין סטרוקטורה ופונקציה בתאים פרוקריוטיים. ביוסינתיזה, הרכב ומבנה של דופן התא הפרוקריוטי. • דינמיקה של גידול חיידקים: • חלוקת התא בחיידקים. גידול אקספוננציאלי, התפתחות תרבית, גידול סינכרוני ומחזור תא החיידק. גידול מנתי וגידול רציף של מיקרואורגניזמים. • מערכת גנטית בחיידקים: • גנוטיפ ופנוטיפ,. מוטציה ומוטנטים,. דרכים להעברת גנים. • וירוסי חיידקים ופלסמידים: • מהם וירוסים. מבנה הויריון. טיפוסים שונים של וירוסי חיידקים. אינפקציה של בקטריופג. מחזור ליטי וליזוגני. ביולוגיה של פלסמידים. • האדם כפונדקאי לבקטריות: • קומנסליזם ופרזיטיות. חדירה, התפשטות והתפתחות גורם מחלה אינפקטיבי ציטוטוקסיות וציטופתולוגיה. תגובה חיסונית לאינפקציה. מחלות זיהומיות והגורמים להם. מניעת המחלה ותרפיה. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מעבדה בביולוגיה מולקולרית של התא (0455.2566) MOLECULAR CELL BIOLOGY LAORATORY |
| פרטי הקורס |
| המעבדה תכלול את הנושאים הבאים: • יסודות ניסויים בחקר התא • שיטות לגידול תאים בתרבית והשפעות הסביבה על גידול התאים הללו. • השפעת תנאי גידול על יצירת מרכיבים תוך תאיים ועל הבקרה במחזור התא • איתותים בין תאיים • תקשורת בין תא לסביבתו ומנגנון אינטרנליזציה של ליגנד רצפטור • גישות ניסוייות לאבחון ובידוד סמנים מולקולריים של התא • הפרדת תאים על סמך סמנים ממברנליים • שימוש ב- western blot לאבחון וזיהוי מולקולרי בין תאים • שימוש ב- RT-PCR לאבחון וזיהוי מולקולרי בין תאים המעבדה תתקיים במחציתו הראשונה של הסמסטר, ותמשך כ- 7 שבועות. |
| דרישות קדם: יתקבלו על סמך ציונים. דרישה מוקדמת: המעבדה במבוא לביולוגיה מולקולרית. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: הרכב הציון הסופי: בחנים במהלך הסמסטר + דוחות מעבדה |
| מעבדה בכימיה (0455.2522) CHEMISTY LAB. |
| פרטי הקורס |
| תכנית המעבדה: • קינטיקה כימית • ספנטרופוטומטריה • שווי משקל כימי • פוטנציאל חימצון-חיזור • פוטנציאל חשמלי על פני גוף טעון המעבדה תיושם בעבודה מעשית את העקרונות התיאורטיים שנלמדו בקורס כימיה שנה א’ בראשית כל מעבדה יערך בוחן קצר. בסיום המעבדה יגיש התלמיד את גיליון התוצאות הניסיוניות לאישור המדריך. תוצאות אלו תשמשנה בסיס לכתיבת דו”ח מסכם. |
| הרכב ציון: הרכב הציון הסופי: בחנים - 25% דו”חות מעבדה 50% הערכת מדריך 25% |
| מעבדה במיקרוביולוגיה (0455.2523) GENERAL MICROBIOLOGY LABORATORY |
| פרטי הקורס |
| המעבדה מיועדת ללמוד את השיטות הבסיסיות של עבודה במיקרואורגניזמים. נושאי המעבדה כוללים: • טכניקות בסיסיות: עבודה סטרילית, הסתכלות בחיידקים במיקרוסקופ הפאזות ועבודה עם תרביות טהורות. • בידוד ישיר של חיידקים. • העשרה של חיידקים. • זיהוי ואפיון של חיידקים באמצעים מולקולריים ופיסיולוגיים. • השריית מוטציות במיקרואורגניזמים, בידודם ואיפיונם. • השפעת אנטיביוטיקות שונות על גידול חיידקים. • מחזור גידול של בקטריופאג’ים. |
| מס תלמידים: 80 |
| הרכב ציון: הציון יקבע לפי דוחות, הערכת מדריך ומבחן מסכם. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| מעבדת פרוייקט (0455.3610) PROJECT LAB |
| פרטי הקורס |
| רשימת הנושאים המוצעים ע"י המחלקות לעבודות פרוייקט מפורטות בדפים הירוקים. תלמידים המעונינים יפנו אל המורים בהתאם לרשימה לביצוע העבודה. ניתן לעשות עבודת פרוייקט רק בהדרכת מורי הפקולטה למדעי החיים באוניברסיטת תל-אביב. נושא עבודת הפרוייקט יהיה שונה מנושאי העבודות הסמינריוניות, אך ניתן לעשותו אצל אותו מנחה. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| מתמטיקה (0455.1804) Mathematics |
| פרטי הקורס |
| • תאור הפונקציה החד מימדית - מושג הגבול, גבולות יסודיים, חישוב גבולות, רציפות • הנגזרת - נוסחאות גזירה, גזירות מסדר n , משיק נורמל, גזירה של פונקציה סתומה, נוסחת ניוטון - רפסון לקרובים • חקירת פונקציה - ת.ה, נקודות קיצון, עליה-ירידה, קמירות וקעירות , אסימפטוטות, תאור סכימתי • בעיות מקסימום מינימום - בעיות מתחום ההנדסה, ביולוגיה, בעיות מלאי פשוטות. • טורי טילור ומקלרון - קרובים • פונקציות רב מימדיות - נגזרות חלקיות, דיפרנציאלים, נגזרות סתומות, מציאת נק' קיצון עם ובלי תנאי הגבלה • אינטגרלים של פונקציה במשתנה אחד - נוסחאות ושיטות אינטגרציה (חלקים, הצבה, פונק' רציונלית), מציאת שטח ואורך קשת • משוואות דיפרנציאליות מסדר ראשון - לינאריות, הפרדת משתנים, פתרון בעיות באמצעות מד"ר. (הגדול האקספוננציאלי, תמהיל, ראקציות) |
| הרכב ציון: בחינה סופית 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| נדידת ציפורים (0455.2811) Bird migration – biological principles and research methods |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק באספקטים נרחבים של נדידת הציפורים על היבטיה השונים, ייחודה של יצשראל בצומת שלוש יבשות והצגת מחקרים ביולוגיים ויישומם, תוך דיון בשאלות מפתח ביולוגיות להבנת תופעות נדידת הציפורים: • היקף הנדידה בעולם החי: מבוא – עקרונות ניווט, השעון הביולוגי, נודדי יום ולילה, יתרונות אקולוגיים. • האבולוציה של נדידת ציפורים: כדגם התפתחות אבולוציוני. • ייחדה של ישראל בצומת שלוש היבשות: יחודה של ישראל, מגוון המינים הנודדים, קונפליקטים בנושאי שימור הטבע בנתיבי הנדידה. • שיטות מחקר נדידת הציפורים: צופים קרקעיים, מכ”מים, לווינים, כלי טייס, טיבוע מחקרים פיזיולוגיים ואינטגרציה בין השיטות. • יום סיור לעמק בית שאן וללטרון: היכרות עם רשת צופים קרקעית, טיבוע, מעקב בעזרת מכ”מ, אינטרנט, הקלטת קולות. הסיור יתבסס על אחה”צ וערב בעמק בית שאן (לינה בכפר רופין), בוקר במרכז טיבוע ובבריכות, נסיעה ללטרון להיכרות עם המכ”ם והאינטרנט. • האקלים ומזג אויר – כגורם מרכזי באסטרטגיית הנדידה. • טווחי נדידה יומיים ועונתיים – סימולציה ונתונים. • אסטרטגיית התקהלות לעומת נווטי בדד: הים והמדבר – כמחסומים קריטיים, הקשר בין מקורות המזון ואופי הנדידה, מרחקים נתיבים, שטחי חריפה ואופי הנדידה. • ציפורים ותעופה אזרחית וצבאית: קונפליקט או דו קיום? המחקר וישומו בישראל ובעולם. • מעקב אחרי ציפורים בעזרת לוויני דופלר: עקרונות השיטה ויישומה בשדה, סיכום 2 עשורים של מחקר בעזרת לווינים. • פרויקט מחקר הנשרים בישראל – כדגם למעק טלמטרי: גרעיני רבייה כגורם באישוש אוכלוסיות ומעקב טלמטרי לטווחי שוטטות במזה”ת. • פרוייקט מחקר הנשרים בישראל כגורם רב תחומי לקראת המאה ה-21: יישום נושאי בטיחות טיסה, נושאי חינוך ומעקב באינטרנט, תיירות טבע והתרומה לתהליך השלום באיזור; התכנית החינוכית באינטרנט ”הציפורים הנודדות אינן יודעות גבולות – מחר 98” אוניברסיטת ת”א והחברה להגנת הטבע. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: מבחן אמריקאי בסוף הקורס |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: ספרות בסיסית לקורס: 1. לשם יוסי, בהט עפר - \\”לטוס עם הציפורים\\” 264 עמ\\’ ההוצאה לאור של \\”ידיעות אחרונות\\”, הוצאה בעברית והוצאה באנגלית (עם תוספת פרק עדכני המחקרים והפעילות בשנים האחרונות, עמ\\’ 211-254). 2. 1995, Israel Journal of Zoology Vol 41 (3), מסכם כנס בינלאומי בנושאי מחקרי נדידה שהתקיים באפריל 1994 באילת (522 עמודים). 3. הציפורים הנודדות אינן יודעות גבולות - סיכום מאמרי כנס בינלאומי בנושא: \\”אספקטים מדעיים וחינוכיים של הנדידה 31/8-6/9/1977, בהוצאת המרכז הבינלאומי לחקר נדידת הציפורים בלטרון, אוניברסיטת ת\\”א (255 עמודים). 4. הציפורים הנודדות אינן יודעות גבולות - סיכום מאמרי כנס בינלאומי בנושא: בטיחות טיסה וציפורים במזרח התיכון, אפריל 1999. בהוצאת המרכז הבינלאומי לחקר נדידת הציפורים בלטרון, אוניברסיטת ת\\”א והחברה להגנת הטבע (310 עמודים). 5. Wings Over Africa – סיכום כנס בינלאומי עם מדינות אפריקה בנושאי מחקר, שימור, חינוך ובטיחות טיסה, בהוצאת המרכז הבינלאומי לחקר נדידת הציפורים בלטרון, אוניברסיטת תל-אביב והחברה להגנת הטבע (352 עמודים) 6. האתר באינטרנט: www.birds.org.il 7. הקורס מופיע באתר הווירטואלי של אוניברסיטת תל-אביב. |
| נוירואנטומיה (0455.2773) Neuroanatomy A |
| פרטי הקורס |
| הקורס נפתח בתיאור המבנה היסודי של חתך סכמאטי בגופו של החולייתן בדגש על מיקומו של צינור העצבים. נמשיך בסקירה כללית של רכיבי מערכת העצבים המרכזית, הכוללת התייחסות מיקרוסקופית (היסטולוגיה) ומאקרוסקופית, ונעבור לתאר את האירועים העיקריים בהתפתחות העוברית של צינור העצבים. על בסיס האמבריולוגיה נתייחס למבנה ולתפקוד של המבנים הבוגרים שעתידים להתפתח מחמשת המוחות העובריים. בבחינת האנטומיה הבוגרת נעמוד על השינויים המורפולוגיים שעבר צינור העצבים. כן נתייחס לארגון של החומר הלבן בהמיספרה, למבנה מערכת החדרים במוח, לקרומי המוח, לאספקת הדם וניקוזו, למערכת העצבים הפריפרית, למבנה גזע המח, לעצבים הקרניאליים ולמערכת העצבים האוטונומית. לאורך הקורס נתייחס במידת האפשר למחלות מערכת העצבים ולהתבטאויותיהן הקליניות ונלמד את הבסיס האנטומי לבדיקה הנוירולוגית. במעבדה נערוך דיסקציות של המוח האנושי, אשר עוקבות בדרך כלל אחר הפרקים העיקריים בתוכן הקורס. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: ? בחינה סופית בכתב (50%) ? בחינה מעשית במעבדה (40%): הנוכחות במעבדה הינה חובה ? בוחן אמצע (10%) ? לתלמידים שלא רשומים למעבדה: בוחן אמצע (15%) ומבחן בכתב (85%) |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: במהלך הקורס יקבלו הסטודנטים חומר עזר. באופן עקרוני מומלצים לקורס זה שני ספרים (עמודים ספציפיים לקריאה יוגדרו בראשית הקורס): 1. Kandel, ER and Schwartz, JH (2000) Neuroscience. McGraw Hill, 4th edition. 2. Kiernan, JA (2005) The Human Nervous System – An Anatomical Viewpoint. Lippincott Williams & Wilkins, 9th edition. |
| נוירואנטומיה ב (0455.2775) Neuroanatomy B |
| פרטי הקורס |
| הקורס מבוסס על הידע שנרכש בקורס נוירואנטומיה א' ולפיכך נפתח בחזרה על הרכיבים העיקריים של מערכת העצבים המרכזית. נתאר בפירוט את המבנה של חתך בחוט השדרה ושל העצב הספינאלי בהתייחס למערכות התנועה, למערכות התחושה הכללית והעמוקה והעצבוב האוטונומי. כן נתייחס לנוירואנטומיה של הרפלקסים הספינאליים. בהמשך נתאר את המבנה הפנימי של גזע המח ונדון בנוירואנטומיה של מערכות החושים האחרות: ראיה, שמיעה, טעם וריח. לאורך הקורס יידונו נושאים נבחרים בנוירולוגיה. |
| דרישות קדם: נוירואנטומיה א' נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה סופית בכתב (85%) בוחן אמצע (15%) |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: במהלך הקורס יקבלו הסטודנטים חומר עזר. באופן עקרוני מומלצים לקורס זה שלושה ספרים (עמודים ספציפיים לקריאה יוגדרו בראשית הקורס): 1. Kandel, ER and Schwartz, JH (2000) Neuroscience. McGraw Hill, 4th edition. 2. Kiernan, JA (2005) The Human Nervous System – An Anatomical Viewpoint. Lippincott Williams & Wilkins, 9th edition. 3. Aminoff, MJ et al. (2005) Clinical Neurology. Lange, 6th edition. |
| נושאים באיכות הסביבה (0455.8888) TOPICS IN ENVIRONMENTAL QUALITY |
| פרטי הקורס |
| הקורס עוסק באיכות הסביבה כנושא בעל נגיעה לכל תחומי החיים. הקורס יועבר על ידי מרצים מפקולטות שונות וכן מרצים ממוסדות אחרים בארץ ויסקור את נושא איכות הסביבה מנקודות מבט שונות: • היבטים ביולוגיים: סביבות חיים ומאפייניהן (התייחסות ספציפית לזיהום סביבתי), טוקסיקולוגיה סביבתית. • היבטים גיאוגרפיים-גיאופיזיים: הידרולוגיה, גיאולוגיה, אקלים, בעיות דמוגרפיות, חישה מרחו ללימוד איכות הסביבה. • היבטים משפטיים: חוק ומשפט סביבי, צדק סביבתי. • היבטים כלכליים: כלכלה סביבתית. • היבטים הנדסיים תכנוניים: הנדסה סביבתית, פיתוח בר קיימא, תכנון ובינוי. • היבטים בריאותיים: רפואה סביבתית, אפידמיולוגיה של זיהום. הרכב הנושאים המדוייק בשנה נתונה יקבע גם בכפיפות לזמינות מרצים המתמחים בתחומים השונים. |
| נושאים עכשוויים בביוטכנולוגיה של צמחים (0455.1641) Current Topics in Plant Biotechnology |
| פרטי הקורס |
| הקורס יעסוק ביישומים עכשוויים של מערכות צמחיות בתחומים שונים של הביוטכנולוגיה. הקורס יתמקד ב: צמחים טרסגניים לייצור חלבונים חשובים לרפואה. צמחים כאמצעי חיסון מפני מחלות, ע"י ביטוי אנטיגנים. מטבוליטים משניים כתרופות. שיפור מזון: חומצות שומן בלתי רוויות, בטא קרוטן, ויטמינים, חלבונים עשירים בחומצות אמינו הכרחיות וכו'. יישומים ביוטכנולוגיים עכשוויים שמתפרסמים בספרות בעיתוי קרוב למתן ההרצאה. תעשיות בתחום ביוטכנולוגיה של צמחים- הרצאות של נציגי חברות. |
| דרישות קדם: אין |
| הרכב ציון: הקורס יזכה בנקודה אחת, ללא בחינה |
| ניהול פרויקטים (0455.2460) PROGECT MANAGEMENT |
| פרטי הקורס |
| הקורס מציג את התחום של ניהול פרויקטים. נושאי הקורס כוללים: ייזום, תכנון, ניהול ובקרה של פרויקטים. במהלך הקורס יכירו הסטודנטים את השיטות והכלים לייזום פרויקט, ניתוח ובחירת חלופות, תכנון תכולת עבודה, תכנון תקציב פרויקט, תזמון פעילויות, ניהול סיכונים ובקרת התקדמות. במהלך הקורס יידרשו הסטודנטים לתרגל תכנון של פרויקט, אשר נושאו יוגדר על ידם, בתיאום עם המרצה. ביצוע הפרויקט לא יהווה חלק מהקורס, אולם הקבוצה תידרש להתייחס להיבטים השונים של התכנון והניהול הייחודיים לפרויקט שבו בחרו, ולבחון את הפרויקט בהיבט מתודולוגי-ניהולי. הקורס יכלול הרצאות פרונטליות בנושאים השונים, אשר ילוו בהצגת דוגמאות של יישום התוכן הנלמד. במהלך הקורס יתכננו הסטודנטים פרויקט, אשר באמצעותו יתורגלו ההיבטים השונים של יישום הטכניקות והכלים לניהול פרויקט. המטלה בקורס כוללת הן בחינת סיום והן עבודה מסכמת קבוצתית. |
| הרכב ציון: 40% - הגשת עבודה מסכמת קבוצתית. 60% - מבחן סיום. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ניתוח תוצאות ניסויים (0455.2680) ANALYSIS OF EXPERIMENTAL RESULTS |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס היא להקנות לתלמידים את הבנת הבסיס הניסויי של מחקר ביולוגי. הקורס יינתן במשך סמסטר אחד, לקבוצות קטנות של תלמידים. הקורס יעסוק בקריאה מכוונת של מאמרים מדעיים העוסקים בנושא נבחר אחד; התלמידים יעסקו בניתוח המטרות, שיטות העבודה, המסקנות והתוצאות של כל מאמר. הדיון מנוהל ע”י התלמידים עצמם והמדריך משמש רק כמנחה או מספק ידיעות רקע בעת הצורך. בקבוצה של פרופ’ גיל סגל תלמדנה גישות למחקר מולקולרי של חיידקים פתוגנים בהקשר של הבנת מנגנוני הפתוגניות ברמה המולקולרית והתאית. |
| דרישות קדם: נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה + השתתפות |
| מטלת סיום: מבחן בית |
| ספרות: papers will be provided to all students |
| ניתוח תוצאות ניסויים (0455.2813) ANALYSIS OF EXPERIMENTAL RESULTS |
| פרטי הקורס |
| הקורס יינתן ב – 3 קבוצות שונות ע"י מורים שונים: נושאי המחקר ומטלות סוף הקורס שונים בכל קבוצה. מטרת הקורס היא להקנות לתלמידים ידע בסיסי בניתוח והבנה של מאמרים מדעיים תוך כדי התייחסות למספר נקודות עיקריות, כגון: מה הן מטרות המחקר, כיצד מתכננים ניסוי מדעי, מה הוא הבסיס שעומד מאחורי שיטות המחקר בהן השתמשו, הבנת דרך הצגת התוצאות, דרך הסקת המסקנות מהניסויים ומשמעותן, הבנת המגבלות של ניסוי והמסקנות שניתן להסיק ממנו. במהלך הקורס יוצגו בין שניים לשלושה מאמרים שלגביהם יתקיים דיון (שמתבצע בעיקרו על די הסטודנטים) לאורך כל הסמסטר. קריאת המאמרים והשתתפות פעילה של הסטודנטים הינפ חלק עיקרי וחשוב בקורס. קבוצה 01 – פרופ' אליאורה רון נושא המאמרים הוא – אנליזה גנטית ומולקולרית של מנגנוני בקרה מערכתית על ביטוי גנים בחיידקים. הציון יינתן על סמך מבחן בשיעור האחרון תוך כדי התחשבות בהשתתפות בכיתה. קבוצה 02 – ד"ר גיל סגל נושא המאמרים יהיה מחקר של מערכות פתוגניות בחיידקים. דרך המחקר של מערכות אלו והשימוש בידע שמצטבר על מערכות אלו כדי להתגבר על חיידקים גורמי מחלות. מוגבל ל – 30 סטודנטים שנה ב' בלבד הרכב הציון בקורס: 70% - נוכחות והשתתפות בשיעורים 30% - מבחן בית קבוצה 03 – פרופ' ורשנר דניאל |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ניתוח תנועה ודפוסי התנהגות בבעלי חיים (0455.3543) ANALYSIS OF MOVEMENT AND BEHAVIOR PATTERNS IN ANIMALS |
| פרטי הקורס |
| קורס זה מאפשר לתלמידים המעוניינים בתחום התנהגות בעלי חיים ללמוד כיצד לייצג ולנתח התנהגות באופן שיחשוף את מבנה ההתנהגות הנושאים שבהם יעסוק הקורס: שימוש בשפה גיאומטרית סימבולית (כתב התנועה אשכול-וכמן) לניתוח ההתנהגות ולזיהוי דפוסי תנועה. בקרה של תנועה (MOTOR CONTROL). חלק מהקורס ישא אופי של סדנאות. השתתפות בקורס מותנית באישור המרצה. |
| מס תלמידים: 20 |
| דרישות קדם: דרישות מוקדמות: רצוי מבוא להתנהגות בעלי חיים. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: השתתפות בשיעורים ועבודת בית |
| מטלת סיום: מבחן בית |
| סוגיות במדעי המוח (0455.1559) ISSUES IN BRAIN SCIENCES |
| פרטי הקורס |
| במסגרת הקורס יינתנו הרצאות בתחום הנוירוביולוגיה ובתחום מדעי המוח ע"י מרצים אורחים ויתקיימו דיונים בסוגיות הנלמדות |
| סוציוביולוגיה (0455.2563) ANIMAL SOCIOBIOLOGY |
| פרטי הקורס |
| דיונים בבעיות אבולוציוניות של התנהגות חברתית; ברירה קבוצתית; ברירה אינדיבידואלית; ברירת קרובים, יחסים של זכר ונקבה, הורים וילדים; שותפויות וחרקים חברתיים; מערכות רבייה; טריטוריות ולהקות. |
| דרישות קדם: אין נוכחות חובה |
| הרכב ציון: בחינה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: הספר אלטרואיזם טווסים ועקרון ההכבדה |
| סטטיסטיקה (0455.1806) Statistics |
| פרטי הקורס |
| תוכן הקורס • הסתברות: א. מרחב מדגם, מאורע ב. הסתברות ושכיחות יחסית ג. איחוד, חיתוך ומשלים של מאורעות ד. הסתברות מותנית ואי תלות: נוסחת ההסתברות השלמה וחוק בייז ה. משתנים מקריים חד ממדיים, תוחלת ושונות ו. התפלגויות חשובות: בינומית, גיאומטרית, פואסונית, מעריכית ונורמלית ז. משפט הגבול המרכזי. • סטטיסטיקה תאורית: א. הסטוגרמה ב. מדדים מרכזיים ומדדי פיזור ג. תרשים קופסה והשואה גרפית של קבוצות ד. טרנספורמציות של משתנים ותרשים הסתברות נורמלית • הסקה סטטיסטית תוך שילוב תכנת ה SPSS: א. מושגי יסוד בבדיקת השערות: השערת ”אפס” והשערה אלטרנטיבית, רמת מובהקות: נצפית (p-value), עוצמה. ב. הסקה על ממוצע ופרופורציה במדגם אחד ג. הסקה על הפרש ממוצעים והפרש פרופורמציות (שני מדגמים) ד. מבחן חי בריבוע לטיב התאמה ולאי תלות. • מתאם ורגרסיה: א. תרשים פיזור ב. מקדם מיתאם ג. קו רגרסיה ד. הסקה סטטיסטית ברגרסיה. |
| הרכב ציון: בחינה סופית 100% חובה להגיש 75% מהתרגילים. סטודנט שלא יעמוד בדרישה זו לא יוכל להיבחן. ניתן להגיש את התרגילם בזוגות. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: • אלונה רביב ותלמה לויתן, מבוא להסתברות וסטטיסטיקה – הסתברות • אלונה רביב ותלמה לויתן, מבוא להסתברות וסטטיסטיקה – הסקה סטטיסטית • אורי ליברמן, מבוא לתורת ההסתברות • אוניברסיטה פתוחה, קורסים למדעי החברה ולמדעים מדויקים • רונית אייזנבך, סטטיסטיקה ללא סטטיסטיקאים • Statistics: A biomedical introduction Brown & Hollander, • Statistics Freedman, Pisani & Purves, |
| סיורי גן זאולוגי (0455.1640) Trips in experimental zoo |
| פרטי הקורס |
| הקורס ניתן ע\”י מורי הפאוניססטיקה,האקולוגיה וההתנהגות של המחלקה לזואולוגיה וכולל סיורים בגן הזואולוגי על מבחר קבוצות בעלי-חיים (צפרים,זוחלים, מכרסמים, יונקים, טורפים, מפריסי פרסה) ועל מבחר נושאים (נדידת צפרים, התנהגות חיזור, חקירת המרחב,שירה בצפרים). הקורס כולל 7 סיורים שמתוכם יש חובת השתתפות ב6. |
| מס תלמידים: 80 |
| הרכב ציון: חובת השתתפות מוחלטת ב6 מתוך 7 סיורים. |
| סמינר בביולוגיה כימיה - ב' (0455.2850) Seminar Biology-Chemistry |
| פרטי הקורס |
| הקורס יינתן אחת לשבועיים בד"כ. במהלך סמסטר א' יוצגו עבודות של חוקרים אורחים בתחומי הביולוגיה, הביוכימיה והביופיזיקה. נושאי הסמינרים יהיו בד"כ קשורים לממשק שבין המחקר האקדמי ליישומיו בתעשייה. בסמסטר ב' סטודנטים משנה ג' יציגו את פרויקט המחקר שהם מבצעים באחת מעבדות המחקר או עבודה סמינריונית באחד מהתחומים המוצעים ע"י מרכזי התוכנית. |
| סמינר מדעי המוח - א' (0455.2824) SEMINAR IN BRAIN SCIENCES |
| פרטי הקורס |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינר מדעי המוח - ב' (0455.3824) BRAIN SCIENCES - SEMINAR |
| פרטי הקורס |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| סמינריון בביוטכנולוגיה (0455.2459) Biotechnology Program Seminar |
| פרטי הקורס |
| התלמידים מקבלים להכין עבודה בנושא ביוטכנולוגי עדכני ולהציג אותה בהרצאה בת 20 דקות וגם כעבודה מודפסת. |
| הרכב ציון: הקורס מיועד לתלמידי המסלול לביולוגיה בדגש ביוטכנולוגיה בלבד. התלמידים יכינו נושא ביוטכנולוגי עדכני להרצאה בת 20-30 דקות ובנוסף יגישו עבודה בכתב באותו נושא. |
| פיזיולוגיה של בעלי חיים (0455.2552) Animal Physiology |
| פרטי הקורס |
| לימוד בגישה השוואתית, של העקרונות הבסיסיים בתהליכים הפיסיולוגיים ותפקודי מערכות הגוף, בבעלי חיים מבתי גידול שונים. חלק I פיסיולוגיה כללית: • הומאוסטזיס, הרכב נוזלי הגוף ומדוריהם. • התא כיחידה הומאוסטטית, השפעת הטמפרטורה על תהליכים ביולוגיים. • כוחות מניעים, זרמים ושטפים טרנס-ממברנליים של מים ומומסים. • מעבר דרך אפיטלים • תפקודי הכיליה היונקית. חלק II רקמות אקסיטביליות: • יצירת סיגנלים והולכתם במערכת העצבית. • אלקטרופיסיולוגיה ומכניקה של התכווצות שריר משורטט ושריר חלק. חלק III נשימה ותרמורגולציה: • אנרגיה • דם וסירקלציה. • נשימה. • מטבוליזם. • תרמורגולציה. |
| הרכב ציון: בחינה-100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Eckert*,R.,D. Randall and G. Augustine: Animal Phsiology. W.H. Freeman & Company. Stein, W.D.: Channels, Carriers and Pumps. An Introduction to Membrane Transport. Academic Press Inc. Schmidt-Nielsen*, K. Animal Physiology. Adaptation and Environment Cambridge University Press. |
| פיזיולוגיה של הצמח (0455.2527) Plant Physiology |
| פרטי הקורס |
| • הקדמה - ייחודיותו של הצמח • פוטוסינטזה כמאפיינת את התא הצמחי • התמרת אור לאנרגיה כימית , פוטואינהיביציה • קיבוע פחמן ופוטורספירציה מנגנוני בקרה בראקציות האור ובקבוע פחמן • קליטת מים ומינרלים • עקת מלח ומנגנוני עמידות למליחות (גנים מעורבים והנדסה גנטית) • מנגנון תנועת המים בצמח השלם (Cohesion-Tension Theory) • תגובת הצמח למתכות כבדות, צמחים צוברי מתכות, ביוטכנולוגיה סביבתית • בקרת פיוניות בתגובה לאותות סביבתיים, ואיתות בתאי צמחים • טרנסלוקציה של מוטמעים ויחסי מקור (SOURCE) - מבלע (SINK) • הורמונים צמחיים ותהליכי צמיחה • בקרת התמיינות • בקרת התפתחות • תגובות לעקה • בקרת גידול והתפתחות העובר והנבט • הזדקנות ואפופטוזה • אינטראקציות בין פתוגנים וצמחים • תגובות הצמח לעקות אביוטיות • סיכום - לאן מועדות פנינו |
| הרכב ציון: בחינה סופית 100% |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| פיזיקה ב (0455.1807) Physics - B |
| פרטי הקורס |
| 1) חוק קולון, שדה חשמלי 2) חוק גאוס, מוליכים 3) פוטנציאל חשמלי, קבלים 4) זרם, חוק אוהם, והתנגדות 5) מעגלים חשמליים 6) השדה המגנטי, כוח לורנץ 7) תנועה תחת השפעת שדה חשמלי ומגנטי 8) השראות מגנטית וגנראטור 9) מקסוול ואיינשטיין במשך הקורס יובאו דוגמאות מעולם הביולוגיה. |
| הרכב ציון: 90% מבחן סופי, 10% תרגילים, עד 16 נקודות זכות ממטלות באתר הקורס. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| פיסיקה - א' (0455.1805) Physics A, Life-Science Students |
| פרטי הקורס |
| ניתן ע”י ביה”ס לפיזיקה ואסטרונומיה, הפקולטה למדעים מדוייקים. 1.מבוא מתמטי קצר. פונקציות טריגונומטריות ואחרות. מושגי הנגזרת והאינטגרל. 2.וקטורים בשני ממדים ובשלושה ממדים. חיבור וחיסור וקטורים. רכיבי וקטורים. מכפלות של וקטורים. 3.קינמטיקה. תנועה בממד אחד. מהירות ותאוצה. תנועה בתאוצה קבועה; נפילה חופשית. 4.תנועה בשני ממדים. תנועת קליעים. תנועה מעגלית. 5.חוקי התנועה של ניוטון. 6.שימושים בחוקי ניוטון. 7.עבודה ואנרגיה קינטית. 8.אנרגיה פוטנציאלית ושימור אנרגיה. 9.תנע, מתקף והתנגשויות. 10.תנועה מחזורית. 11. אנרגיה בתנועה הרמונית פשוטה. 12.גלים. 13.אופטיקה וספקטרוסקופיה; חוק בֶּר-למבֶּר. |
| הרכב ציון: תלמיד לא ייגש לבחינה הסופית אם לא יגיש לפחות 80% מהתרגילים. הציון הסופי יקבע כדלקמן: בחינה-90%. הגשת תרגילים: 10%. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: H.D. Young and R.A Freedman, Sears and Zemansky\\\\’s University Physics. Addison-Wesley, 2000. |
| פרמקולוגיה (0455.3465) Pharmacology for Biotechnologists |
| פרטי הקורס |
| - הקורס יקנה בסיס כללי בפרמקולוגיה אשר ייתן בידי הסטודנט כלים הדרושים להשלמת הידע בתחומים הספציפיים השונים של הטיפול התרופתי, הדגש בקורס יושם על מנגנוני הפעולה ברמת התא, הרקמה והאיבר. - פרמקוקינטיקה (משטר מינון בשלבי חיים). - פרמקודינמיקה ומערכת העצבים האוטונומית (שינויים פרמקודינמיים, גיל ומטען גנטי) - כיווץ והרפייהה של כלי דם ושריר חלק (יתר לחץ דם, אנגינה פקטוריס, אסטמה). - מערכת הורמונלית (סטרואידים, ויסות פריון). - מערכת העצבים המרכזית ונוירוטרנסמיטורים (הרדמה, פרקינסון, סכיזופרניה ודכאון) - עקרונות טיפול אנטימיקרוביאלי - עקרונות כימותרפיה בסרטן - תרפיה גנטית - תופעות לוואי, תופעות שליליות ושימוש לרעה בתרופות (רעילות, התמכרות) |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| ספרות: Rang H.P., Dale, M.M., Ritter J.M. and Moore P.K. Pharmacology 5th edition (2003) |
| פרקים בביוטכנולוגיה (0455.3779) CHAPTERS IN BIOTECHNOLOGY |
| פרטי הקורס |
| • מבוא: תהליך פיתוח של מוצר ביוטכנולוגי • ביוקטליזה יישומית: שימושים תעשייתיים, אנאליטיים ודיאגנוסטיים באנזימים ; ייצור מיקרוביאלי של תוספי מזון, כימיקלים ותרופות: יישומים תעשייתיים של מיקרואורגניזמים בתעשיות המזון, הפרמצבטיקה והכימיה; • ייצור נוגדנים: נוגדנים פוליקלונאליים ומונוקלונאלים, ייצור ופיתוח נוגדנים חדשים בביולוגיה מולקולרית. • תרביות תאים מבע”ח |
| הרכב ציון: חובת הקורס: הכנת עבודה והעברת מצגת קצרה על טכנולוגיה/מוצר במהלך הקורס (70% מהציון)+ בחינה בכתב על מושגי יסוד (30% מהציון) |
| מטלת סיום: מבחן בית |
| צמחי תועלת (0455.3059) economic plants |
| פרטי הקורס |
| צמחי תבלין צמחי סיבים צמחי שרף צמחי מאכל צמחים לתעשיית העץ צמחי נוי צמחי שמן בין הצמחים הנ"ל יושם דגש על כאלה בעלי חשיבות לכלכלה העולמית כמו: שעם, גומי, קקאו, קפה ותה. בנוסף הקורס כולל 4 סיורים מחוץ לאוניברסיטה, כל סטודנט משתתף ב- 2 מן הסיורים. במהלך הקורס יתקיימו גם סיורים בגן הבוטני באוניברסיטה. הנוכחות בכל השיעורים ובכל הסיורים היא חובה. |
| מס תלמידים: 100 |
| דרישות קדם: דרישה מוקדמת השתתפות בקורס הכרת עולם הצומח אפשר גם במקביל נוכחות חובה |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| קינטיקה ותרמודינמיקה (0455.3776) Kinetic and Thermodynamics |
| פרטי הקורס |
| תרמודינמיקה כללית, תרמודינמיקה של תהליכים כימיים וביוכימיים במערכות הומוגניות אידאליות וריאליות, תוך דגש על: אנרגיה חופשית ופוטנציאל כימי, אלקטרוכימיה במערכות ביולוגיות, צימוד אנרגטי של תהליכים ביולוגיים, שווי משקל כימי בריאקציות אנזימטיות ובתהליכי קישור. תרמודינמיקה של מערכות הטרוגניות, קינטיקה כימית, קינטיקה של ריאקציות אנזימטיות, מנגנוני ריאקציה וקינטיקה של ריאקציות מהירות, בעיות נבחרות בקינטיקה של תהליכים ביולוגיים. |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |
| שיטות בחקר איכות הסביבה - טוקסיקולוגיה (0455.3606) Methods in Environmental Quality Research - Toxicology |
| פרטי הקורס |
| מטרת הקורס: הכרת מגוון שיטות נבחרות לאבחון חשיפה של בעלי חיים ואדם לתרכובות רעילות, שמקורם מהתעשייה או החקלאות, המזהמות את הסביבה וגורמות בין השאר לפגיעה במערכת העצבים ולמחלות ממאירות. תכנית הקורס: : כל אחד מהתלמידים יתמחה בשיטה חדשנית לאבחון ביולוגי של חשיפה לסוגים מוגדרים של מזהמים כגון אנזימי דטוקסיפיקציה מ-(CYP) Phase I, Epoxide hydrase, GST) ) Phase II, יציבות ממברנלית, פגיעה בDNA, שינויים במנגנוני בקרת תהליכי הרבייה, איתור נאופלסיה, ושיטות משולבות של הגדרת סיכון – risk assessment כגון battery of biomarkers, microarray ו – proteomic analysis. כל אחד מהתלמידים יכין עבודה סמינריונית להגשה בע”פ ובכתב על אחת משיטות אלה אותה יקבל בתחילת הקורס. התלמידים יחולקו לקבוצות כאשר כל קבוצה תתמודד עם בעיה אקטואלית של איכות הסביבה בישראל כגון זיהום חופי הים, איכות מי השתייה, מים מושבים וזיהום מי קדוחים ונחלים, זיהום אויר בגזים ובנפולת ארובות, אפידמיולוגיה של תחלואה סביבתית והשלכות אפשריות של לוחמה כימית.כל תלמיד בקבוצה יביא את התמחותו הספציפית באחת מהשיטות והקבוצה תציע תוכנית משולבת לאבחון וטיפול בבעיה הסביבתית הספציפית שאיתה הוטל עליה להתמודד בצורה של סמינריון קיבוצי שיוגש בע”פ ובכתב. הקורס יכלול: 1. סיור להבנת המורכבות של שמירה על איכות הסביבה בישראל. |
| הרכב ציון: הציון: יורכב מהגשת עבודה סמינריונית אישית ועבודה סמינריונית קיבוצית . שתי העבודות יוגשו בע”פ ובכתב. |
| מטלת סיום: עבודה\פרויקט |
| תכנות ב - perl לביולוגים (0455.3065) PERL programming for biological applications |
| פרטי הקורס |
| הקניית עקרונות התכנות בשפת Perl, ויישומם בניתוח רצפי DNA וחלבונים, חיפוש במאגרי מידע, ואנליזה ביואינפורמטית. הקורס מיועד לבעלי ידע בסיסי בתפעול המחשב ואינו מצריך ידע מוקדם בתכנות. נושאי הקורס: Scalar data, strings, arrays, flow control, variable scope, associative arrays (hashes), advanced data structures, file handling, pattern matching, subroutines, pattern matching, BioPerl.. מבנה הקורס - הקורס יכלול מדי שבוע 3 שעות של הרצאה + תרגול בכיתת המחשבים. |
| מס תלמידים: 50 |
| הרכב ציון: דרישות הקורס: 6 תרגילים – 30% מהציון הסופי. הגשה תוך שבועיים ממועד קבלת התרגיל. מבחן – 70% מהציון הסופי.מטלת סיום: בחינה מול מחשב |
| תכנות יישומי לביולוגים (0455.2066) Practical programming for biologists |
| פרטי הקורס |
| מטרות הקורס: 1. הכרות בסיסית עם המחשב ומבנהו 2. הכרות עם שפות תכנות בכלל ו-matlab בפרט. 3. הכרת שפת התכנות וסביבת העבודה matlab. 4. הכרת אופן השימוש בתכנות וב-matlab לפתרון בעיות במחקר. סילבוס הקורס יכלול שני חלקים: 1. הקדמה כללית וקצרה לתכנות בה ילמדו עקרונות שפת התכנות matlab וסביבת העבודה. 2. בחלקו השני והעיקרי של הקורס כל שיעור יוקדש לטכניקת עיבוד, ניתוח והצגת מידע מחקרי תוך שימוש בכלים התכנותיים שנלמדו בחלק הראשון. 3. נושאי השיעורים: • הכרת המחשב • תוכנית מחשב • משתנים • סביבת העבודה • קלט ופלט • בקרת זרימה • לולאות • מטריצות • מבני משתנים • פונקציות • אלגוריתמים • יעילות וסיבוכיות • גרפיקה ב Matlab • עיבוד תמונה • זיהוי אובייקטים • עיבוד אותות (signal processing) • Clustering • התאמת פונקציות (curve fitting) • ממשק גרפי • שפת C, מצביעים וגישה לזיכרון |
| דרישות קדם: מומלץ ידע מוקדם בביולוגיה |
| הרכב ציון: הציון בקורס יורכב מ : • 2 בחנים - 18% כל אחד על החומר הנלמד, מועדם יפורסם במהלך הקורס. • 64% - עבודה מסכמת שתעשה בשלבים. העבודה המסכמת תעשה על data ניסויי, ביולוגי או מחקרי אחר. |
| ספרות: • מבוא לתכנות ולהכרת המחשב ויישומיו – טובה צורף יחידות 1-4, האוניברסיטה הפתוחה. • The Matlab Handbook – Eva Part-Enander • Matlab – help הפקודה • המדריך השלם לשפת C – יצחק עמיהוד, הוד עמי • A Book on C / Kelley and Pohl • The C Programming Language / Kernighan and Ritchie |
| תקשורת בין גנומים באאוקריוטים (0455.3048) Communication Between Genomes in Eukaryotes |
| פרטי הקורס |
| אבולוציה של הגנום הגרעיני וגנומים של אברונים (מדוע יש גנים באברונים, שריד אבולוציוני או יתרון פונקציונלי?) מבנה וביטוי הגנומים באברונים (כלורופלסט, מיטוכונדריה, ואברונים ייחודיים בפרוטוזואה ובאצות) מעבר גנים בין הגנומים השונים בתא, או בתוך גנומים (מתי? באיזו תדירות? מה גורלם?) מנגנוני תקשורת בין הגרעין לאברונים, ולהפך. חשיבותם בתהליכים ביוכימיים ותאיים (פוטוסינתזה, מטבוליזם, הזדקנות ומוות של תאים). בקרת שיעתוק ותרגום באברונים Transposable Elements מניפולציות גנטיות של אברונים וחשיבותן בחקלאות וברפואה. |
| דרישות קדם: ההוראה בקורס תתבסס על ידע מוקדם מהקורסים הבאים: מבוא למדעי הצמח שנה א’, פיסיולוגיה של הצמח שנה ב’, ביולוגיה של התא שנה א’, גנטיקה שנה ב’, ביוכימיה א’ ו-ב’- שנה ב’, או קרוסים מקבילים. נוכחות חובה |
| הרכב ציון: 100% בחינה בכתב |
| מטלת סיום: בחינה בכתב |