רשימת קורסים לשנת הלימודים תשס"ד: מדעי הצמח

קורסי חובה

- מבוא לאקולוגיה (שנה א', ע. אשל, ת. דיין [המחלקה לזואולוגיה])

INTRODUCTION ECOLOGY

הקורס יהיה מורכב מ- 4 חטיבות:

   ·   מבוא לביוגיאוגרפיה ולביולוגיה אורגניזמלית

   ·   אקולוגיה של אוכלוסיות

   ·   אקולוגיה של חברות ומערכות אקולוגיות

   ·   האדם ומקומו במערכת האקולוגית.

ספרות מקצועית:

 

   ·   Krebs, C.J., Ecology: The Experimental Analysis of Distribution and Abundance, 5^th   edition , 2000 , Harper Collins College Publishers, Inc., NY.

 

   ·   Begon, M., Harper, J.L. and Townsend, C.R., Ecology: Individuals, Populations, and Communities, 3^rd edition, 1996, Blackwell Scientific Publications, Cambridge.

 

   ·   Ricklefs, R.E., and Miller, M.L., Ecology, 4^th edition, 1999, W.H. Freeman & Co., New York.

 

 - בוטניקה ב' - (הכרת עולם הצומח) (שנה ב', י. גרטי)

EVOLUTION OF THE PLANT KINGDOM

כחוליות (ציאנובקטריה); אצות ירוקיות; אצות חומיות; עולם הפטריות; חזזיות; טחבים; שרכים; חשופי זרע; צמחי פרחים.

במהלך ההרצאות יודגשו היבטים אבולוציוניים, אקולוגיים וכן שימושי האדם בצמחים מן הקבוצות השונות.  יחסי האדם לצמחים מזיקים. יחסים בין צמחים לאורגניזמים אחרים. הצמחים תחת תנאי אקלים משתנים.

הרכב הציון הסופי

מבחן                            80%

בחנים + סיורים                        20%

הנוכחות בכל השעורים והסיורים חובה.

 

 - מבוא למדעי הצמח (שנה א', נ. אוהד, ד. חיימוביץ, ש. ילובסקי)

INTRODUCTION TO PLANT SCIENCES   

מטרת הקורס היא: להציג את חשיבותה המרכזית של ממלכת הצומח בעולם החי, ותרומת המחקר במדעי הצמח לביולוגיה המודרנית.

במשך הקורס נציג את מחזור חיי הצמח תוך מתן דגש על תהליכים יחודיים לממלכת הצומח הכוללים:

   ·   האור כאות להשראת תהליכים התפתחותיים [התפתחות הזרע ונביטה]

   ·   התמרת האור לאנרגיה כימית בתהליך הפוטוסינטזה

   ·   גנטיקה ואבולוציה

   ·   התפתחות רקמות הצמח

   ·   העברת אותות ובקרת תהליכי התפתחות והתמיינות ע"י הורמונים

   ·   מבנה ותפקוד אברי הצמח: שורש, גבעול ועלה

   ·   תהליכי רבייה ברמה המבנית, מולקולרית וגנטית

   ·   יחסי צמח-סביבה

   ·   מסלולים מטבולים יחודיים לצמחים

   ·   ביוטכנולוגיה בצמחים - לאן מוביל המחקר בשנת 2000

   ·   הדגמות מעבדתיות ותרגילים משולבים עם ההרצאות

 

ספרות:

Raven, Evert, Eichhorn: Biology of Plants, 6^th  Edition, 1998

W.H. Freeman and Conpany, NY

 

Campbell: Biology. 4^th Edition, 1996

               Benjamin/Cummings , California

 

 - פיסיולוגיה של הצמח*( שנה ב', מ. גורביץ, ג. ססה, ה. פרום)

PLANT PHYSIOLOGY

_{§          הקדמה - ייחודיותו של הצמח}

_{§          מאפייני התא הצמחי}

_{§          פוטוסינתזה:                        התמרת אור לאנרגיה כימית , פוטואינהיביציה}

_{§          קיבוע פחמן ופוטורספירציה}

_{§          מנגנוני בקרה}

_{§          מטבוליזם חנקן וגפרית}

_{§          קליטת מים ומינרלים}

_{§          טרנסלוקציה של מוטמעים ויחסי מקור (SOURCE) - מבלע  (SINK)}

_{§          הורמונים צמחיים ותהליכי צמיחה}

_{o          בקרת התמיינות}

_{o          בקרת התפתחות}

_{o          תגובות לעקה}

_{§          בקרת גידול והתפתחות העובר והנבט}

_{§          הזדקנות ואפופטוזה}

_{§          אינטראקציות בין פתוגנים וצמחים}

_{§          תגובות הצמח לעקות אביוטיות}

_{§          סיכום - לאן מועדות פנינו}

_{הרכב הציון הסופי:}

_{בחינה סופית                         100%}

_{_______________}

_{*                      מומלץ לתלמידים להשתתף גם במעבדה שתזכה את התלמיד בשתי שעות בחירה והציון בה יהווה ציון מגן – 30% מציון הקורס.}

 

קורסי בחירה

 - מעבדות מתקדמות בבוטניקה אורגניזמית, ביולוגיה מולקולרית ואגרוטכנולוגיה – פרופ' ב. סנה

ADVANCED LABRATORIES IN MOLECULAR AND ORGANISMIC BOTANY AND AGROTECHNOLOGY

 

הקורס ייערך בהנחיית מורי המחלקה למדעי הצמח ויבוצע במעבדה של כל מנחה בהתאם. רשימת הנושאים והמנחים תפורסם בלוח המודעות החל מחודש ספטמבר.

• היקף הקורס: 6 שעות שבועיות בסמסטר א', כל תלמיד ישתתף בפרוייקט מעבדתי לפי בחירתו. לקראת סוף הסמסטר על כל תלמיד להגיש למנחה דו"ח מפורט המסכם את הניסויים ותוצאותיהם.

 

מספר התלמידים – מוגבל ל – 12.

 

 

- מתמטיקה למתקדמים - ד"ר י. קוסמן  

APPLIED MATHEMATICS          

הקורס יידון בנושאים הבאים:

   ·   פונקציות רב מימדיות:

קווי גובה, נגזרות חלקיות, פונקציה סתומה, נקודות קיצון, כופלי לגרנז', גרדיאנט, אינטגרלים מרובים.

   ·   אלגברה לינארית:

מרחבים ווקטוריים, בסיסיים

 

מטריצות:       דרגה של מטריצה, מטריצה הופכית, פתרון מערכות משוואות לינאריות, דטרמיננטים

 

 - אספקטים ביולוגיים של איכות הסביבה מורי המכון לחקר שמירת הטבע

פרופ' י. גרטי [מרכז], פרופ' א. גזית, פרופ' ד. איזיקוביץ, ד"ר ע. יעבץ,  פרופ' ד. גרלינג, פרופ' א. חפץ

BIOLOGICAL ASPECTS OF ENVIRONMENTAL QUALITY

מטרת הקורס היא להציג את האינטראקציה של החי והצומח עם הפגיעה בהיבט הטבעי עקב זיהום הסביבה בתרכובות רעילות שמקורן בתעשייה ובחקלאות, או שינויים אחרים שנגרמים ע"י האדם. יבחנו תהליכים ביולוגיים-אקולוגיים של שינויי איכות הסביבה ברמה גלובלית, אזורית ומקומית. בקורס יוצגו הנושאים הנבחרים הבאים:

   ·   המחקר הרב-תחומי של איכות הסביבה (ד"ר אביגדור אבלסון)

   ·   חזזיות כביואינדיקטורים לזיהום אוויר (פרופ' י. גרטי)

   ·   מים כמשאב מוגבל - הבעיה הישראלית, זיהום מים: גורמים, השפעות ואמדן (פרופ' א. גזית)

   ·   השפעת האדם על בתי גידול ימיים (ד"ר א. אבלסון)

   ·   האינטראקציה של מזהמי סביבה כימיים מהתעשייה והחקלאות עם מערכות פיסיולוגיות ומערכות דטוקסיפיקציה של החי והצומח (ד"ר ע. יעבץ)

   ·   שיטות מולקולריות ויישומן בחקר איכות הסביבה ושמירת הטבע (ד"ר ע. מוקדי)

   ·   פגיעה של זיהומי אוויר וחומרי הדברה בתהליכי האבקה (פרופ' ד. איזיקוביץ)

   ·   הדברה ביולוגית והדברה משולבת של חרקים מזיקים (פרופ' ד. גרלינג)

   ·   הדברה ביולוגית מיקרוביאלית (פרופ' ב. סנה)

   ·   התערבות בתקשורת שבין חרקים כשיטת הדברה (פרופ' א. חפץ)

   ·   שמירת טבע - ההשפעה של פעילות האדם על אוכלוסיות של חיות בר (ד"ר אלי גפן)

 

הקורס כולל 3 סיורים (חובה)

חובת השתתפות ב- 80% מהשעורים לפחות.

ההרשמה מותנית באישור מרכז הקורס.

 

מספר התלמידים – מוגבל ל- 48.

 

 

- אספקטים ביולוגיים של הצומח הימי - ד"ר י. לפקין

BIOLOGICAL ASPECTS OF THE  MARINE VEGETATION

 

הסביבה הימית (אור בים, הרכב מי הים, גזים מומסים במי הים, גאות ושפל וכו').  מערכות הצמחים העיקריות בבנתוס הימי (פיגמנטים ותפוצה בים) ההטמעה בנציגים של המערכות העיקריות (השפעת תנאי אור שונים co₂ ביקרבונט , וכיו"ב)  תכולת יונים באצות בהשוואה למי הים.  אסטרטגיות קיום, עמידות ליובש, טמפרטורה ומליחות.  מבנה הצמח כהסתגלות לגורמי בית הגידול.  הזנה מינרלית של אצות, עשבי ים והסתגלויותיהם לחיים בסביבה הימית, תפוצה גאוגרפית של אצות - פולשים בעקבות האדם, המשיכה המינית באצות, הפרודוקטיביות בצמחי ים, השימושים באצות ים.

 

מספר התלמידים - מוגבל ל- 12.

 

 - הדברה ביולוגית של מחלות צמחים – פרופ' ב. סנה

   BIOLOGICAL CONTROL OF PLANT DISEASES

 

• יחסים אנטאגוניסטים בין מיקרואורגניזמים כבסיס להדברה ביולוגית
• המנגנונים הקשורים בהדברה ביולוגית במחלות צמחים
• קרקעות סופרסיביות למחלות צמחים (הדברה ביולוגית טבעית)
• עמידות נרכשת בצמחים לגורמי מחלות
• הדברה ביולוגית כאמצעי חיוני בחקלאות אורגנית
• ייעול פעילות המדבירים היולוגיים בעזרת הנדסה גנטית
• פיתוח תכשירים מסחריים להדברה ביולוגית במחלות צמחים
• אתגרים ובעייתיות בייצור תכשירים להדברה ביולוגית בחברות תעשייתיות
• לקראת סיום הקורס יידרש כל תלמיד להגיש בכתב ובע"פ פרוסמינר המבוסס על 5 מאמרים חדשים בנושא הדברה ביולוגית

 

 

 

 - אקולוגיה של צומח ארץ ישראל -  ד"ר מ. שטרנברג

THE VEGETATION ECOLOGY OF ISRAEL

 

מטרות הקורס "אקולוגיה של צומח ארץ ישראל" להקנות לתלמיד ידע על חברות הצומח העיקריות של ישראל והבנת הגורמים המשפיעים על תפוצה של חברות הצומח בארץ-ישראל.

 

המטרות הספציפיות של הקורס הן:

1. להקנות הכרת הצומח של ארץ-ישראל בבית גידולו.
2. להקנות הכרת האקולוגיה והביולוגיה של המינים המאפיינים הנופים השונים בישראל
3. הבנת השפעת גורמים הביוטים [קרקע, אקלים, כו'] וביוטים [תחרות, רעייה, כו'] על התפוצה של צומח ארץ ישראל.

 

הקורס יתבסס על פעילויות שיתבצעו בכיתה ובסיורים שונים ברחבי הארץ. מרכיבי הקורס העיקריים כוללים: הרצאות פרונטליות [כ- 30 שעות],  סיורים [5.5 ימים] , קריאת מאמרים, דיונים בכיתה.

 

נושאי ההרצאות:

×      חברת צמחים והגדרתה – הקדמה בנושאי פיטוגיאוגרפיה

×     השפעות גורמי מיסלע, קרקע ואקלים על תפוצת צמחים וחברות צמחים בישראל

×     חבלי צמחייה של ישראל

×     תהליכי סוקצסיה ראשונית ומשנית [סלע, שריפה, עיבוד חקלאי]

×     חברות הצמחים של חבל הים התיכוני, האירנו-טורני, הסהרו-ערבי והסודני

 

סיורים

×      תרגיל בהכרות צורות החיים והגדרת חברות צמחים בגן הבוטני [חצי יום]

×      צומח החולות והקרקעות הקלות של מישור החוף

×      צומח של דרום השפלה, צפון הנגב והר הנגב

×      צומח של השפלת יהודה והרי יהודה

×      הצומח של הכרמל וגליל המערבי

 

דרישות מוקדמות: בוטניקה ב'

 

מספר התלמידים – מוגבל  50.

 

 

 - מבוא לביוטכנולוגיה בצמחים - פרופ' ע. ברימן

INTRODUCTION TO PLANTS BIOTECHNOLOGY

 

        ·          החדרה וביטוי גנים זרים בצמחים.

        ·          שיטות ווקטורים לטרנספורמציה.

        ·          בקרת ביטוי גנים זרים בצמחים

        ·          תרביות רקמה וגידול תאים ורקמות בתרבית

        ·          השבחת צמחים לעמידויות

        ·          ייצור חומרים בעלי ערך בצמחים.

 

מספר התלמידים - מוגבל ל- 30.

 

 

 - ליתופלורה וביואנדיקטורים - פרופ' י. גרטי

LITHOPHYTES AND LITHOMICROORGANISMS

 

קורס בהכרת הליתוביולוגיה על פני סלע, על אבן ועל חומרי בניה אבניים.

דרישות צמחים ירודים וצמחים עילאיים ממסד אבני. תקיפת מסד אבני על ידי מיקרואורגניזמים ועל ידי צמחים. דגמי בלייה של סלע ושל אבן באזורים אקלימיים שונים בארץ ובעולם. אורגניזמים קריפטואנדוליתיים במדבריות קרים. הליתופלורה ופלאואקלים בישראל. משטרי הטמפרטורה והרטיבות במסדים אבניים. שרשרות מזון על פני מערכות אבניות. נזקים למבנים וליצירות אמנות בגלל ליתוביונטים.  עקרונות ושימוש בביואינדיקטורים ובביומוניטורים.

 

 

 

 - צמחי רפואה - פרופ' י. פרידמן                                                   MEDICINAL PLANTS

מטרת הקורס:  תרכובות משניות בתפקידי הגנה של הצמח האוטוטרופי, ויישומיהן לרפואה ולתבלין על ידי האדם.

נושאים נבחרים:

   ·   צמחי  רפואה כמדע בינתחומי

   ·   תאורית החותמות מול הכימיה האקולוגית

   ·   אתנופרמפקולוגיה כמותית

   ·   צמחי רעל ורפואה ויישומיהם

   ·   הצמח בתעשית התרופות

   ·   ההיבט הגנטי, החקלאי והיישומי

   ·   2 סיורי חובה

 

הרכב הציון הסופי:        בחינה בעל-פה   90%

                                    פרוסמינריון      10%

 

מספר התלמידים מוגבל.

 

 - ביולוגיה מולקולרית והנדסה גנטית של פרוקריוטים פוטוסינטטיים - פרופ' מ. גורביץ

MOLECULAR BIOLOGY AND GENETIC ENGINEERING OF PHOTOSYNTHETIC PROKARYOTES

 

   ·   הבסיס המולקולרי של מערכות קליטת האור וקיבוע פחמן

   ·   המרכז הפעיל של מערכת האור, חשיפת המבנה ואינטראקצית המרכיבים

   ·   החלבון קושר ההרביצידים במערכת האור II, תפקידים, מבנה, ביטוי ובקרה גנטית.

   ·   ציאנובקטריה כמערכת מודל ניסויית עבור הנדסת גנים בעלי חשיבות חקלאית

   ·   גישה מולקולרית לחקר ושינוי מטבוליזם הפחמן

 

 

 - מנגנונים מולקולריים בהתפתחות צמחים -ד"ר ש. ילובסקי [מרכז], ד"ר נ. אוהד

MOLECULAR MECHANISMS IN PLANT DEVELOPMENT  

 

נושאי הלימוד: הקורס יעסוק בהבנת תהליכי התפתחות, גדילה והעברת אותות בצמחים ברמה המולקולרית. נתמקד בהכרת הבקרות המולקולריות על מחזור התא ותפקוד המריסטמות הקדקודיות של הנצר והשורש.

 

מבנה הקורס: הקורס בנוי מהרצאות פרונטליות ודיונים במאמרים נבחרים.

 

הערכה: הרצאה על מאמר נבחר. תלמידי מוסמך, שמעונינים לקחת את הקורס כקורס מדרשה, יוכלו להגיש עבודה בכתב.

 

מטרה: הבנה והכרה של מנגנונים מולקולריים המעורבים בבקרה על חלוקות תאים, גדילה ודיפרנציאציה בעוברים ובמריסטמות הנצר והשורש של צמחים.

            במהלך העשור האחרון חל מהפך בהכרה ובהבנה של תהליכים מולקולריים שמבקרים התפתחות וגידול בצמחים. ההתקדמות הרבה במחקר התאפשרה בעיקר בשל זיהוי ואפיון של מוטנטים רבים בצמחי מודל כארבידופסיס, לוע הארי, עגבניה, תירס ולאחרונה גם אורז. בקורס נתמקד ונדון בממצאים החדשים תוך בחינת הקשרם לידע הקלאסי שנצבר במהלך מאות שנים של מחקר, וננסה להבין כיצד צמחים מתפתחים.

 

נלמד את הנושאים הבאים:

רקע:     מבנה והתפחות העובר ומריסטמות השורש והנצר             הורמונים צמחיים - מנגנוני בקרה בין תאית

            גדילה וגטטיבית ורפרודוקטיבית

            גורמים סביבתיים: אור - פוטורצפטורים, כוח המשיכה - סטטוליטים

הבקרה על מחזור התא בצמחים

            חלבונים המבקרים את מחזור התא בצמחים; ציקלינים, CDKs , CKLs, pRb

            חלוקת תאים במריסטמות הנצר והשורש

            פלסטיות התפתחותית - היכולת של תאים בצמחים לעבור מ- G0 ל- G1.

            השפעת הורמונים צמחיים על חלוקות תאים, רמה ודגם ההתבטאות של חלבונים המבקרים את מחזור התא.

            מוטנטים וצמחים טרנסגניים בהם יש דיכוי או הגברה של פעילות מיטוטית.

מריסטמות קדקדיות וחיקיות בנצר

            התפתחות העלה בתירס - מערכת מודל

            גנים המכילים homeobox ותפקידם

            אותות תוך ובין תאיים המבקרים את גודל המריסטמה הקדקדית - רצפטורים, ליגנדים, small GTP binding proteins ופקטורי שיעתוק

            גנים המבקרים את המעבר של מריסגטמות וגטטיביות לרפרודוקטיביות.

התפתחות פיוניות באפידרמיס העלה

            הפיונית מתפתחת יחד עם סביבתה - מודל התפתחותי דו מימדי

            מוטנטים הפוגעים בהתפתחות הפיונית

            גנים המבקרים חלוקות לא סימטריות של תאים

            שימוש בטרנספוזונים לקביעת אופן הפעילות של גנים

התפתחות הפרח

            גיתה ומודל התפתחות הפרח בוורדים

            מודל ה- ABC

            פקטורי שיעתוק ממשפחת ה- box MADS ותפקידם

            LEAFY  (LFY) בקר מרכזי של התפתחות פרחים

            תפקיד החלבונים(TFL1)  TERMUNALFLOWER1מארבידופסיס ו- SELFPRUNING(SP)  מעגבניה

            הבסיס המולקולרי ליצירת הסימטרייה בפרחים

התפתחות הזרע והעובר

            הבקרה על חלוקות תאים בעוברים

            גנים שמבקרים התפתחות בעוברים

            חלבונים ממשפחת ה- polycomb ותפקידם בבקרת ההתפתחות האנדוספרם

פוטומורפוגנזה

            פוטורצפטורים

            משפחת הפיטוכרומים מצמחים וציאנובקטריה

            העברת סיגנל במערכת הפיטוכרום מקליטת אותות האור ועד להפעלת גנים

            מוטנטים שעוברים פוטומורפוגנזה בחושך

            מערכת ה- ubiquitin ותפקידה בבקרת האור

            הפיטוכרום כקינאז - האמנם ?

 

מספר התלמידים - מוגבל ל- 30.

 

 

 - פתוגניות וסימביוזה ביחסי הגומלין בין צמחים וחיידקים - פרופ' י. ברש

PATHOGENICITY AND SYMBIOSIS DURING PLANT-BACTERIA INTERACTIONS

 

        ·          מבוא והגדרת מושגים

        ·          מנגנוני וירולנטיות בחיידקים פתוגניים ביוטרופים ונקרוטרופים

        ·          גורמי ספציפיות בקביעת תחום הפונדקאים

        ·          מנגנוני עמידות בצמחים כנגד חיידקים

        ·          מנגנונים לגרימת גידולים סרטניים בצמחים (Agrobacterium sp.)

        ·          מנגנוני סימביוזה בין חיידקים קושרי חנקן וצמחים ממשפחת הקטניות (Rhizobim sp.).

 

בהעברת החומר יושם דגש על אספקטים גנטים, מולקולרים וביוטכנולוגים.

 

מספר התלמידים - מוגבל ל- 30.

הציון: בחינה בכתב , סמינרים במסגרת הקורס.

 

 

 - יחסי-המים של צמחים - קורס וירטואלי – פרופ' ע. אשל

PLANT WATER RELATIONS – A VIRTUAL COURSE

היקף   :  4 ש"ס

סמסטר: ב'

דרך ההוראה: רשת האינטרנט ועבודה עצמית של התלמידים.

הקורס מיועד: לתלמידי שנה ג' ותארים מתקדמים. היות והלימוד יתבצע מרחוק, הקורס פתוח לתלמידים מכל האוניברסיטאות בארץ, אשר יש להם גישה לרשת האינטרנט ועומדים בדרישת הקדם.

דרישת קדם : קורס בסיסי בפיזיולוגיה של הצמח.

הציון יקבע ע"פ: השתתפות בדיונים, ועבודת גמר.

הקורס יעסוק בנושאים הבאים:

   ·       גורמים המשפיעים על יעילות קליטת מים בצמחים.

   ·       יחסי מבנה-תפקוד של מערכת ההובלה.

   ·       בקרה על הפיוניות.

   ·       התאמות לתנאי יובש.

   ·       שיטות מחקר בתחום יחסי המים של צמחים.

 

תוך כדי הלימוד בקורס ירכשו התלמידים ניסיון בשימוש ברשת האינטרנט וילמדו לכתוב דפי רשת. בקורס לא תהינה פגישות בחדרי לימוד או מעבדות. חומר הלימוד, מטלות ההוראה והשתתפות התלמידים ייעשו כולם ברשת האינטרנט באמצעות אתר Virtual T@U. ייעשה שימוש בדואר- אלקטרוני, בקבוצות דיון ומסמכים ברשת. לכל תלמיד המשתתף בקורס צריכה להיות אפשרות להשתמש ברשת האינטרנט במשך כל הסימסטר.

הלימוד יתבסס על לימוד קבוצתי של חומר מהספרות המדעית באנגלית.

כל תלמיד יידרש להכין במסגרת הקורס עבודת גמר אשר תוצג ברשת האינטרנט. לשם כך, תינתן הדרכה בהכנת דפי רשת. הציון יתבסס על השתתפות בדיונים ומילוי מטלות במהלך הסימסטר - 60% ועל עבודת הגמר - 40%.

 

 - פוטוסינתזה להלכה ולמעשה - פרופ' ס. בר

PHOTOSYNTHESIS - THEORY AND PRACTICE

הפוטוסינתזה הינה תהליך יסודי הקושר אנרגיה מאור השמש בחומרים אורגניים עתירי אנרגיה. בחלקו הראשון של הקורס יידונו ההיבטים הבאים:

        ·          תכונות הקרינה הפעילה בפוטוסינתזה

        ·          יצירת ATP וכוח מחזר

        ·          קיבוע וחיזור של co₂ ויצירת סוכרים_.

        ·          תשומת לב מיוחדת תינתן לתכונות המגנון הפוטוסינתטי המבטאות התאמה לתנאי הסביבה וכן לצמחי הים האחראים למחצית הייצור הראשוני על-פני כדור-הארץ.

 

חלקו השני של הקורס יעסוק בדרכים שונות למדידת קצב הפוטוסינתזה במעבדה ובשדה, ובכלל זה אלקטרודת החמצן, אנליזה על-ידי בליעת אור אדום רחוק [IRGA] ושיטות פלואורסצנציה. יערכו מדידות בצמחי יבשה ובצמחי ים.

מספר התלמידים מוגבל ל- 12.

 

 

 - צמחים וסביבה - קורס סמינריוני  -  פרופ' ס. בר, פרופ' ע. אשל, ד"ר מ.שטרנברג            SEMINAR IN PLANT ECOLOGY                                                                             

הקורס יעסוק בהעלאת נושאים באקולוגיה של צמחים, בניתוח בעיות ובהצעת פתרונות.

במהלך הקורס יהיה על התלמידים לקרוא חומר רקע, לעבד נושא אחד בכל סמסטר ולהרצות אותו בפני משתתפי הקורס.

 

- התאמות צמחים לחיים במים וביבשה  - פרופ' ס. בר, פרופ' ע. אשל

 

PLANT ADAPTATION TO AQUATIC AND TERRESTRIAL HABITATS

 

דרך ההוראה:                        שו"מ

מס' שעות:                 5 ש"ס (2 ש"ס  ש' , 3 ש"ס מ')

סמסטר:                    ב'

תכנית הקורס:

הקורס עוסק בבעיות העיקריות בתחום האקופיסיולוגיה של צמחים. נידונים בו התהליכים המגבילים את קצב הצמיחה הוגטטיבית בבתי גידול במים וביבשה - קיבוע הפחמן, ההזנה המינרלית וחלוקת הפחמימות בצמח. מוסברות בו טכניקות מדידה חדישות כגון שימוש באיזוטופים יציבים וב- NMR למחקר אקופיזיולוגי. כמו-כן מוצגות התיאוריות העכשוויות בעניין בקרת התהליכים, הקשר בין הנוף לשורש, וויסות השימוש במים וחלוקת המשאבים בין אברי הצמח.

בקורס מתרגלים התלמידים שימוש בשיטות מדידה ובשיטות ניתוח תוצאות המקובלות במחקר. תרגילי המעבדה כוללים בדיקת התגובה של צמחים למינרלי הזנה חיוניים, צורות שונות למדידת חילופי הגזים בצמחי יבשה וצמחי מים, קביעת הממדים של אברי הצמח בעזרת image analysis ושיטות כימיות לקביעת תכולת המינרלים.

 

- הנדסה גנטית בצמחים –  בעידן הפוסט-גנומי - פרופ' א. זילברשטיין

PLANT GENETIC ENGINEERING IN THE POST-GENOMIC ERA

 

הקורס יעסוק בהחדרת גנים לצמחים ושימוש בצמחים טרנסגניים בשירות הביוטכנולוגיה. צמחים טרנסגניים תופסים בהדרגה מקום חשוב כיצרנים של מזון משופר למאכל בני-אדם ובעלי-חיים, כאמצעים ליצור שמנים, פולימרים פלסטיים ואנזימים בתעשייה, כיצרני חלבונים – בהם נוגדנים ואנטיגנים וכספקים של מגוון נרחב של מטבוליטים משניים לשימוש תרופתי.

ידונו הגישות העכשוויות הבאות של הנדסה גנטית בצמחים ויישומן למטרות ביוטכנולוגיות ולהבנה של תהליכים מולקולריים:

       1.         גישות של  Proteomics  , Genomics ומשמעותם הביוטכנולוגית של  microarrays for gene discovery

       2.         החדרת גנים לגנומים הגרעיני והכלורופלסטי וויסות ביטויים

       3.         התאמת גנים זרים לביטוי אופטימלי בתאים צמחיים: שיפור CODON USAGE ,  מניעת   gene silencing ו-  RNA pre-termination

       4.         יהוי גנים ותפקידם ע"י התמרה באמצעות T-DNA וטרנספוזונים.

       5.         צמחים טרנסגניים בשירות הביוטכנולוגיה.

 

 -  גנטיקה מולקולרית וביוטכנולוגיה של צמחים – קורס מעבדה למתקדמים – פרופ' א. זילברשטיין, [מרכזת] ד"ר ע. אבני, ד"ר נ. אוהד, פרופ' ע. ברימן, פרופ' ה. פרום, ד"ר ע. שרון PLANT MOLECULAR GENETICS ADVANCED LABORATORY COURSE        

הקורס יכלול הרצאות ומעבדות קומפלימנטריות:

        ·          הגנומים הגרעיני, כלורופלסטי ומיטוכונדריאלי.

        ·          החדרת גנים לצמחים, סימנים סלקטיביים, פרומוטרים וגנים מדווחים.

        ·          גנטיקה מולקולרית של צמחים טרנסגנים.

        ·          שימוש במוטנטים - ככלי להבנת תהליכים בארבידופסיס בצמח דגם.

        ·          הנדסה גנטית של פטריות חוטיות.

        ·          הכוונת חלבונים לאברונים בתאי הצמח.

        ·          בקרת ביטוי של פרומוטורים.

 

 

 - אינטראקציות צמח-פתוגן - ד"ר ע. שרון, ד"ר ג. ססה

PLANT-PATHOGEN INTERACTIONS

   ·   מחלות צמחים: הגדרה; גורמי מחלה; השפעה על הצמח; משמעות כלכלית; הנדסה גנטית בשירות הפיטופתולוגיה.

   ·   מערכת החיסון הצמחית: הגנה  פאסיבית,  הגנה פעילה, חומרי הגנה, הפעלת מערכת ההגנה הפעילה, מולקולות , פעילות, מסלולי העברת סיגנל, מנגנון גן מול גן, מאפיינים  מולקולריים וביוכימיים של גנים לעמידות,  יישומים ביוטכנולוגיים.

   ·   מחלות בקטריאליות – סימפטומים, מנגנוני הדבקה, גורמי וירולנטיות, מערכות הפרשה III Type  , הכוונה של חלבונים בקטריאליים שמופרשים לתוך תאי הצמח.

   ·   מחלות ויראליות ואגרובקטריות – הכרת  הוירוסים העיקריים הפוגעים בצמחים והמחלות שהם גורמים, הכרת המבנה המולקולרי של וירוסי צמחים ודרך התרבותם, הבסיס המולקולרי לתנועתם של וירוסים בצמחים ומנגנונים מולקולריים הקשורים בפתוגניות שלהם, ייצור צמחים טרנסגניים עם עמידות כנגד וירוסים.

   ·   פטריות פתוגניות – מנגנוני חדירה והתבססות AVR genes , בקרה של מסלולי העברת אותות, הדברה ביולוגית, הקניית עמידות באמצעות הנדסה גנטית.

 

מספר  התלמידים  מוגבל.

 

   - מעבדה בפיסיולוגיה של הצמח PLANT PHYSIOLOGY – LABORATORY                  

מעבדה בפיזיולוגיה של הצמח תשלים ותוסיף להבנה של החומר הנלמד בקורס החובה. המעבדה פתוחה רק לסטודנטים שלומדים במקביל קורס חובה בפיזיולוגיה של הצמח.

 

בראשית כל מעבדה ייערך בוחן קצר. לכל מעבדה יגיש התלמיד דו"ח מסכם.

 

המעבדה תכלול את הנושאים הבאים:

·        ריאקצית היל-מעבר אלקטרון פוטוסינתטי בממברנות התילקואידים .

·        מדידת שיעורי פוטוסינתזה.

·        צמיחה מושרית ע"י הורמון

·        רגולציה של פעילות העמילאז בזרעי שעורה נובטים.

·        זיהוי האנזים עמילאז ע"י הפרדה באלקטרופוריזה בג'ל פוליאקרילאמיד (SDS-PAGE)   והגבה עם נוגדן.

 

_{הרכב הציון הסופי:}

_{בחנים                                     15%}

_{דו"חות מעבדה                     35%}

_{הערכת מדריך                      50%}

 

ציון המעבדה יצורף לציון קורס החובה.

 

בחינה סופית של קורס חובה       70%

ציון מעבדה                               30%

 

 

 

 פיטוגיאוגרפיה  -  ד"ר מ. אגמי

Phytogeography

-----------------------------------------------

 

 - מבנה ופעילות שורשים של צמחים - קורס וירטואלי - פרופ' ע. אשל

STRUCTURE AND FUNCTION OF PLANT ROOTS - A VIRTUAL COURSE

לא יתקיים בתשס"ד

הקורס יעסוק בנושאים הבאים:

   ·   גורמים הקובעים את המבנה של שורשים ומערכות שורשים

   ·   שיקולים אקולוגיים ופיסיולוגיים לגבי עלות ותועלת של מערכות השורשים

   ·   התהליכים הפיסיולוגיים המתבצעים בשורשים

   ·   יחסים בין השורשים לגוף הצמח

   ·   יחסים בין שורשים לסביבתם

 

תוך כדי הלימוד בקורס ירכשו התלמידים ניסיון בשימוש ברשת האינטרנט וילמדו לכתוב דפי רשת. בקורס לא תהינה פגישות בחדרי לימוד או מעבדות [פרט למפגש פתיחה ומפגש סיום].

חומר הלימוד, מטלות ההוראה והשתתפות התלמידים ייעשו ברשת האינטרנט באמצעות דואר אלקטרוני, קבוצת דיון ודפי רשת. לכל תלמיד המשתתף בקורס צריכה להיות אפשרות להשתמש ברשת האינטרנט.

הלימוד יתבסס על לימוד עצמי של חומר מהספרות המדעית באנגלית.

כל תלמיד יידרש להכין במסגרת  הקורס עבודת גמר אשר תוצג כדף רשת באתר הקורס. לשם כך, תינתן הדרכה בהכנת דפי רשת בשפת HTML.

הציון ייקבע עפ"י  השתתפות בדיונים ועבודת גמר. 

 

קורסים לתואר שני ושלישי

 

 - ארגון ותפקוד של הצמח העילאי – פרופ' ר. אלוני, ד"ר י. לפקין

STRUCTURE AND FUNCTION OF PLANTS

דרך ההוראה:                        ש'

מס' שעות:                 2 ש"ס

סמסטר:                    ב'

תכנית הקורס:

הקורס יעסוק בקשר שבין המבנה המרחבי של הצמח לבין תפקידיו.  מדי שנה יתמקד הקורס באיבר מסויים של הצמח (עלה, מריסטמות, רבייה רפרודוקטיבית) . יודגשו: הרכב אוכלוסיות התאים ומבנן ; פעילותה של כל קבוצת תאים ; אינטראקציות פיסיקליות וכימיות בין תאים שונים , בין רקמות שונות ובין איברים שונים ; תגובות לגירויים שונים של הסביבה; התארגנות יחידות המשנה במבנה של הצמח השלם.

 

 - בטיחות  - פרופ' י. ויזל (מרכז)

SAFETY IN THE LABORATY

דרך ההוראה:                        ש'

מס' שעות:                 1 ש"ס

סמסטר:                    א' [מרוכז]

תכנית הקורס:

מושגים ועקרונות בבטיחות, בטיחות בשימוש ברדיואיזוטופים, סיכונים ביולוגיים, חומרים מסוכנים, גלילי גז, היבטי בטיחות, סילוק פסולת, ארגון תחנת עבודה,  כיבוי אש.

הקורס יינתן במרוכז בתחילת שנה"ל.

 

 - כתיבה מדעית (לדוקטורנטים) באנגלית

WRITING SCIENTIFIC PAPERS (IN ENGLISH)

מורים:                        יפורסם

דרך ההוראה:                        ש'

מס' שעות:                 3 ש"ס

סמסטר:                    א'

תכנית הקורס:

The course aims to help scientists to improve their scientific writing with a view  to publication.

Basic guidelines on writing scientific papers will be discussed, with consideration to both the skills of planning and organizing a paper and the use of appropriate English style and language.  The course will have two major components: a series of lectures/workshops, with practical exercises to illustrate the effective (and ineffective!) use of English in scientific publications; a six week project at the end of which the participants will have produced a simple research paper. The ultimate aim is to explore the production of scientific papers that will be both accepted for publication and understood by their target audience.

 

 - גנטיקה מולקולרית של יחסי צמח-פרזיט - ד"ר ע. אבני, פרופ' י. ברש, ד"ר ע. שרון

 THE MOLECULAR GENETIC BASIS FOR PLANT MICROBE INTERACTION

דרך ההוראה:                        ש'

מס' שעות:                 3 ש"ס (אחת לשנתיים)

סמסטר:                    ב'

תכנית הקורס:

   ·   גנטיקה מולקולרית של האינטראקציה בין פטריות פתוגניות וצמחים

יושם דגש על ניתוח הארועים ברמה המולקולרית בשלבים השונים:

                           ·   גנים הקובעים הכרה,דחיה

                           ·   מנגנוני חדירה פיסיים ואנזימטיים

                           ·   גנים ומולקולות המסייעים להתבססות הפתוגן בצמח
(טוקסינים - גנים ייחודיים - הולכת אותות)

                           ·   אבולוציה מולקולרית של גזעים פתוגניים

 

   ·   תיפקוד ובקרה של גנים ביחסי גומלין שבין חיידקים פתוגניים וצמחים:

   ·   מנגנוני התקפה (גנים בקטריאליים):

                           ·   גנים להישרדות ורביה על פני הצמח (epiphytic fitness)

                           ·   גנים להיכרות ותחום פונדקאים (recognition and host range)

                           ·   גנים להתרבות בתוך הצמח (basic compatibility)

                           ·   גנים ליצירת סימפטומים המקודדים לאנזימים, טוקסינים והורמונים

   ·   מנגנוני הגנה (גנים צמחיים):

                           ·   גנים להיכרות ועמידות (recognition and resistance)

                           ·   עמידות מקומית (local resistance)

                           ·   עמידות סיסטמית (systemic resistance)

 

   ·   דרישות מוקדמות 

            ·   מבוא לפיטופתולוגיה או פתוגניות וסמביוזה ביחסי גומלין בין צמחים וחיידקים.

 

 

 - מבנה ותפקוד של צמחים – פרופ' ר. אלוני

PLANT STRUCTURE AND FUNCTION

דרך ההוראה:                        ש"ס

מס' שעות:                 2 ש"ס

סמסטר:                    א'

תכנית הקורס:

הקורס יידון במגוון נושאים של בקרה על היווצרות מבנה ותפקוד בצמחים.

 

 - נושאים נבחרים בתקשורת בין תאית בצמחים  - פרופ' ב. אפל

CURRENT TOPICS IN PLANT CELL TO CELL COMMUNICATION

דרך ההוראה:                        ס'

מס' שעות:                 2 ש"ס

                                    שנתי

 

תכנית הקורס:                      

יינתן אחת לשבועיים.  נושאים נבחרים מהספרות.

 

 - סמינריון  לתלמידי מחקר במדעי הצמח

REASEARCH STUDENTS' SEMINAR IN PLANT SCIENCES

דרך ההוראה:                        ס'

מס' שעות:                 2 ש"ס

                                    שנתי

תכנית הקורס:                      

יידונו נושאים עכשוויים במדעי הצמח.  ינותחו מאמרים עדכניים בתחום זה ויתקיים דיון מעמיק בעבודות המחקר של התלמידים.