Supplementary information of the paper:

Parsimony analysis of indels in protein-coding genes to resolve metazoan relationships

by Belinky F. Cohen O. Huchon D.

Concatenated sequence alignments and indels (NEXUS format)

 

Database

Ensembl-based dataset

KOG-based dataset

Indel length

All indels

Multi - residue

Single - residue

All indels

Multi - residue

Single - residue

Coding

/

Combination of taxa

SIC

MCIC

SIC

MCIC

SIC

SIC

MCIC

SIC

MCIC

SIC

MSA-1

ENS1A

ENS1B

ENS1C

ENS1D

ENS1E

KOG1A

KOG1B

KOG1C

KOG1D

KOG1E

MSA-2

ENS2A

ENS2B

ENS2C

ENS2D

ENS2E

KOG2A

KOG2B

KOG2C

KOG2D

KOG2E

MSA-3

ENS3A

ENS3B

ENS3C

ENS3D

ENS3E

KOG3A

KOG3B

KOG3C

KOG3D

KOG3E

MSA-4

ENS4A

ENS4B

ENS4C

ENS4D

ENS4E

KOG4A

KOG4B

KOG4C

KOG4D

KOG4E

MSA-5

ENS5A

ENS5B

ENS5C

ENS5D

ENS5E

KOG5A

KOG5B

KOG5C

KOG5D

KOG5E